MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 94496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014376	ATG	3	9	217707	217715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014376	AG	3	6	217749	217754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014376	CT	3	6	217821	217826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_014376	TTTTC	2	10	217851	217860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4505	NC_014376	T	6	6	217931	217936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014376	CAT	2	6	217944	217949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014376	ATG	2	6	217970	217975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014376	GCTG	2	8	218008	218015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_014376	CCT	2	6	218022	218027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_014376	AAT	2	6	218029	218034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014376	GGA	2	6	218078	218083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_014376	CCT	2	6	218105	218110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_014376	GAC	2	6	218138	218143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_014376	CTT	2	6	218155	218160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014376	TA	4	8	218209	218216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014376	CGT	2	6	218217	218222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014376	AG	3	6	218255	218260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014376	GAA	2	6	218347	218352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014376	AGC	2	6	218371	218376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_014376	TGG	2	6	218415	218420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014376	TATG	2	8	218525	218532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_014376	GAG	2	6	218585	218590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014376	TAGA	2	8	218764	218771	50 %	25 %	25 %	0 %	302384638
4524	NC_014376	AAT	2	6	218793	218798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384638
4525	NC_014376	TAC	2	6	218815	218820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384638
4526	NC_014376	CCA	2	6	218825	218830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302384638
4527	NC_014376	CAA	2	6	218832	218837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302384638
4528	NC_014376	AT	3	6	218936	218941	50 %	50 %	0 %	0 %	302384638
4529	NC_014376	AT	4	8	218971	218978	50 %	50 %	0 %	0 %	302384638
4530	NC_014376	CTAAAA	2	12	219033	219044	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302384638
4531	NC_014376	TAA	2	6	219048	219053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384638
4532	NC_014376	TCA	2	6	219056	219061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384638
4533	NC_014376	T	6	6	219121	219126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014376	TAT	2	6	219145	219150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014376	GTT	2	6	219155	219160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014376	TAAT	2	8	219176	219183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_014376	ATA	2	6	219199	219204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014376	ATC	2	6	219209	219214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014376	AGA	2	6	219232	219237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014376	CAC	2	6	219286	219291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_014376	TATACA	2	12	219324	219335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4542	NC_014376	GAG	2	6	219387	219392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014376	A	7	7	219496	219502	100 %	0 %	0 %	0 %	302384639
4544	NC_014376	AGA	2	6	219548	219553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384640
4545	NC_014376	AAT	2	6	219862	219867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014376	ATT	2	6	219947	219952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014376	T	6	6	219985	219990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_014376	CAAG	2	8	220047	220054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_014376	GATG	2	8	220058	220065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014376	A	6	6	220172	220177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014376	ATC	2	6	220420	220425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_014376	T	7	7	220430	220436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014376	AG	3	6	220443	220448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014376	TA	3	6	220466	220471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014376	ATT	2	6	220495	220500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014376	TAATA	2	10	220502	220511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014376	ATT	2	6	220517	220522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014376	GA	4	8	220526	220533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014376	TAAT	2	8	220564	220571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014376	TAAA	2	8	220572	220579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014376	AGA	2	6	220627	220632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384641
4562	NC_014376	GCA	2	6	220635	220640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384641
4563	NC_014376	A	6	6	220676	220681	100 %	0 %	0 %	0 %	302384641
4564	NC_014376	TG	3	6	220784	220789	0 %	50 %	50 %	0 %	302384641
