MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014501	CTT	2	6	237320	237325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150156
5002	NC_014501	TAA	2	6	237378	237383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150156
5003	NC_014501	TCA	2	6	237427	237432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150156
5004	NC_014501	CAT	2	6	237534	237539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150156
5005	NC_014501	GGC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150156
5006	NC_014501	TCT	2	6	237595	237600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150156
5007	NC_014501	TTG	2	6	237642	237647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150156
5008	NC_014501	GGC	2	6	237684	237689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150156
5009	NC_014501	AC	3	6	237882	237887	50 %	0 %	0 %	50 %	307150156
5010	NC_014501	ATAACA	2	12	237969	237980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5011	NC_014501	TTA	2	6	237988	237993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014501	ATT	2	6	238015	238020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014501	TTG	2	6	238044	238049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014501	TGA	2	6	238259	238264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150157
5015	NC_014501	CAG	2	6	238267	238272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150157
5016	NC_014501	AGA	2	6	238296	238301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150157
5017	NC_014501	CAGC	2	8	238338	238345	25 %	0 %	25 %	50 %	307150157
5018	NC_014501	TCA	2	6	238423	238428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150157
5019	NC_014501	CTG	2	6	238457	238462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150157
5020	NC_014501	A	6	6	238513	238518	100 %	0 %	0 %	0 %	307150157
5021	NC_014501	GAA	2	6	238531	238536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150157
5022	NC_014501	GAC	2	6	238570	238575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150157
5023	NC_014501	CAA	2	6	238579	238584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150157
5024	NC_014501	GAGGT	2	10	238700	238709	20 %	20 %	60 %	0 %	307150157
5025	NC_014501	T	6	6	238789	238794	0 %	100 %	0 %	0 %	307150157
5026	NC_014501	AAG	2	6	238886	238891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150157
5027	NC_014501	TAAAAA	2	12	238911	238922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	307150157
5028	NC_014501	CAA	2	6	238929	238934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150157
5029	NC_014501	A	7	7	238939	238945	100 %	0 %	0 %	0 %	307150157
5030	NC_014501	TAA	2	6	238977	238982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150157
5031	NC_014501	A	7	7	239074	239080	100 %	0 %	0 %	0 %	307150157
5032	NC_014501	ATAA	2	8	239091	239098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014501	C	9	9	239103	239111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5034	NC_014501	AG	3	6	239155	239160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014501	T	6	6	239167	239172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014501	AAAAT	2	10	239227	239236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014501	CT	3	6	239417	239422	0 %	50 %	0 %	50 %	307150158
5038	NC_014501	TAT	2	6	239436	239441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150158
5039	NC_014501	A	6	6	239472	239477	100 %	0 %	0 %	0 %	307150158
5040	NC_014501	T	7	7	239503	239509	0 %	100 %	0 %	0 %	307150158
5041	NC_014501	CGG	2	6	239614	239619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150158
5042	NC_014501	CTTC	2	8	239676	239683	0 %	50 %	0 %	50 %	307150158
5043	NC_014501	CAA	2	6	239709	239714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150158
5044	NC_014501	GAG	2	6	239748	239753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150158
5045	NC_014501	CTGCT	2	10	239841	239850	0 %	40 %	20 %	40 %	307150158
5046	NC_014501	CAA	2	6	239856	239861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150158
5047	NC_014501	CCCTAG	2	12	239920	239931	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307150158
5048	NC_014501	AAT	2	6	239970	239975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150158
5049	NC_014501	AGA	2	6	240071	240076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150158
5050	NC_014501	ATT	2	6	240096	240101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150158
5051	NC_014501	TCT	2	6	240146	240151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150158
5052	NC_014501	GTC	2	6	240190	240195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150158
5053	NC_014501	GAA	2	6	240270	240275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150158
5054	NC_014501	GAA	2	6	240291	240296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150158
5055	NC_014501	GAC	2	6	240304	240309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150158
5056	NC_014501	AT	3	6	240380	240385	50 %	50 %	0 %	0 %	307150158
5057	NC_014501	TGAG	2	8	240427	240434	25 %	25 %	50 %	0 %	307150158
5058	NC_014501	GATTG	2	10	240579	240588	20 %	40 %	40 %	0 %	307150158
5059	NC_014501	A	6	6	240687	240692	100 %	0 %	0 %	0 %	307150158
5060	NC_014501	CA	3	6	240695	240700	50 %	0 %	0 %	50 %	307150158
5061	NC_014501	ACA	2	6	240752	240757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150158
5062	NC_014501	AGA	3	9	240845	240853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150158
5063	NC_014501	ACT	2	6	240876	240881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150158
5064	NC_014501	CAAT	2	8	240884	240891	50 %	25 %	0 %	25 %	307150158
5065	NC_014501	CGA	2	6	240906	240911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150158
5066	NC_014501	ATT	2	6	240949	240954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150158
