MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 88751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014355	CCA	2	6	88950	88955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035505
2003	NC_014355	CGT	2	6	88967	88972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035505
2004	NC_014355	TCC	2	6	88976	88981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035505
2005	NC_014355	TGG	3	9	89008	89016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035505
2006	NC_014355	CCA	2	6	89037	89042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035505
2007	NC_014355	TCG	2	6	89055	89060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035505
2008	NC_014355	GGC	2	6	89062	89067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035505
2009	NC_014355	CTG	3	9	89108	89116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035505
2010	NC_014355	GCGT	2	8	89118	89125	0 %	25 %	50 %	25 %	302035505
2011	NC_014355	GC	3	6	89243	89248	0 %	0 %	50 %	50 %	302035505
2012	NC_014355	GTGCC	2	10	89391	89400	0 %	20 %	40 %	40 %	302035505
2013	NC_014355	TCGACG	2	12	89424	89435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302035505
2014	NC_014355	CAA	2	6	89467	89472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035505
2015	NC_014355	CGA	2	6	89581	89586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035505
2016	NC_014355	CGCC	2	8	89667	89674	0 %	0 %	25 %	75 %	302035505
2017	NC_014355	GC	3	6	89702	89707	0 %	0 %	50 %	50 %	302035505
2018	NC_014355	GTG	2	6	89751	89756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035505
2019	NC_014355	CAT	2	6	89779	89784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035505
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2021	NC_014355	GCC	2	6	89858	89863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035505
2022	NC_014355	CG	3	6	89990	89995	0 %	0 %	50 %	50 %	302035506
2023	NC_014355	CAGC	2	8	90014	90021	25 %	0 %	25 %	50 %	302035506
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2030	NC_014355	GGCA	2	8	90320	90327	25 %	0 %	50 %	25 %	302035506
2031	NC_014355	CGC	3	9	90328	90336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035506
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2033	NC_014355	TGG	2	6	90392	90397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035506
2034	NC_014355	CTGG	2	8	90402	90409	0 %	25 %	50 %	25 %	302035506
2035	NC_014355	ATC	2	6	90413	90418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035506
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2043	NC_014355	TGC	2	6	90687	90692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035506
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2052	NC_014355	TGGCT	2	10	91086	91095	0 %	40 %	40 %	20 %	302035506
2053	NC_014355	CG	3	6	91167	91172	0 %	0 %	50 %	50 %	302035506
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2067	NC_014355	AGTC	2	8	91853	91860	25 %	25 %	25 %	25 %	302035507
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2089	NC_014355	AGCCG	2	10	92471	92480	20 %	0 %	40 %	40 %	302035508
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2093	NC_014355	CTG	2	6	92639	92644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2094	NC_014355	CG	3	6	92683	92688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2095	NC_014355	GCA	3	9	92717	92725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035509
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2102	NC_014355	GC	3	6	93046	93051	0 %	0 %	50 %	50 %	302035509
2103	NC_014355	CAA	2	6	93069	93074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035509
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2119	NC_014355	ATCA	2	8	93643	93650	50 %	25 %	0 %	25 %	302035509
2120	NC_014355	CG	3	6	93690	93695	0 %	0 %	50 %	50 %	302035509
2121	NC_014355	CG	3	6	93775	93780	0 %	0 %	50 %	50 %	302035509
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2244	NC_014355	A	8	8	98932	98939	100 %	0 %	0 %	0 %	302035517
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2247	NC_014355	CGAC	2	8	99074	99081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2248	NC_014355	GCA	2	6	99083	99088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_014355	CCG	2	6	99113	99118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2250	NC_014355	AGC	2	6	99122	99127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_014355	ATT	2	6	99143	99148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_014355	CTG	2	6	99151	99156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_014355	CG	3	6	99177	99182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2254	NC_014355	TCA	2	6	99232	99237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035518
2255	NC_014355	TGA	2	6	99352	99357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035518
2256	NC_014355	TCT	2	6	99478	99483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035518
2257	NC_014355	ATG	2	6	99663	99668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035518
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2259	NC_014355	T	7	7	99691	99697	0 %	100 %	0 %	0 %	302035518
2260	NC_014355	TCG	2	6	99804	99809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035518
2261	NC_014355	GTA	2	6	99830	99835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035518
2262	NC_014355	CTGA	2	8	99836	99843	25 %	25 %	25 %	25 %	302035518
2263	NC_014355	CTTTT	2	10	99869	99878	0 %	80 %	0 %	20 %	302035518
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2267	NC_014355	CCTG	2	8	100056	100063	0 %	25 %	25 %	50 %	302035518
2268	NC_014355	CGC	2	6	100108	100113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035518
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2272	NC_014355	TCC	2	6	100407	100412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035518
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2280	NC_014355	GC	3	6	100820	100825	0 %	0 %	50 %	50 %	302035518
