MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014501	ACC	2	6	47492	47497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149984
1002	NC_014501	ATT	2	6	47546	47551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149984
1003	NC_014501	TTG	2	6	47569	47574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149984
1004	NC_014501	CGT	2	6	47664	47669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149984
1005	NC_014501	TGA	2	6	47750	47755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149984
1006	NC_014501	TTCT	2	8	47760	47767	0 %	75 %	0 %	25 %	307149984
1007	NC_014501	TCC	2	6	47810	47815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149984
1008	NC_014501	TTA	2	6	47857	47862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149984
1009	NC_014501	CAA	2	6	47910	47915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149984
1010	NC_014501	CAA	2	6	47969	47974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149984
1011	NC_014501	TAA	2	6	48011	48016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149984
1012	NC_014501	CAG	2	6	48037	48042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149984
1013	NC_014501	ATG	2	6	48049	48054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149984
1014	NC_014501	GACC	2	8	48167	48174	25 %	0 %	25 %	50 %	307149984
1015	NC_014501	ACA	2	6	48197	48202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149984
1016	NC_014501	CA	3	6	48392	48397	50 %	0 %	0 %	50 %	307149984
1017	NC_014501	CGG	2	6	48447	48452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149984
1018	NC_014501	TAT	2	6	48509	48514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149984
1019	NC_014501	AAC	2	6	48530	48535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149984
1020	NC_014501	ATA	2	6	48598	48603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149984
1021	NC_014501	GAT	2	6	48651	48656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149984
1022	NC_014501	AATT	2	8	48677	48684	50 %	50 %	0 %	0 %	307149984
1023	NC_014501	TTG	2	6	48711	48716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149984
1024	NC_014501	GGC	2	6	48718	48723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149984
1025	NC_014501	AGC	2	6	48768	48773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014501	ACA	2	6	48969	48974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149986
1027	NC_014501	GAT	2	6	49048	49053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149986
1028	NC_014501	T	6	6	49084	49089	0 %	100 %	0 %	0 %	307149986
1029	NC_014501	ACA	2	6	49218	49223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149986
1030	NC_014501	GCG	2	6	49242	49247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149986
1031	NC_014501	AATC	2	8	49252	49259	50 %	25 %	0 %	25 %	307149986
1032	NC_014501	GTTG	2	8	49302	49309	0 %	50 %	50 %	0 %	307149986
1033	NC_014501	TG	3	6	49308	49313	0 %	50 %	50 %	0 %	307149986
1034	NC_014501	AAT	2	6	49343	49348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149986
1035	NC_014501	AAAT	2	8	49358	49365	75 %	25 %	0 %	0 %	307149986
1036	NC_014501	GAG	2	6	49378	49383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149986
1037	NC_014501	CTC	2	6	49432	49437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149986
1038	NC_014501	CGG	2	6	49441	49446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149986
1039	NC_014501	T	6	6	49482	49487	0 %	100 %	0 %	0 %	307149986
1040	NC_014501	TTC	2	6	49490	49495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149986
1041	NC_014501	TTTC	2	8	49509	49516	0 %	75 %	0 %	25 %	307149986
1042	NC_014501	CTA	2	6	49570	49575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149986
1043	NC_014501	AC	3	6	49622	49627	50 %	0 %	0 %	50 %	307149986
1044	NC_014501	GAT	2	6	49699	49704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149986
1045	NC_014501	A	6	6	49707	49712	100 %	0 %	0 %	0 %	307149986
1046	NC_014501	TCA	2	6	49884	49889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149986
1047	NC_014501	CAAA	2	8	49946	49953	75 %	0 %	0 %	25 %	307149986
1048	NC_014501	ATG	2	6	50014	50019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014501	CCA	2	6	50075	50080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_014501	ATA	2	6	50185	50190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149987
1051	NC_014501	TTA	2	6	50263	50268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149987
1052	NC_014501	CTGC	2	8	50269	50276	0 %	25 %	25 %	50 %	307149987
1053	NC_014501	C	7	7	50276	50282	0 %	0 %	0 %	100 %	307149987
1054	NC_014501	TAAAA	2	10	50409	50418	80 %	20 %	0 %	0 %	307149987
1055	NC_014501	TGA	2	6	50479	50484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149987
1056	NC_014501	TAT	2	6	50522	50527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149987
1057	NC_014501	TTC	2	6	50643	50648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149987
1058	NC_014501	GATT	2	8	50674	50681	25 %	50 %	25 %	0 %	307149987
1059	NC_014501	TCT	2	6	50695	50700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149987
1060	NC_014501	A	6	6	50736	50741	100 %	0 %	0 %	0 %	307149987
1061	NC_014501	AAT	2	6	50790	50795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149987
1062	NC_014501	T	7	7	50812	50818	0 %	100 %	0 %	0 %	307149987
