MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 94496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014376	T	8	8	24396	24403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014376	GGT	2	6	24534	24539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014376	ATG	2	6	24647	24652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014376	TCAT	2	8	24694	24701	25 %	50 %	0 %	25 %	302384461
505	NC_014376	ATA	2	6	24718	24723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384461
506	NC_014376	AAC	2	6	24751	24756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384461
507	NC_014376	TC	3	6	24779	24784	0 %	50 %	0 %	50 %	302384461
508	NC_014376	AGC	2	6	24792	24797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384461
509	NC_014376	AAT	2	6	24820	24825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384461
510	NC_014376	GCT	2	6	24835	24840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384461
511	NC_014376	TTCC	2	8	24843	24850	0 %	50 %	0 %	50 %	302384461
512	NC_014376	ACCAG	2	10	24884	24893	40 %	0 %	20 %	40 %	302384461
513	NC_014376	ATTAT	2	10	24951	24960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014376	A	6	6	24972	24977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014376	A	8	8	25021	25028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014376	AAAGG	2	10	25068	25077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014376	ATGA	2	8	25089	25096	50 %	25 %	25 %	0 %	302384462
518	NC_014376	T	6	6	25188	25193	0 %	100 %	0 %	0 %	302384462
519	NC_014376	AGC	2	6	25314	25319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384462
520	NC_014376	TAT	2	6	25326	25331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384462
521	NC_014376	GCA	3	9	25342	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384462
522	NC_014376	TCAA	2	8	25447	25454	50 %	25 %	0 %	25 %	302384462
523	NC_014376	A	7	7	25521	25527	100 %	0 %	0 %	0 %	302384462
524	NC_014376	TGA	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384462
525	NC_014376	ATG	2	6	25588	25593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384462
526	NC_014376	CAG	2	6	25856	25861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384462
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528	NC_014376	ATT	2	6	26058	26063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384462
529	NC_014376	CTGG	2	8	26093	26100	0 %	25 %	50 %	25 %	302384462
530	NC_014376	ATC	2	6	26122	26127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384462
531	NC_014376	TGGAAA	2	12	26128	26139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302384462
532	NC_014376	CTT	2	6	26217	26222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384462
533	NC_014376	GATG	2	8	26327	26334	25 %	25 %	50 %	0 %	302384462
534	NC_014376	CGG	2	6	26380	26385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384462
535	NC_014376	TTG	2	6	26419	26424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384462
536	NC_014376	GGA	2	6	26504	26509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384462
537	NC_014376	AG	3	6	26520	26525	50 %	0 %	50 %	0 %	302384462
538	NC_014376	ATGA	2	8	26566	26573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014376	ATG	2	6	26599	26604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_014376	AGGA	2	8	26715	26722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014376	A	6	6	26747	26752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014376	A	6	6	26807	26812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014376	ATA	2	6	26851	26856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014376	A	6	6	26893	26898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014376	AAT	2	6	26904	26909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014376	ATT	2	6	26988	26993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384463
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549	NC_014376	GGT	2	6	27018	27023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384463
550	NC_014376	TA	3	6	27026	27031	50 %	50 %	0 %	0 %	302384463
551	NC_014376	CCA	2	6	27032	27037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384463
552	NC_014376	ATT	2	6	27074	27079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384463
553	NC_014376	CAC	3	9	27081	27089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384463
554	NC_014376	GGA	2	6	27099	27104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384463
555	NC_014376	AGAAA	2	10	27109	27118	80 %	0 %	20 %	0 %	302384463
556	NC_014376	AGAGG	2	10	27129	27138	40 %	0 %	60 %	0 %	302384463
557	NC_014376	TTACT	2	10	27168	27177	20 %	60 %	0 %	20 %	302384463
558	NC_014376	TGA	2	6	27180	27185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384463
559	NC_014376	TGA	2	6	27303	27308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384463
560	NC_014376	AACGGG	2	12	27335	27346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302384463
561	NC_014376	GAA	2	6	27397	27402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384463
562	NC_014376	GCCT	2	8	27469	27476	0 %	25 %	25 %	50 %	302384463
563	NC_014376	TGC	2	6	27589	27594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384464
564	NC_014376	GCA	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384464
565	NC_014376	ATT	2	6	27653	27658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384464
566	NC_014376	ATC	2	6	27731	27736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384464
567	NC_014376	TCC	2	6	27772	27777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384464
568	NC_014376	AGG	2	6	27783	27788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384464
569	NC_014376	CTC	2	6	27789	27794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384464
570	NC_014376	AAT	2	6	27796	27801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384464
571	NC_014376	TGC	2	6	27805	27810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384464
