MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014501	AAGAC	2	10	260962	260971	60 %	0 %	20 %	20 %	307150175
5502	NC_014501	ATT	2	6	261032	261037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150175
5503	NC_014501	A	6	6	261038	261043	100 %	0 %	0 %	0 %	307150175
5504	NC_014501	TTC	2	6	261154	261159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150175
5505	NC_014501	AGA	3	9	261173	261181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150175
5506	NC_014501	AAG	2	6	261216	261221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150175
5507	NC_014501	T	6	6	261265	261270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_014501	TCT	2	6	261334	261339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_014501	TTC	2	6	261357	261362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_014501	TCA	2	6	261415	261420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_014501	TAA	2	6	261435	261440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014501	T	8	8	261460	261467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014501	ATA	2	6	261493	261498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_014501	CGGCT	2	10	261607	261616	0 %	20 %	40 %	40 %	307150176
5515	NC_014501	GTC	2	6	261633	261638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150176
5516	NC_014501	GTG	2	6	261732	261737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150176
5517	NC_014501	ATT	2	6	261782	261787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150176
5518	NC_014501	AAG	2	6	261813	261818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150176
5519	NC_014501	A	6	6	261879	261884	100 %	0 %	0 %	0 %	307150176
5520	NC_014501	TG	3	6	261929	261934	0 %	50 %	50 %	0 %	307150176
5521	NC_014501	GAA	2	6	261953	261958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150176
5522	NC_014501	CGTTGG	2	12	262032	262043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307150176
5523	NC_014501	GTC	2	6	262073	262078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150176
5524	NC_014501	TGG	2	6	262124	262129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150176
5525	NC_014501	ATG	2	6	262135	262140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150176
5526	NC_014501	GAACA	2	10	262145	262154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5527	NC_014501	CGG	2	6	262169	262174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_014501	AG	3	6	262277	262282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014501	GCA	2	6	262324	262329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150177
5530	NC_014501	AAC	2	6	262401	262406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150177
5531	NC_014501	CGG	2	6	262427	262432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150177
5532	NC_014501	AGAAAT	2	12	262533	262544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	307150177
5533	NC_014501	CGT	2	6	262581	262586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150177
5534	NC_014501	CAA	2	6	262612	262617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150177
5535	NC_014501	GAA	2	6	262711	262716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150177
5536	NC_014501	AAG	2	6	262757	262762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150177
5537	NC_014501	TGT	2	6	262773	262778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150177
5538	NC_014501	TTG	2	6	262781	262786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150177
5539	NC_014501	TC	4	8	262830	262837	0 %	50 %	0 %	50 %	307150177
5540	NC_014501	AAT	2	6	262939	262944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150177
5541	NC_014501	G	6	6	263001	263006	0 %	0 %	100 %	0 %	307150177
5542	NC_014501	CTG	2	6	263057	263062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150177
5543	NC_014501	AATT	2	8	263069	263076	50 %	50 %	0 %	0 %	307150177
5544	NC_014501	GCC	2	6	263098	263103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150177
5545	NC_014501	AAT	2	6	263119	263124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150177
5546	NC_014501	GTG	2	6	263161	263166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150177
5547	NC_014501	TTA	2	6	263240	263245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150177
5548	NC_014501	A	6	6	263248	263253	100 %	0 %	0 %	0 %	307150177
5549	NC_014501	AAT	2	6	263343	263348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_014501	T	7	7	263373	263379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014501	A	7	7	263467	263473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014501	TTG	2	6	263476	263481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_014501	TAA	2	6	263493	263498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_014501	AG	3	6	263514	263519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014501	GA	3	6	263531	263536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014501	CCT	2	6	263550	263555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150178
5557	NC_014501	CTC	2	6	263608	263613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150178
5558	NC_014501	ATC	2	6	263659	263664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150178
5559	NC_014501	GCG	2	6	263701	263706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150178
5560	NC_014501	TCA	2	6	263810	263815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150178
5561	NC_014501	CAT	2	6	263829	263834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150178
