MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 88751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014355	TC	3	6	227969	227974	0 %	50 %	0 %	50 %	302035647
5003	NC_014355	TCC	2	6	228012	228017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035647
5004	NC_014355	AGG	2	6	228085	228090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035647
5005	NC_014355	ATCGT	2	10	228154	228163	20 %	40 %	20 %	20 %	302035647
5006	NC_014355	ATCG	2	8	228285	228292	25 %	25 %	25 %	25 %	302035647
5007	NC_014355	AAGA	2	8	228300	228307	75 %	0 %	25 %	0 %	302035647
5008	NC_014355	AGG	2	6	228322	228327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035647
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5010	NC_014355	TGC	2	6	228493	228498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_014355	GTC	2	6	228588	228593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035648
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5013	NC_014355	GCC	2	6	228718	228723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035648
5014	NC_014355	AGGT	2	8	228815	228822	25 %	25 %	50 %	0 %	302035648
5015	NC_014355	TTG	2	6	228867	228872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035648
5016	NC_014355	ATG	2	6	228924	228929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035648
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5018	NC_014355	TCG	2	6	229066	229071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035648
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5020	NC_014355	CCTT	2	8	229195	229202	0 %	50 %	0 %	50 %	302035648
5021	NC_014355	CTT	2	6	229274	229279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035648
5022	NC_014355	TGT	2	6	229353	229358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035648
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5031	NC_014355	G	6	6	229915	229920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014355	CG	3	6	229959	229964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_014355	CG	3	6	229985	229990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_014355	AAT	2	6	230058	230063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014355	TCGA	2	8	230078	230085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_014355	GTCG	2	8	230131	230138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_014355	TGA	2	6	230156	230161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_014355	TTG	2	6	230267	230272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014355	TTCA	2	8	230279	230286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5042	NC_014355	CTTT	2	8	230329	230336	0 %	75 %	0 %	25 %	302035649
5043	NC_014355	ACT	2	6	230398	230403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035649
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5063	NC_014355	CGG	2	6	231443	231448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_014355	TG	3	6	231470	231475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014355	AGG	2	6	231539	231544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_014355	GCG	2	6	234533	234538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035651
5127	NC_014355	TC	3	6	234585	234590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5159	NC_014355	GCGCGA	2	12	236092	236103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_014355	GAT	2	6	240293	240298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035657
5249	NC_014355	CGGG	2	8	240383	240390	0 %	0 %	75 %	25 %	302035657
5250	NC_014355	GTT	2	6	240406	240411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035658
5251	NC_014355	CCT	2	6	240470	240475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035658
5252	NC_014355	GCCCT	2	10	240480	240489	0 %	20 %	20 %	60 %	302035658
5253	NC_014355	TGA	2	6	240587	240592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035658
5254	NC_014355	GT	3	6	240617	240622	0 %	50 %	50 %	0 %	302035658
5255	NC_014355	CTG	2	6	240623	240628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035658
5256	NC_014355	CGC	2	6	240667	240672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035658
5257	NC_014355	GCG	2	6	240720	240725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035658
5258	NC_014355	TCT	2	6	240742	240747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035658
5259	NC_014355	CGGCC	2	10	240776	240785	0 %	0 %	40 %	60 %	302035658
5260	NC_014355	GTT	2	6	240826	240831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035658
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5262	NC_014355	T	9	9	240914	240922	0 %	100 %	0 %	0 %	302035658
5263	NC_014355	GGC	2	6	240999	241004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035659
5264	NC_014355	AGGG	2	8	241009	241016	25 %	0 %	75 %	0 %	302035659
5265	NC_014355	ACCG	2	8	241096	241103	25 %	0 %	25 %	50 %	302035659
5266	NC_014355	ACG	2	6	241147	241152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035659
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5268	NC_014355	GTT	2	6	241253	241258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035659
5269	NC_014355	TCG	2	6	241271	241276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
5270	NC_014355	CGA	2	6	241343	241348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035659
5271	NC_014355	GGC	2	6	241349	241354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035659
5272	NC_014355	GTC	2	6	241356	241361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
5273	NC_014355	GC	3	6	241386	241391	0 %	0 %	50 %	50 %	302035659
5274	NC_014355	GTA	2	6	241533	241538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035659
5275	NC_014355	CGG	2	6	241565	241570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035659
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5282	NC_014355	GC	3	6	241804	241809	0 %	0 %	50 %	50 %	302035659
5283	NC_014355	CAC	2	6	241880	241885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035659
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5286	NC_014355	ACA	2	6	242105	242110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035659
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5288	NC_014355	AGC	2	6	242167	242172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035659
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5291	NC_014355	TGGTT	2	10	242315	242324	0 %	60 %	40 %	0 %	302035659
5292	NC_014355	TGC	2	6	242339	242344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035659
5293	NC_014355	CAT	2	6	242379	242384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035659
