MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 94496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014376	CCA	2	6	121442	121447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384549
2502	NC_014376	ATA	2	6	121454	121459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384549
2503	NC_014376	GAT	2	6	121518	121523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384549
2504	NC_014376	CATT	2	8	121608	121615	25 %	50 %	0 %	25 %	302384549
2505	NC_014376	CAAT	2	8	121746	121753	50 %	25 %	0 %	25 %	302384549
2506	NC_014376	TGGC	2	8	121773	121780	0 %	25 %	50 %	25 %	302384549
2507	NC_014376	GAA	2	6	121866	121871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384549
2508	NC_014376	GCCTTT	2	12	121899	121910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	302384549
2509	NC_014376	ATT	2	6	121922	121927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384549
2510	NC_014376	AGC	2	6	122000	122005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384549
2511	NC_014376	AAC	2	6	122011	122016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384549
2512	NC_014376	CAT	2	6	122109	122114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384549
2513	NC_014376	AATG	2	8	122191	122198	50 %	25 %	25 %	0 %	302384549
2514	NC_014376	CTG	2	6	122229	122234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384549
2515	NC_014376	T	6	6	122278	122283	0 %	100 %	0 %	0 %	302384549
2516	NC_014376	GAT	2	6	122374	122379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384549
2517	NC_014376	GGAA	2	8	122395	122402	50 %	0 %	50 %	0 %	302384549
2518	NC_014376	GATCTG	2	12	122455	122466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	302384549
2519	NC_014376	A	7	7	122489	122495	100 %	0 %	0 %	0 %	302384549
2520	NC_014376	TGT	2	6	122547	122552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384549
2521	NC_014376	AGA	2	6	122568	122573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384549
2522	NC_014376	GATC	2	8	122592	122599	25 %	25 %	25 %	25 %	302384549
2523	NC_014376	AAT	2	6	122712	122717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384549
2524	NC_014376	GGA	2	6	122721	122726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384549
2525	NC_014376	AAAG	2	8	122735	122742	75 %	0 %	25 %	0 %	302384549
2526	NC_014376	AGG	2	6	122780	122785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384550
2527	NC_014376	ATT	2	6	122841	122846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384550
2528	NC_014376	AGG	2	6	122863	122868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384550
2529	NC_014376	TTTA	2	8	122919	122926	25 %	75 %	0 %	0 %	302384550
2530	NC_014376	ATGA	2	8	122937	122944	50 %	25 %	25 %	0 %	302384550
2531	NC_014376	A	6	6	122968	122973	100 %	0 %	0 %	0 %	302384550
2532	NC_014376	ATC	2	6	123145	123150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384550
2533	NC_014376	CATC	3	12	123147	123158	25 %	25 %	0 %	50 %	302384550
2534	NC_014376	CGG	2	6	123188	123193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384550
2535	NC_014376	TGC	2	6	123215	123220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384550
2536	NC_014376	GCA	2	6	123228	123233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384550
2537	NC_014376	CATTC	2	10	123322	123331	20 %	40 %	0 %	40 %	302384550
2538	NC_014376	CAA	2	6	123334	123339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384550
2539	NC_014376	GGAA	2	8	123361	123368	50 %	0 %	50 %	0 %	302384550
2540	NC_014376	AGC	2	6	123407	123412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384550
2541	NC_014376	CCT	2	6	123442	123447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384550
2542	NC_014376	TTA	2	6	123448	123453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384550
2543	NC_014376	GA	3	6	123457	123462	50 %	0 %	50 %	0 %	302384550
2544	NC_014376	GGC	2	6	123477	123482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384550
2545	NC_014376	ATA	2	6	123497	123502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384550
2546	NC_014376	CCT	2	6	123618	123623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384551
2547	NC_014376	TTCC	2	8	123691	123698	0 %	50 %	0 %	50 %	302384551
2548	NC_014376	AT	3	6	123721	123726	50 %	50 %	0 %	0 %	302384551
2549	NC_014376	CTA	2	6	123745	123750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384551
2550	NC_014376	GA	3	6	123840	123845	50 %	0 %	50 %	0 %	302384551
2551	NC_014376	TAA	2	6	123894	123899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_014376	AGGA	2	8	123910	123917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_014376	GCT	2	6	123921	123926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_014376	TTG	2	6	123952	123957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_014376	TA	3	6	123964	123969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_014376	CAT	2	6	123975	123980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_014376	ATT	2	6	124032	124037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_014376	T	6	6	124036	124041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_014376	TAT	2	6	124060	124065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_014376	ACTT	2	8	124078	124085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_014376	ATG	2	6	124108	124113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_014376	AAAG	2	8	124144	124151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014376	ATG	2	6	124157	124162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384552
2564	NC_014376	ACAAA	2	10	124166	124175	80 %	0 %	0 %	20 %	302384552
2565	NC_014376	GGCGG	2	10	124265	124274	0 %	0 %	80 %	20 %	302384552
2566	NC_014376	AT	3	6	124300	124305	50 %	50 %	0 %	0 %	302384552
2567	NC_014376	CTG	2	6	124316	124321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384552
2568	NC_014376	TG	3	6	124394	124399	0 %	50 %	50 %	0 %	302384552
