MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrospira defluvii

Total Repeats: 88751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014355	CGA	2	6	204447	204452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035623
4502	NC_014355	AGG	2	6	204560	204565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014355	CAG	2	6	204656	204661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014355	TTC	2	6	204707	204712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_014355	TGGCT	2	10	204741	204750	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4506	NC_014355	CT	4	8	204914	204921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_014355	TGCC	2	8	204941	204948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_014355	CCGTT	2	10	205014	205023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4509	NC_014355	CCT	2	6	205067	205072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_014355	GC	3	6	205103	205108	0 %	0 %	50 %	50 %	302035624
4511	NC_014355	ATC	2	6	205116	205121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035624
4512	NC_014355	GCC	2	6	205212	205217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035624
4513	NC_014355	GAT	2	6	205295	205300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035624
4514	NC_014355	GAA	2	6	205340	205345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035624
4515	NC_014355	GGC	2	6	205355	205360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035624
4516	NC_014355	ATC	2	6	205437	205442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035624
4517	NC_014355	GTG	2	6	205455	205460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035624
4518	NC_014355	GTT	2	6	205500	205505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035624
4519	NC_014355	CT	3	6	205521	205526	0 %	50 %	0 %	50 %	302035624
4520	NC_014355	GAA	2	6	205566	205571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302035624
4521	NC_014355	TTG	2	6	205615	205620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035624
4522	NC_014355	TC	3	6	205775	205780	0 %	50 %	0 %	50 %	302035624
4523	NC_014355	GTT	2	6	205805	205810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035624
4524	NC_014355	CGCCT	2	10	205862	205871	0 %	20 %	20 %	60 %	302035624
4525	NC_014355	TGA	2	6	205933	205938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035624
4526	NC_014355	ATG	2	6	205962	205967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035624
4527	NC_014355	CGAG	2	8	205969	205976	25 %	0 %	50 %	25 %	302035624
4528	NC_014355	GC	3	6	206006	206011	0 %	0 %	50 %	50 %	302035624
4529	NC_014355	TGA	2	6	206036	206041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035624
4530	NC_014355	GGTGA	2	10	206070	206079	20 %	20 %	60 %	0 %	302035624
4531	NC_014355	AAC	2	6	206110	206115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302035624
4532	NC_014355	CTG	2	6	206134	206139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035624
4533	NC_014355	CCAA	2	8	206214	206221	50 %	0 %	0 %	50 %	302035624
4534	NC_014355	GCC	2	6	206244	206249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035624
4535	NC_014355	GGC	2	6	206277	206282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035624
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4537	NC_014355	GAGC	2	8	206317	206324	25 %	0 %	50 %	25 %	302035624
4538	NC_014355	GAG	2	6	206349	206354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035624
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4540	NC_014355	GGA	2	6	206399	206404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035624
4541	NC_014355	GCAG	2	8	206531	206538	25 %	0 %	50 %	25 %	302035624
4542	NC_014355	GCTCCC	2	12	206565	206576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302035624
4543	NC_014355	GGT	2	6	206607	206612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035624
4544	NC_014355	GCCCC	2	10	206619	206628	0 %	0 %	20 %	80 %	302035624
4545	NC_014355	GAG	2	6	206668	206673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014355	GCCG	2	8	206674	206681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_014355	TTG	2	6	206690	206695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_014355	TGG	2	6	206707	206712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014355	TC	3	6	206739	206744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_014355	TTG	2	6	206770	206775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014355	GTT	2	6	206788	206793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014355	ACC	2	6	206811	206816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_014355	C	6	6	206852	206857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4554	NC_014355	GTG	2	6	206870	206875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014355	GCCGC	2	10	206878	206887	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4556	NC_014355	CGG	2	6	206997	207002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035625
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4558	NC_014355	GGTG	2	8	207114	207121	0 %	25 %	75 %	0 %	302035625
4559	NC_014355	TGC	2	6	207133	207138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035625
4560	NC_014355	CGG	2	6	207191	207196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035625
4561	NC_014355	TCG	3	9	207289	207297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035625
4562	NC_014355	CT	3	6	207319	207324	0 %	50 %	0 %	50 %	302035625
4563	NC_014355	GC	3	6	207352	207357	0 %	0 %	50 %	50 %	302035625
4564	NC_014355	GAT	2	6	207398	207403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035625
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4567	NC_014355	GCC	2	6	207493	207498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035625
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4570	NC_014355	CGT	2	6	207641	207646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035625
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4572	NC_014355	GGC	2	6	207700	207705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035625
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4574	NC_014355	GTGG	2	8	207853	207860	0 %	25 %	75 %	0 %	302035625
4575	NC_014355	AGG	2	6	207885	207890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035625
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4578	NC_014355	TTG	2	6	207953	207958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302035625
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4581	NC_014355	CGC	3	9	208116	208124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035625
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4588	NC_014355	GATGCC	2	12	208577	208588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302035625
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4594	NC_014355	GCC	2	6	208859	208864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035625
4595	NC_014355	TGC	2	6	208881	208886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035625
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4597	NC_014355	GA	3	6	208971	208976	50 %	0 %	50 %	0 %	302035625
4598	NC_014355	CAC	2	6	209010	209015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035625
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4602	NC_014355	G	6	6	209237	209242	0 %	0 %	100 %	0 %	302035626
4603	NC_014355	CGG	2	6	209249	209254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035626
4604	NC_014355	CGAAGG	2	12	209287	209298	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302035626
4605	NC_014355	CTC	2	6	209360	209365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035626
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4607	NC_014355	ATC	2	6	209397	209402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035626
4608	NC_014355	TGG	2	6	209443	209448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035626
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4614	NC_014355	CGA	3	9	209569	209577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035626