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5295	NC_014355	GGTC	2	8	242483	242490	0 %	25 %	50 %	25 %	302035659
5296	NC_014355	GTT	2	6	242573	242578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035659
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5298	NC_014355	GC	4	8	242662	242669	0 %	0 %	50 %	50 %	302035659
5299	NC_014355	AGGA	2	8	242691	242698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_014355	AAC	2	6	242731	242736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5301	NC_014355	GC	3	6	242740	242745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5302	NC_014355	CG	3	6	242858	242863	0 %	0 %	50 %	50 %	302035660
5303	NC_014355	TCG	2	6	242898	242903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
5304	NC_014355	GCTC	2	8	242998	243005	0 %	25 %	25 %	50 %	302035660
5305	NC_014355	CTG	2	6	243029	243034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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5308	NC_014355	GCT	2	6	243195	243200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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5310	NC_014355	CTG	2	6	243348	243353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035660
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5312	NC_014355	CTGC	2	8	243395	243402	0 %	25 %	25 %	50 %	302035660
5313	NC_014355	ATG	2	6	243405	243410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035660
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5315	NC_014355	CGG	2	6	243495	243500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5316	NC_014355	GGAT	2	8	243546	243553	25 %	25 %	50 %	0 %	302035661
5317	NC_014355	AGT	2	6	243556	243561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035661
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5322	NC_014355	CAC	2	6	243870	243875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035661
5323	NC_014355	CGT	3	9	243921	243929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035661
5324	NC_014355	GAT	2	6	244008	244013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035661
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5329	NC_014355	CGA	2	6	244250	244255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035661
5330	NC_014355	GCG	2	6	244261	244266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035661
5331	NC_014355	ACG	2	6	244267	244272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035661
5332	NC_014355	AT	3	6	244312	244317	50 %	50 %	0 %	0 %	302035661
5333	NC_014355	TCC	2	6	244347	244352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5334	NC_014355	CCTTG	2	10	244391	244400	0 %	40 %	20 %	40 %	302035662
5335	NC_014355	AGC	2	6	244546	244551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
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5337	NC_014355	GCCG	2	8	244599	244606	0 %	0 %	50 %	50 %	302035662
5338	NC_014355	TCT	2	6	244610	244615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035662
5339	NC_014355	CGC	2	6	244682	244687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035662
5340	NC_014355	TGG	2	6	244769	244774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035662
5341	NC_014355	CTG	2	6	244836	244841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5342	NC_014355	G	6	6	245049	245054	0 %	0 %	100 %	0 %	302035662
5343	NC_014355	TGCG	2	8	245083	245090	0 %	25 %	50 %	25 %	302035662
5344	NC_014355	CCG	2	6	245098	245103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035662
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5346	NC_014355	TGA	2	6	245225	245230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035662
5347	NC_014355	CCG	2	6	245260	245265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035662
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5349	NC_014355	G	6	6	245423	245428	0 %	0 %	100 %	0 %	302035662
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5352	NC_014355	GGCG	2	8	245571	245578	0 %	0 %	75 %	25 %	302035662
5353	NC_014355	GGA	2	6	245587	245592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035662
5354	NC_014355	ATT	2	6	245916	245921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302035662
5355	NC_014355	TCGG	2	8	245932	245939	0 %	25 %	50 %	25 %	302035662
5356	NC_014355	TCGA	2	8	245980	245987	25 %	25 %	25 %	25 %	302035662
5357	NC_014355	CGG	2	6	246069	246074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035662
5358	NC_014355	TGA	2	6	246137	246142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035662
5359	NC_014355	CCTCGA	2	12	246164	246175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302035662
5360	NC_014355	AGC	2	6	246187	246192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5361	NC_014355	GCA	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5362	NC_014355	AG	3	6	246222	246227	50 %	0 %	50 %	0 %	302035662
5363	NC_014355	GTC	2	6	246258	246263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5364	NC_014355	GCC	2	6	246276	246281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035662
5365	NC_014355	CGA	2	6	246413	246418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5366	NC_014355	AGC	2	6	246430	246435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035662
5367	NC_014355	TCA	2	6	246467	246472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035662
5368	NC_014355	GC	3	6	246509	246514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5369	NC_014355	TGG	2	6	246527	246532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_014355	CGT	2	6	246559	246564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_014355	GTC	2	6	246675	246680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5372	NC_014355	GTG	2	6	246839	246844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_014355	GGGC	2	8	246902	246909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5374	NC_014355	AGCT	2	8	246970	246977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5381	NC_014355	GCC	2	6	247167	247172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5494	NC_014355	TTC	2	6	252315	252320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_014355	GCTG	2	8	252408	252415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5496	NC_014355	GAT	2	6	252450	252455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_014355	GTG	2	6	252457	252462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_014355	TGG	2	6	252498	252503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_014355	GTT	2	6	252571	252576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_014355	ACA	2	6	252708	252713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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