1063	NC_014501	TAA	2	6	50820	50825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149987
1064	NC_014501	CGAG	2	8	50865	50872	25 %	0 %	50 %	25 %	307149987
1065	NC_014501	CAT	2	6	50885	50890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149987
1066	NC_014501	CA	3	6	50951	50956	50 %	0 %	0 %	50 %	307149987
1067	NC_014501	ATTA	2	8	50964	50971	50 %	50 %	0 %	0 %	307149987
1068	NC_014501	T	6	6	51024	51029	0 %	100 %	0 %	0 %	307149987
1069	NC_014501	AAT	2	6	51042	51047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149987
1070	NC_014501	ATCA	2	8	51162	51169	50 %	25 %	0 %	25 %	307149987
1071	NC_014501	AAT	2	6	51215	51220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149987
1072	NC_014501	GCC	2	6	51292	51297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149987
1073	NC_014501	TTG	2	6	51315	51320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149987
1074	NC_014501	ATCT	2	8	51337	51344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_014501	TCA	2	6	51348	51353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014501	GCG	2	6	51360	51365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149988
1077	NC_014501	CCA	2	6	51379	51384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149988
1078	NC_014501	ACG	2	6	51393	51398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149988
1079	NC_014501	GCC	2	6	51435	51440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149988
1080	NC_014501	CGACCA	2	12	51520	51531	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	307149988
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1084	NC_014501	AGGA	2	8	51689	51696	50 %	0 %	50 %	0 %	307149988
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1088	NC_014501	AT	3	6	51816	51821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014501	TATC	2	8	51829	51836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_014501	TAATT	2	10	51863	51872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014501	TAG	2	6	51880	51885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014501	CCA	2	6	51909	51914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149989
1093	NC_014501	ACCGCC	2	12	51941	51952	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307149989
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1097	NC_014501	TCG	2	6	52174	52179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149989
1098	NC_014501	TA	3	6	52201	52206	50 %	50 %	0 %	0 %	307149989
1099	NC_014501	AGGA	2	8	52222	52229	50 %	0 %	50 %	0 %	307149989
1100	NC_014501	TAA	2	6	52250	52255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149989
1101	NC_014501	TAAA	2	8	52321	52328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014501	T	7	7	52329	52335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014501	ATC	2	6	52370	52375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_014501	TAC	2	6	52390	52395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014501	T	6	6	52397	52402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014501	T	6	6	52408	52413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014501	GAG	2	6	52433	52438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014501	TAG	3	9	52553	52561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149990
1109	NC_014501	TGG	2	6	52613	52618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149990
1110	NC_014501	AACTC	2	10	52662	52671	40 %	20 %	0 %	40 %	307149990
1111	NC_014501	AAG	2	6	52739	52744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149990
1112	NC_014501	ATT	2	6	52750	52755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149990
1113	NC_014501	TGC	2	6	52761	52766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149990
1114	NC_014501	TTG	2	6	52790	52795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149990
1115	NC_014501	GGC	2	6	52843	52848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149990
1116	NC_014501	GTT	2	6	53170	53175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149990
1117	NC_014501	TTG	2	6	53222	53227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149990
1118	NC_014501	ATT	2	6	53251	53256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149990
1119	NC_014501	AATT	2	8	53270	53277	50 %	50 %	0 %	0 %	307149990
1120	NC_014501	ATT	3	9	53317	53325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149990
1121	NC_014501	TAA	2	6	53341	53346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014501	ATA	2	6	53347	53352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014501	GA	3	6	53370	53375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014501	AGG	2	6	53409	53414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149991
1125	NC_014501	G	6	6	53570	53575	0 %	0 %	100 %	0 %	307149991
1126	NC_014501	G	6	6	53612	53617	0 %	0 %	100 %	0 %	307149991
1127	NC_014501	GAA	2	6	53677	53682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149991
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1383	NC_014501	ATCAT	2	10	66331	66340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1384	NC_014501	TTAT	2	8	66399	66406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_014501	GCC	2	6	66408	66413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1386	NC_014501	ATA	2	6	66429	66434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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