4565	NC_014376	CATTTA	2	12	220867	220878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4566	NC_014376	TA	4	8	220905	220912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_014376	T	6	6	221036	221041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014376	AAC	2	6	221055	221060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_014376	ATA	2	6	221074	221079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014376	GAA	2	6	221107	221112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014376	T	6	6	221230	221235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014376	GTT	2	6	221256	221261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_014376	CTT	2	6	221281	221286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_014376	T	7	7	221331	221337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014376	T	6	6	221350	221355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014376	CAGAG	2	10	221361	221370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4577	NC_014376	TA	4	8	221385	221392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014376	TA	4	8	221400	221407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014376	TA	4	8	221413	221420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014376	ATAA	2	8	221488	221495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014376	AGA	2	6	221496	221501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384642
4582	NC_014376	GGAA	2	8	221503	221510	50 %	0 %	50 %	0 %	302384642
4583	NC_014376	TTTA	2	8	221683	221690	25 %	75 %	0 %	0 %	302384642
4584	NC_014376	CAG	2	6	221791	221796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384642
4585	NC_014376	TGA	2	6	221830	221835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384642
4586	NC_014376	CT	3	6	221986	221991	0 %	50 %	0 %	50 %	302384642
4587	NC_014376	GA	4	8	222005	222012	50 %	0 %	50 %	0 %	302384642
4588	NC_014376	GC	3	6	222031	222036	0 %	0 %	50 %	50 %	302384642
4589	NC_014376	ATT	2	6	222085	222090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384642
4590	NC_014376	ATT	2	6	222206	222211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384642
4591	NC_014376	AAT	2	6	222212	222217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302384642
4592	NC_014376	GCT	2	6	222303	222308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384643
4593	NC_014376	TCAG	2	8	222362	222369	25 %	25 %	25 %	25 %	302384643
4594	NC_014376	CAG	2	6	222376	222381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384643
4595	NC_014376	AT	3	6	222434	222439	50 %	50 %	0 %	0 %	302384643
4596	NC_014376	AGG	2	6	222441	222446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384643
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4598	NC_014376	AGCC	2	8	222481	222488	25 %	0 %	25 %	50 %	302384643
4599	NC_014376	GTG	2	6	222499	222504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384643
4600	NC_014376	GTT	2	6	222522	222527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384643
4601	NC_014376	AGC	2	6	222635	222640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384643
4602	NC_014376	GGA	2	6	222651	222656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302384643
4603	NC_014376	GAAT	2	8	222661	222668	50 %	25 %	25 %	0 %	302384643
4604	NC_014376	GAC	2	6	222687	222692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384644
4605	NC_014376	GTT	2	6	222711	222716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302384644
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4607	NC_014376	AAAG	2	8	222848	222855	75 %	0 %	25 %	0 %	302384644
4608	NC_014376	CGG	2	6	222856	222861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302384644
4609	NC_014376	AAG	2	6	222999	223004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302384644
4610	NC_014376	TGA	2	6	223028	223033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384644
4611	NC_014376	TAATT	2	10	223046	223055	40 %	60 %	0 %	0 %	302384644
4612	NC_014376	GATT	2	8	223112	223119	25 %	50 %	25 %	0 %	302384644
4613	NC_014376	ATT	2	6	223154	223159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384645
4614	NC_014376	TGG	2	6	223174	223179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302384645
4615	NC_014376	TTGT	2	8	223233	223240	0 %	75 %	25 %	0 %	302384645
4616	NC_014376	GATT	2	8	223251	223258	25 %	50 %	25 %	0 %	302384645
4617	NC_014376	TAT	2	6	223279	223284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384645
4618	NC_014376	GAT	2	6	223303	223308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384645
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4620	NC_014376	GCC	2	6	223342	223347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302384645
4621	NC_014376	TGC	2	6	223563	223568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302384645
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4624	NC_014376	GT	4	8	223604	223611	0 %	50 %	50 %	0 %	302384645
4625	NC_014376	TTA	2	6	223614	223619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384645
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4629	NC_014376	ATC	2	6	223775	223780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302384645
4630	NC_014376	TTAT	2	8	223839	223846	25 %	75 %	0 %	0 %	302384645
4631	NC_014376	TGA	2	6	223894	223899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302384645
4632	NC_014376	AAATA	2	10	223932	223941	80 %	20 %	0 %	0 %	302384646
4633	NC_014376	A	7	7	223943	223949	100 %	0 %	0 %	0 %	302384646
4634	NC_014376	TTA	2	6	223954	223959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384646
4635	NC_014376	T	6	6	223978	223983	0 %	100 %	0 %	0 %	302384646
4636	NC_014376	ATCGA	2	10	224078	224087	40 %	20 %	20 %	20 %	302384646
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4650	NC_014376	GGA	2	6	224764	224769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4651	NC_014376	ATT	2	6	224792	224797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302384647
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4666	NC_014376	TAT	2	6	225511	225516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4749	NC_014376	ATT	2	6	229199	229204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4750	NC_014376	TCT	2	6	229307	229312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4751	NC_014376	GAT	2	6	229318	229323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4871	NC_014376	TTCT	2	8	235213	235220	0 %	75 %	0 %	25 %	302384656
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4875	NC_014376	AGC	2	6	235319	235324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302384656
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