MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014501	TCT	2	6	143996	144001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_014501	CTAC	2	8	144008	144015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_014501	TAA	2	6	144020	144025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014501	TTTC	2	8	144043	144050	0 %	75 %	0 %	25 %	307150072
3005	NC_014501	TGG	2	6	144121	144126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150072
3006	NC_014501	ATT	3	9	144169	144177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150072
3007	NC_014501	AATG	2	8	144190	144197	50 %	25 %	25 %	0 %	307150072
3008	NC_014501	ATT	2	6	144268	144273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150072
3009	NC_014501	GGT	2	6	144280	144285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150072
3010	NC_014501	ATT	2	6	144391	144396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150072
3011	NC_014501	CAA	2	6	144427	144432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150072
3012	NC_014501	GTGGG	2	10	144449	144458	0 %	20 %	80 %	0 %	307150072
3013	NC_014501	CAA	2	6	144478	144483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150072
3014	NC_014501	TTC	2	6	144542	144547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150072
3015	NC_014501	TTA	2	6	144628	144633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150072
3016	NC_014501	A	6	6	144676	144681	100 %	0 %	0 %	0 %	307150072
3017	NC_014501	T	6	6	144714	144719	0 %	100 %	0 %	0 %	307150072
3018	NC_014501	TTAAT	2	10	144773	144782	40 %	60 %	0 %	0 %	307150072
3019	NC_014501	GCC	2	6	144794	144799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150072
3020	NC_014501	ACT	2	6	144808	144813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150072
3021	NC_014501	TA	3	6	144829	144834	50 %	50 %	0 %	0 %	307150072
3022	NC_014501	TTAT	2	8	144842	144849	25 %	75 %	0 %	0 %	307150072
3023	NC_014501	GGTT	2	8	144859	144866	0 %	50 %	50 %	0 %	307150072
3024	NC_014501	A	6	6	144887	144892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014501	ATT	2	6	144903	144908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014501	AGT	2	6	144963	144968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150073
3027	NC_014501	T	6	6	144974	144979	0 %	100 %	0 %	0 %	307150073
3028	NC_014501	CTCA	2	8	144980	144987	25 %	25 %	0 %	50 %	307150073
3029	NC_014501	TA	3	6	145051	145056	50 %	50 %	0 %	0 %	307150073
3030	NC_014501	TAG	2	6	145133	145138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150073
3031	NC_014501	A	6	6	145150	145155	100 %	0 %	0 %	0 %	307150073
3032	NC_014501	T	6	6	145206	145211	0 %	100 %	0 %	0 %	307150074
3033	NC_014501	CTT	2	6	145246	145251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150074
3034	NC_014501	CTT	2	6	145267	145272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150074
3035	NC_014501	GAC	2	6	145273	145278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150074
3036	NC_014501	ACC	2	6	145476	145481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150074
3037	NC_014501	TTAA	2	8	145572	145579	50 %	50 %	0 %	0 %	307150074
3038	NC_014501	ACT	2	6	145602	145607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150074
3039	NC_014501	AAAT	2	8	145616	145623	75 %	25 %	0 %	0 %	307150074
3040	NC_014501	GTTTCT	2	12	145626	145637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	307150074
3041	NC_014501	TCC	2	6	145673	145678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150074
3042	NC_014501	CCA	2	6	145810	145815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150074
3043	NC_014501	AGG	2	6	145835	145840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150074
3044	NC_014501	CAAA	2	8	145876	145883	75 %	0 %	0 %	25 %	307150074
3045	NC_014501	CTT	2	6	145894	145899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150074
3046	NC_014501	T	6	6	145933	145938	0 %	100 %	0 %	0 %	307150074
3047	NC_014501	GCA	2	6	145951	145956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150074
3048	NC_014501	CGG	5	15	145972	145986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150074
3049	NC_014501	GGGCAT	2	12	146095	146106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307150074
3050	NC_014501	AAGT	2	8	146150	146157	50 %	25 %	25 %	0 %	307150074
3051	NC_014501	CTT	2	6	146206	146211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014501	A	6	6	146307	146312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014501	TTA	2	6	146486	146491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150075
3054	NC_014501	TA	3	6	146519	146524	50 %	50 %	0 %	0 %	307150075
3055	NC_014501	GAT	2	6	146525	146530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150075
3056	NC_014501	TGG	2	6	146549	146554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150075
3057	NC_014501	T	6	6	146569	146574	0 %	100 %	0 %	0 %	307150075
3058	NC_014501	TGA	2	6	146617	146622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150075
3059	NC_014501	CAA	2	6	146669	146674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150075
3060	NC_014501	CCG	2	6	146697	146702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150075
3061	NC_014501	CTC	2	6	146769	146774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150075
3062	NC_014501	GCG	2	6	146870	146875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150075
3063	NC_014501	CAA	2	6	146933	146938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150075
3064	NC_014501	CAA	2	6	146945	146950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150075
3065	NC_014501	TC	3	6	146979	146984	0 %	50 %	0 %	50 %	307150075
3066	NC_014501	AAG	2	6	147072	147077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150075