572	NC_014376	GCG	2	6	27839	27844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384464
573	NC_014376	TAT	2	6	27933	27938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384464
574	NC_014376	GCC	2	6	27976	27981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302384464
575	NC_014376	TTC	2	6	27996	28001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384464
576	NC_014376	AAG	2	6	28019	28024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384464
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578	NC_014376	ACC	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384464
579	NC_014376	ATGG	2	8	28218	28225	25 %	25 %	50 %	0 %	302384464
580	NC_014376	CAT	2	6	28345	28350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384464
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582	NC_014376	CTG	2	6	28395	28400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384464
583	NC_014376	TCA	2	6	28464	28469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384464
584	NC_014376	TAT	2	6	28470	28475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384464
585	NC_014376	A	6	6	28483	28488	100 %	0 %	0 %	0 %	302384464
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587	NC_014376	TCA	2	6	28581	28586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384464
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590	NC_014376	T	7	7	28640	28646	0 %	100 %	0 %	0 %	302384465
591	NC_014376	CTTC	2	8	28666	28673	0 %	50 %	0 %	50 %	302384465
592	NC_014376	ATG	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384465
593	NC_014376	GAA	2	6	28723	28728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384465
594	NC_014376	ATA	2	6	28768	28773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384465
595	NC_014376	AT	3	6	28826	28831	50 %	50 %	0 %	0 %	302384465
596	NC_014376	GCC	2	6	28884	28889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302384465
597	NC_014376	TCA	2	6	28909	28914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384465
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599	NC_014376	CTT	2	6	28949	28954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384465
600	NC_014376	TCA	2	6	28978	28983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384465
601	NC_014376	CGGA	2	8	29035	29042	25 %	0 %	50 %	25 %	302384465
602	NC_014376	TCT	2	6	29074	29079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384465
603	NC_014376	GCT	2	6	29128	29133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384465
604	NC_014376	T	6	6	29133	29138	0 %	100 %	0 %	0 %	302384465
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608	NC_014376	CTC	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302384465
609	NC_014376	ACAA	2	8	29491	29498	75 %	0 %	0 %	25 %	302384465
610	NC_014376	AGGT	2	8	29573	29580	25 %	25 %	50 %	0 %	302384465
611	NC_014376	ATG	3	9	29587	29595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384465
612	NC_014376	CCA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384465
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614	NC_014376	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	302384465
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616	NC_014376	T	6	6	29761	29766	0 %	100 %	0 %	0 %	302384465
617	NC_014376	TAA	2	6	29777	29782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384465
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621	NC_014376	CTA	2	6	30029	30034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384465
622	NC_014376	TCAA	2	8	30067	30074	50 %	25 %	0 %	25 %	302384465
623	NC_014376	GCC	2	6	30090	30095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_014376	ATT	2	6	30122	30127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384466
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626	NC_014376	GCC	2	6	30271	30276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302384466
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630	NC_014376	TGC	2	6	30474	30479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384466
631	NC_014376	TTC	2	6	30531	30536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302384466
632	NC_014376	CCTG	2	8	30553	30560	0 %	25 %	25 %	50 %	302384466
633	NC_014376	TGG	2	6	30572	30577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384466
634	NC_014376	ATA	2	6	30598	30603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384466
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644	NC_014376	A	6	6	31246	31251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_014376	T	6	6	31277	31282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_014376	TAATA	2	10	31529	31538	60 %	40 %	0 %	0 %	302384467
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654	NC_014376	T	7	7	31636	31642	0 %	100 %	0 %	0 %	302384467
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662	NC_014376	T	8	8	32018	32025	0 %	100 %	0 %	0 %	302384467
663	NC_014376	T	6	6	32028	32033	0 %	100 %	0 %	0 %	302384467
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700	NC_014376	TCC	2	6	33786	33791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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747	NC_014376	ACA	2	6	35660	35665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
748	NC_014376	ATC	2	6	35702	35707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384470
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753	NC_014376	CAT	2	6	35986	35991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384470
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759	NC_014376	TG	3	6	36164	36169	0 %	50 %	50 %	0 %	302384470
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761	NC_014376	GCG	2	6	36260	36265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384470
762	NC_014376	GGATAT	2	12	36364	36375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384470
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