5067	NC_014501	TGT	2	6	240989	240994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150158
5068	NC_014501	GGA	2	6	240998	241003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150158
5069	NC_014501	CCT	2	6	241004	241009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150158
5070	NC_014501	ATT	2	6	241017	241022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150158
5071	NC_014501	CTC	2	6	241033	241038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150158
5072	NC_014501	TCT	2	6	241111	241116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150158
5073	NC_014501	CAT	3	9	241143	241151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150158
5074	NC_014501	GAAA	2	8	241185	241192	75 %	0 %	25 %	0 %	307150158
5075	NC_014501	TGA	2	6	241217	241222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150158
5076	NC_014501	ATC	2	6	241246	241251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150158
5077	NC_014501	A	6	6	241252	241257	100 %	0 %	0 %	0 %	307150158
5078	NC_014501	A	7	7	241329	241335	100 %	0 %	0 %	0 %	307150158
5079	NC_014501	TTG	2	6	241336	241341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150158
5080	NC_014501	G	6	6	241349	241354	0 %	0 %	100 %	0 %	307150158
5081	NC_014501	A	6	6	241413	241418	100 %	0 %	0 %	0 %	307150158
5082	NC_014501	AAT	2	6	241466	241471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5083	NC_014501	A	7	7	241481	241487	100 %	0 %	0 %	0 %	307150159
5084	NC_014501	TTA	3	9	241495	241503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150159
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5087	NC_014501	AAT	2	6	241664	241669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5088	NC_014501	TCC	2	6	241670	241675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150159
5089	NC_014501	GCT	2	6	241683	241688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150159
5090	NC_014501	GTATCT	2	12	241692	241703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	307150159
5091	NC_014501	AAT	2	6	241715	241720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5092	NC_014501	CACT	2	8	241801	241808	25 %	25 %	0 %	50 %	307150159
5093	NC_014501	A	6	6	241814	241819	100 %	0 %	0 %	0 %	307150159
5094	NC_014501	CGG	2	6	241843	241848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150159
5095	NC_014501	TCTCT	2	10	241851	241860	0 %	60 %	0 %	40 %	307150159
5096	NC_014501	AT	3	6	241880	241885	50 %	50 %	0 %	0 %	307150159
5097	NC_014501	A	6	6	241893	241898	100 %	0 %	0 %	0 %	307150159
5098	NC_014501	TAA	2	6	241916	241921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5099	NC_014501	TAA	2	6	241938	241943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
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5103	NC_014501	TAA	2	6	242225	242230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
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5105	NC_014501	TAA	2	6	242260	242265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5106	NC_014501	GTTT	2	8	242272	242279	0 %	75 %	25 %	0 %	307150159
5107	NC_014501	CCA	2	6	242305	242310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150159
5108	NC_014501	ATC	2	6	242327	242332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150159
5109	NC_014501	A	6	6	242351	242356	100 %	0 %	0 %	0 %	307150159
5110	NC_014501	GAT	2	6	242359	242364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150159
5111	NC_014501	ATA	2	6	242382	242387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150159
5112	NC_014501	CAG	2	6	242443	242448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150159
5113	NC_014501	CAA	2	6	242453	242458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150159
5114	NC_014501	AAG	2	6	242532	242537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014501	ATTA	2	8	242568	242575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014501	CTA	2	6	242619	242624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_014501	C	8	8	242691	242698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5118	NC_014501	C	6	6	242701	242706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5119	NC_014501	TTA	2	6	242707	242712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014501	TGA	2	6	242738	242743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014501	ACA	2	6	242747	242752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014501	AG	3	6	242833	242838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014501	AGCA	2	8	242902	242909	50 %	0 %	25 %	25 %	307150160
5124	NC_014501	TGAGA	2	10	242926	242935	40 %	20 %	40 %	0 %	307150160
5125	NC_014501	TTC	2	6	242957	242962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150160
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5128	NC_014501	TTC	2	6	243482	243487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150160
5129	NC_014501	TAA	2	6	243563	243568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014501	AAC	2	6	243660	243665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_014501	A	7	7	243709	243715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_014501	T	6	6	243750	243755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5139	NC_014501	ATATA	2	10	243919	243928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5141	NC_014501	CAA	2	6	244025	244030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_014501	AGA	2	6	249750	249755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150166
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5251	NC_014501	AGA	2	6	249897	249902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150166
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5277	NC_014501	A	6	6	250984	250989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5369	NC_014501	T	6	6	255258	255263	0 %	100 %	0 %	0 %	307150171
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