2569	NC_014376	GGC	2	6	124538	124543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384552
2570	NC_014376	CTT	2	6	124583	124588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384552
2571	NC_014376	AGA	2	6	124627	124632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384552
2572	NC_014376	CCT	2	6	124710	124715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384552
2573	NC_014376	TGC	2	6	124825	124830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384552
2574	NC_014376	CCA	2	6	124885	124890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384552
2575	NC_014376	GTG	2	6	124930	124935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384552
2576	NC_014376	TAA	2	6	125068	125073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_014376	CAA	2	6	125108	125113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_014376	GT	3	6	125120	125125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_014376	AAAAC	2	10	125144	125153	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2580	NC_014376	TGC	2	6	125223	125228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384553
2581	NC_014376	T	6	6	125317	125322	0 %	100 %	0 %	0 %	302384553
2582	NC_014376	TAT	2	6	125372	125377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384553
2583	NC_014376	AGC	2	6	125382	125387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384553
2584	NC_014376	C	6	6	125478	125483	0 %	0 %	0 %	100 %	302384553
2585	NC_014376	ATC	3	9	125500	125508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384553
2586	NC_014376	TTC	2	6	125516	125521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384553
2587	NC_014376	ATA	2	6	125644	125649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384553
2588	NC_014376	CAT	2	6	125720	125725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_014376	T	6	6	125743	125748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_014376	ATT	2	6	125750	125755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_014376	A	7	7	125780	125786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_014376	ATA	2	6	125791	125796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014376	AGA	2	6	125804	125809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_014376	TCC	2	6	125814	125819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2595	NC_014376	GGC	2	6	125837	125842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_014376	GGC	2	6	125857	125862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_014376	CAG	2	6	125980	125985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_014376	ACA	2	6	126026	126031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_014376	GAA	2	6	126061	126066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384554
2600	NC_014376	ACCG	2	8	126084	126091	25 %	0 %	25 %	50 %	302384554
2601	NC_014376	GAT	2	6	126156	126161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384554
2602	NC_014376	GAT	2	6	126194	126199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384554
2603	NC_014376	TGA	2	6	126305	126310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384554
2604	NC_014376	TA	3	6	126344	126349	50 %	50 %	0 %	0 %	302384554
2605	NC_014376	GAG	2	6	126396	126401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384554
2606	NC_014376	CAGG	2	8	126477	126484	25 %	0 %	50 %	25 %	302384554
2607	NC_014376	TTTC	2	8	126506	126513	0 %	75 %	0 %	25 %	302384554
2608	NC_014376	ACGG	2	8	126538	126545	25 %	0 %	50 %	25 %	302384554
2609	NC_014376	CTG	2	6	126571	126576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384554
2610	NC_014376	ATG	2	6	126592	126597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384554
2611	NC_014376	CTGG	2	8	126609	126616	0 %	25 %	50 %	25 %	302384554
2612	NC_014376	ATT	2	6	126789	126794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384554
2613	NC_014376	CAA	2	6	126874	126879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384554
2614	NC_014376	ATGAGG	2	12	126898	126909	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	302384554
2615	NC_014376	T	6	6	126986	126991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_014376	ATT	2	6	126999	127004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_014376	TA	3	6	127029	127034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_014376	AGC	2	6	127045	127050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_014376	GAAG	2	8	127080	127087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_014376	AG	3	6	127311	127316	50 %	0 %	50 %	0 %	302384555
2621	NC_014376	AAG	2	6	127329	127334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384555
2622	NC_014376	GTT	2	6	127346	127351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384555
2623	NC_014376	GAT	2	6	127444	127449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384555
2624	NC_014376	TTC	2	6	127524	127529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384555
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2626	NC_014376	T	6	6	127658	127663	0 %	100 %	0 %	0 %	302384555
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2867	NC_014376	A	8	8	140493	140500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2868	NC_014376	A	6	6	140525	140530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2869	NC_014376	TG	3	6	140571	140576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2870	NC_014376	ACA	2	6	140601	140606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2871	NC_014376	AAGA	2	8	140628	140635	75 %	0 %	25 %	0 %	302384564
2872	NC_014376	GAT	2	6	140636	140641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384564
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2999	NC_014376	CTGAC	2	10	147632	147641	20 %	20 %	20 %	40 %	302384570
3000	NC_014376	CGT	2	6	147675	147680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384570

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