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2291	NC_014355	CAAA	2	8	101132	101139	75 %	0 %	0 %	25 %	302035518
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2372	NC_014355	GCCA	2	8	105130	105137	25 %	0 %	25 %	50 %	302035520
2373	NC_014355	GC	3	6	105292	105297	0 %	0 %	50 %	50 %	302035520
2374	NC_014355	CGG	2	6	105368	105373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035520
2375	NC_014355	ATG	2	6	105430	105435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035520
2376	NC_014355	GGCA	2	8	105462	105469	25 %	0 %	50 %	25 %	302035520
2377	NC_014355	GCTTT	2	10	105511	105520	0 %	60 %	20 %	20 %	302035520
2378	NC_014355	GCT	2	6	105528	105533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035520
2379	NC_014355	GCC	2	6	105535	105540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035520
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2384	NC_014355	TGA	2	6	105840	105845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035521
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2386	NC_014355	TGGC	2	8	105897	105904	0 %	25 %	50 %	25 %	302035521
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2390	NC_014355	GTCTT	2	10	106403	106412	0 %	60 %	20 %	20 %	302035521
2391	NC_014355	CCG	2	6	106499	106504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035521
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2401	NC_014355	CAGT	2	8	107163	107170	25 %	25 %	25 %	25 %	302035521
2402	NC_014355	GCGTT	2	10	107216	107225	0 %	40 %	40 %	20 %	302035521
2403	NC_014355	TGA	2	6	107256	107261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035521
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2423	NC_014355	TCG	2	6	108161	108166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035521
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2434	NC_014355	TCC	2	6	108923	108928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2435	NC_014355	AAG	2	6	108932	108937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_014355	GAA	2	6	108982	108987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2437	NC_014355	GC	3	6	109023	109028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2438	NC_014355	CTT	2	6	109039	109044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2439	NC_014355	AAG	2	6	109141	109146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2440	NC_014355	CAAGGC	2	12	109194	109205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2442	NC_014355	CCA	2	6	109254	109259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2443	NC_014355	GCTC	2	8	109266	109273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2444	NC_014355	ATG	3	9	109286	109294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2445	NC_014355	TC	3	6	109329	109334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2446	NC_014355	TACGT	2	10	109372	109381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2447	NC_014355	CTT	2	6	109390	109395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2448	NC_014355	GCTC	2	8	109401	109408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2449	NC_014355	ACC	2	6	109449	109454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2450	NC_014355	A	7	7	109536	109542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2451	NC_014355	CGC	2	6	109628	109633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035523
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2463	NC_014355	CAT	2	6	110149	110154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035524
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2471	NC_014355	ATGA	2	8	110768	110775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2472	NC_014355	ACC	2	6	110790	110795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2473	NC_014355	AAG	2	6	110993	110998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035526
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2477	NC_014355	CCA	2	6	111081	111086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035526
2478	NC_014355	TTCAG	2	10	111141	111150	20 %	40 %	20 %	20 %	302035526
2479	NC_014355	CACGG	2	10	111175	111184	20 %	0 %	40 %	40 %	302035526
2480	NC_014355	CCA	2	6	111225	111230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035526
2481	NC_014355	CTA	2	6	111271	111276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035526
2482	NC_014355	CG	3	6	111342	111347	0 %	0 %	50 %	50 %	302035526
2483	NC_014355	TGC	2	6	111348	111353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2484	NC_014355	TGT	2	6	111399	111404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035526
2485	NC_014355	GCCC	2	8	111436	111443	0 %	0 %	25 %	75 %	302035526
2486	NC_014355	ACA	2	6	111483	111488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035526
2487	NC_014355	TCG	2	6	111522	111527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2488	NC_014355	G	6	6	111535	111540	0 %	0 %	100 %	0 %	302035526
2489	NC_014355	CTAC	2	8	111576	111583	25 %	25 %	0 %	50 %	302035526
2490	NC_014355	GAC	2	6	111599	111604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2491	NC_014355	GACG	2	8	111613	111620	25 %	0 %	50 %	25 %	302035526
2492	NC_014355	TCA	3	9	111672	111680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035526
2493	NC_014355	CGA	2	6	111682	111687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2494	NC_014355	TGC	2	6	111723	111728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2495	NC_014355	GGA	2	6	111781	111786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035526
2496	NC_014355	CAA	2	6	111826	111831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035526
2497	NC_014355	CTGC	2	8	111900	111907	0 %	25 %	25 %	50 %	302035526
2498	NC_014355	GAAG	2	8	111952	111959	50 %	0 %	50 %	0 %	302035526
2499	NC_014355	CGA	2	6	112051	112056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035526
2500	NC_014355	TGT	2	6	112110	112115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035526

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