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4617	NC_014355	TCTT	2	8	209631	209638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_014355	GTAT	2	8	209639	209646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014355	AGA	2	6	209731	209736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014355	GCT	2	6	209784	209789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035627
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4622	NC_014355	CG	3	6	209819	209824	0 %	0 %	50 %	50 %	302035627
4623	NC_014355	CCG	2	6	209876	209881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035627
4624	NC_014355	ACG	2	6	209914	209919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035627
4625	NC_014355	TGC	2	6	210063	210068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035627
4626	NC_014355	CTT	2	6	210087	210092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035627
4627	NC_014355	CAT	2	6	210093	210098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302035627
4628	NC_014355	GCG	2	6	210168	210173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_014355	GAC	2	6	210181	210186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_014355	GGC	2	6	210191	210196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_014355	ACC	2	6	210216	210221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_014355	GC	3	6	210283	210288	0 %	0 %	50 %	50 %	302035628
4633	NC_014355	GTG	2	6	210355	210360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035628
4634	NC_014355	GGCC	2	8	210365	210372	0 %	0 %	50 %	50 %	302035628
4635	NC_014355	TGG	2	6	210377	210382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035628
4636	NC_014355	GCTC	2	8	210401	210408	0 %	25 %	25 %	50 %	302035628
4637	NC_014355	CGC	2	6	210626	210631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035628
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4640	NC_014355	GTTG	2	8	210711	210718	0 %	50 %	50 %	0 %	302035628
4641	NC_014355	GAG	2	6	210789	210794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035628
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4643	NC_014355	CTG	2	6	210894	210899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035628
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4647	NC_014355	A	6	6	211240	211245	100 %	0 %	0 %	0 %	302035628
4648	NC_014355	CG	3	6	211254	211259	0 %	0 %	50 %	50 %	302035628
4649	NC_014355	GCC	2	6	211276	211281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035628
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4654	NC_014355	TCC	2	6	211467	211472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035628
4655	NC_014355	CCG	2	6	211527	211532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035628
4656	NC_014355	TGG	2	6	211568	211573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035628
4657	NC_014355	GCG	2	6	211671	211676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035628
4658	NC_014355	CCT	2	6	211832	211837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4659	NC_014355	CGG	2	6	211915	211920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4660	NC_014355	CGC	2	6	211974	211979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4661	NC_014355	CAT	2	6	211981	211986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4662	NC_014355	GAT	2	6	212014	212019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_014355	CTGG	2	8	212101	212108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4664	NC_014355	GGA	2	6	212161	212166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_014355	TCG	2	6	212235	212240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4666	NC_014355	CGTG	2	8	212310	212317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4667	NC_014355	CCA	2	6	212327	212332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4668	NC_014355	TC	3	6	212349	212354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4669	NC_014355	CG	3	6	212399	212404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4670	NC_014355	TCAA	2	8	212468	212475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4671	NC_014355	TGC	2	6	212501	212506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4672	NC_014355	TCCT	2	8	212523	212530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4673	NC_014355	CAG	2	6	212544	212549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4674	NC_014355	CT	4	8	212570	212577	0 %	50 %	0 %	50 %	302035629
4675	NC_014355	TGC	2	6	212616	212621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035629
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4682	NC_014355	TCG	2	6	212904	212909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035629
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4713	NC_014355	GCCG	2	8	214377	214384	0 %	0 %	50 %	50 %	302035631
4714	NC_014355	GGA	2	6	214392	214397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302035631
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4734	NC_014355	GAT	2	6	215376	215381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035631
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4736	NC_014355	GAGC	2	8	215457	215464	25 %	0 %	50 %	25 %	302035631
4737	NC_014355	TCC	2	6	215525	215530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035631
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4739	NC_014355	TCG	2	6	215604	215609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4740	NC_014355	TGA	2	6	215620	215625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035632
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4742	NC_014355	GCG	2	6	215722	215727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302035632
4743	NC_014355	CAG	2	6	215760	215765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035632
4744	NC_014355	TCG	2	6	215767	215772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035632
4745	NC_014355	GCT	2	6	215813	215818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035632
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4747	NC_014355	GCCG	2	8	215858	215865	0 %	0 %	50 %	50 %	302035632
4748	NC_014355	CCT	2	6	215880	215885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035632
4749	NC_014355	CGA	2	6	215938	215943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035632
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4834	NC_014355	GCCAG	2	10	219599	219608	20 %	0 %	40 %	40 %	302035636
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4839	NC_014355	CT	3	6	219947	219952	0 %	50 %	0 %	50 %	302035636
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4864	NC_014355	CGA	2	6	221098	221103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302035638
4865	NC_014355	CGT	2	6	221216	221221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035638
4866	NC_014355	CCT	2	6	221262	221267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4867	NC_014355	GAAA	2	8	221292	221299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4868	NC_014355	AATG	2	8	221300	221307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4869	NC_014355	C	7	7	221338	221344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4870	NC_014355	TGC	2	6	221367	221372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4990	NC_014355	TCG	2	6	227417	227422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4991	NC_014355	CAC	2	6	227503	227508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302035646
4992	NC_014355	GGT	2	6	227520	227525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302035646
4993	NC_014355	TTC	2	6	227543	227548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302035646
4994	NC_014355	TCC	2	6	227564	227569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4995	NC_014355	CCT	2	6	227574	227579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4996	NC_014355	TCC	2	6	227585	227590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302035646
4997	NC_014355	ATG	2	6	227594	227599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035646
4998	NC_014355	TGC	2	6	227730	227735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302035646
4999	NC_014355	GCC	2	6	227766	227771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302035647
5000	NC_014355	TGA	2	6	227825	227830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302035647

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