5562	NC_014501	TAA	2	6	263858	263863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150178
5563	NC_014501	AAG	2	6	263920	263925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150178
5564	NC_014501	AATT	2	8	263932	263939	50 %	50 %	0 %	0 %	307150178
5565	NC_014501	GGATG	2	10	263983	263992	20 %	20 %	60 %	0 %	307150178
5566	NC_014501	GTT	2	6	264119	264124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_014501	TCA	2	6	264186	264191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150179
5568	NC_014501	TTC	2	6	264253	264258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150179
5569	NC_014501	CCA	2	6	264315	264320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150179
5570	NC_014501	A	6	6	264320	264325	100 %	0 %	0 %	0 %	307150179
5571	NC_014501	TAAC	2	8	264339	264346	50 %	25 %	0 %	25 %	307150179
5572	NC_014501	ATACC	2	10	264367	264376	40 %	20 %	0 %	40 %	307150179
5573	NC_014501	CGG	2	6	264393	264398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150179
5574	NC_014501	T	6	6	264505	264510	0 %	100 %	0 %	0 %	307150179
5575	NC_014501	TAA	2	6	264588	264593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_014501	GTT	2	6	264646	264651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_014501	GA	3	6	264736	264741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_014501	T	6	6	264754	264759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_014501	AAAT	2	8	264764	264771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014501	TTAA	2	8	264865	264872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_014501	TGA	2	6	264880	264885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150180
5582	NC_014501	ATG	2	6	265003	265008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150180
5583	NC_014501	ACA	2	6	265055	265060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150180
5584	NC_014501	TAT	2	6	265180	265185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150180
5585	NC_014501	GCC	2	6	265197	265202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150180
5586	NC_014501	GACAA	2	10	265213	265222	60 %	0 %	20 %	20 %	307150180
5587	NC_014501	GAC	2	6	265257	265262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150180
5588	NC_014501	CTTT	2	8	265299	265306	0 %	75 %	0 %	25 %	307150180
5589	NC_014501	GCAA	2	8	265352	265359	50 %	0 %	25 %	25 %	307150180
5590	NC_014501	GCTAG	2	10	265433	265442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5591	NC_014501	CAT	2	6	265454	265459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_014501	AGAT	2	8	265461	265468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_014501	ATTC	2	8	265474	265481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_014501	ACGA	2	8	265546	265553	50 %	0 %	25 %	25 %	307150181
5595	NC_014501	AT	3	6	265602	265607	50 %	50 %	0 %	0 %	307150181
5596	NC_014501	TCT	2	6	265636	265641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150181
5597	NC_014501	AGAT	2	8	265644	265651	50 %	25 %	25 %	0 %	307150181
5598	NC_014501	AAT	2	6	265661	265666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150181
5599	NC_014501	CAT	2	6	265672	265677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150181
5600	NC_014501	GAT	2	6	265730	265735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150181
5601	NC_014501	ATT	2	6	265822	265827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150181
5602	NC_014501	ATATTT	2	12	265905	265916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150181
5603	NC_014501	AAC	2	6	265995	266000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150181
5604	NC_014501	AACA	2	8	266022	266029	75 %	0 %	0 %	25 %	307150181
5605	NC_014501	A	6	6	266121	266126	100 %	0 %	0 %	0 %	307150181
5606	NC_014501	TTCA	2	8	266231	266238	25 %	50 %	0 %	25 %	307150181
5607	NC_014501	A	6	6	266267	266272	100 %	0 %	0 %	0 %	307150181
5608	NC_014501	AGA	2	6	266314	266319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150181
5609	NC_014501	TTA	2	6	266342	266347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150181
5610	NC_014501	CCG	2	6	266376	266381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150181
5611	NC_014501	GAA	2	6	266435	266440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150181
5612	NC_014501	AAG	2	6	266445	266450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150181
5613	NC_014501	CAA	2	6	266488	266493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150181
5614	NC_014501	ATCAA	2	10	266547	266556	60 %	20 %	0 %	20 %	307150181
5615	NC_014501	ATG	2	6	266622	266627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150181
5616	NC_014501	ATT	2	6	266648	266653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150181
5617	NC_014501	AGA	2	6	266665	266670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150181
5618	NC_014501	AAAC	2	8	266685	266692	75 %	0 %	0 %	25 %	307150181
5619	NC_014501	TAT	2	6	266823	266828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150181
5620	NC_014501	TGGA	2	8	266939	266946	25 %	25 %	50 %	0 %	307150181
5621	NC_014501	TA	3	6	266951	266956	50 %	50 %	0 %	0 %	307150181
5622	NC_014501	GAT	2	6	266993	266998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150181
5623	NC_014501	G	6	6	267008	267013	0 %	0 %	100 %	0 %	307150181
5624	NC_014501	T	6	6	267029	267034	0 %	100 %	0 %	0 %	307150181
5625	NC_014501	TAAA	2	8	267111	267118	75 %	25 %	0 %	0 %	307150181
5626	NC_014501	CAAT	2	8	267187	267194	50 %	25 %	0 %	25 %	307150181
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