3067	NC_014501	AAT	2	6	147140	147145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150075
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3069	NC_014501	TTTG	2	8	147403	147410	0 %	75 %	25 %	0 %	307150075
3070	NC_014501	CAA	2	6	147533	147538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150075
3071	NC_014501	AGG	2	6	147567	147572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150075
3072	NC_014501	CCA	2	6	147747	147752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_014501	GAT	2	6	147755	147760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014501	CCT	2	6	147763	147768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_014501	GCAGT	2	10	147771	147780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3076	NC_014501	AGA	2	6	147855	147860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014501	GATA	2	8	147941	147948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014501	GCA	2	6	148013	148018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_014501	GTAG	2	8	148030	148037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014501	CAA	2	6	148082	148087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014501	CGT	2	6	148090	148095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014501	CCA	2	6	148099	148104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_014501	ATT	3	9	148142	148150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150076
3084	NC_014501	TTG	2	6	148173	148178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150076
3085	NC_014501	GCA	2	6	148190	148195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150076
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3087	NC_014501	TGG	2	6	148259	148264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150076
3088	NC_014501	TTG	2	6	148283	148288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150076
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3090	NC_014501	TATCC	2	10	148321	148330	20 %	40 %	0 %	40 %	307150076
3091	NC_014501	TTC	2	6	148409	148414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150076
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3093	NC_014501	ATT	2	6	148433	148438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150076
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3095	NC_014501	AAG	2	6	148595	148600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150076
3096	NC_014501	TCA	2	6	148635	148640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150076
3097	NC_014501	TGA	2	6	148650	148655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150076
3098	NC_014501	ATC	2	6	148728	148733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_014501	TAA	2	6	148766	148771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014501	ACC	2	6	148866	148871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_014501	ATCA	2	8	148875	148882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_014501	TTTA	2	8	148893	148900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014501	CTA	2	6	148905	148910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_014501	A	6	6	148928	148933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014501	T	6	6	149044	149049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014501	TGTT	2	8	149115	149122	0 %	75 %	25 %	0 %	307150077
3107	NC_014501	A	6	6	149144	149149	100 %	0 %	0 %	0 %	307150077
3108	NC_014501	CAA	2	6	149150	149155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150077
3109	NC_014501	GAT	2	6	149168	149173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150077
3110	NC_014501	TAA	2	6	149200	149205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150077
3111	NC_014501	TGGA	2	8	149219	149226	25 %	25 %	50 %	0 %	307150077
3112	NC_014501	TAA	2	6	149227	149232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150077
3113	NC_014501	CAAG	2	8	149312	149319	50 %	0 %	25 %	25 %	307150077
3114	NC_014501	GCAA	2	8	149320	149327	50 %	0 %	25 %	25 %	307150077
3115	NC_014501	TCA	2	6	149345	149350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150077
3116	NC_014501	A	8	8	149375	149382	100 %	0 %	0 %	0 %	307150077
3117	NC_014501	GAAA	2	8	149391	149398	75 %	0 %	25 %	0 %	307150077
3118	NC_014501	ACA	2	6	149444	149449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150077
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3120	NC_014501	CT	3	6	149510	149515	0 %	50 %	0 %	50 %	307150077
3121	NC_014501	TTA	2	6	149574	149579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150077
3122	NC_014501	GTTC	2	8	149605	149612	0 %	50 %	25 %	25 %	307150077
3123	NC_014501	CTT	2	6	149679	149684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150077
3124	NC_014501	AGA	2	6	149765	149770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150077
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3126	NC_014501	TCT	2	6	149792	149797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150077
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3370	NC_014501	C	7	7	161560	161566	0 %	0 %	0 %	100 %	307150087
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3372	NC_014501	CT	4	8	161666	161673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3373	NC_014501	CTTT	2	8	161691	161698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3374	NC_014501	TAAT	2	8	161729	161736	50 %	50 %	0 %	0 %	307150088
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3494	NC_014501	A	7	7	167135	167141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_014501	GCA	2	6	167286	167291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150092
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