MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_014329	CGT	2	6	1646346	1646351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858922
31003	NC_014329	TTC	2	6	1646352	1646357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858922
31004	NC_014329	TGT	3	9	1646375	1646383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300858922
31005	NC_014329	AAG	2	6	1646407	1646412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858922
31006	NC_014329	GCC	2	6	1646433	1646438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858922
31007	NC_014329	GCA	2	6	1646442	1646447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858922
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31010	NC_014329	TTTA	2	8	1646625	1646632	25 %	75 %	0 %	0 %	300858923
31011	NC_014329	GCT	2	6	1646642	1646647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858923
31012	NC_014329	AAT	2	6	1646652	1646657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858923
31013	NC_014329	CAC	2	6	1646763	1646768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858923
31014	NC_014329	GAG	2	6	1646784	1646789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300858923
31015	NC_014329	ATTA	2	8	1646862	1646869	50 %	50 %	0 %	0 %	300858923
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31051	NC_014329	TGA	2	6	1648605	1648610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858925
31052	NC_014329	CCA	2	6	1648640	1648645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858925
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31054	NC_014329	TAC	2	6	1648705	1648710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858925
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31091	NC_014329	CAA	2	6	1651243	1651248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31092	NC_014329	TA	3	6	1651340	1651345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_014329	TCT	2	6	1651347	1651352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31099	NC_014329	TAGG	2	8	1651606	1651613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31100	NC_014329	GAA	2	6	1651668	1651673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31103	NC_014329	A	6	6	1651867	1651872	100 %	0 %	0 %	0 %	300858929
31104	NC_014329	AGCA	2	8	1651878	1651885	50 %	0 %	25 %	25 %	300858929
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31113	NC_014329	CGT	2	6	1652640	1652645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31114	NC_014329	CGCGA	2	10	1652682	1652691	20 %	0 %	40 %	40 %	300858931
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31119	NC_014329	TACC	2	8	1653065	1653072	25 %	25 %	0 %	50 %	300858931
31120	NC_014329	AGA	2	6	1653178	1653183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858931
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31123	NC_014329	CGA	2	6	1653351	1653356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858931
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31125	NC_014329	AGC	2	6	1653586	1653591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858931
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31145	NC_014329	A	6	6	1654635	1654640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31146	NC_014329	ACG	2	6	1654673	1654678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31147	NC_014329	TCC	2	6	1654694	1654699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31148	NC_014329	TGC	2	6	1654760	1654765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858932
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31172	NC_014329	TC	3	6	1656433	1656438	0 %	50 %	0 %	50 %	300858932
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31178	NC_014329	T	7	7	1656633	1656639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31179	NC_014329	A	6	6	1656740	1656745	100 %	0 %	0 %	0 %	300858933
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31184	NC_014329	CTG	2	6	1656924	1656929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858933
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31223	NC_014329	TCC	2	6	1658739	1658744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31224	NC_014329	T	6	6	1658761	1658766	0 %	100 %	0 %	0 %	300858936
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31231	NC_014329	AG	3	6	1659088	1659093	50 %	0 %	50 %	0 %	300858936
31232	NC_014329	CTG	2	6	1659254	1659259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858936
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31353	NC_014329	TCC	2	6	1665292	1665297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31354	NC_014329	CAC	2	6	1665308	1665313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31355	NC_014329	AGGA	2	8	1665364	1665371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31356	NC_014329	AGACA	2	10	1665372	1665381	60 %	0 %	20 %	20 %	300858942
31357	NC_014329	GTA	2	6	1665424	1665429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858942
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31363	NC_014329	GGC	2	6	1665817	1665822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31364	NC_014329	GCC	2	6	1665829	1665834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31365	NC_014329	GCT	2	6	1665893	1665898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858943
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31371	NC_014329	CAG	2	6	1666215	1666220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858943
31372	NC_014329	CTT	2	6	1666233	1666238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858943
31373	NC_014329	AGCT	2	8	1666270	1666277	25 %	25 %	25 %	25 %	300858943
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31375	NC_014329	AT	3	6	1666370	1666375	50 %	50 %	0 %	0 %	300858943
31376	NC_014329	ATA	2	6	1666404	1666409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858943
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31381	NC_014329	CACG	2	8	1666566	1666573	25 %	0 %	25 %	50 %	300858943
31382	NC_014329	TCA	3	9	1666622	1666630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858943
31383	NC_014329	AGCGCA	2	12	1666664	1666675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858943
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31386	NC_014329	TCTTT	2	10	1666835	1666844	0 %	80 %	0 %	20 %	300858943
31387	NC_014329	TCC	2	6	1666953	1666958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858944
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31389	NC_014329	TCC	2	6	1666984	1666989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858944
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31435	NC_014329	AGAC	2	8	1669557	1669564	50 %	0 %	25 %	25 %	300858947
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31450	NC_014329	GCG	2	6	1670237	1670242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300858947
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31453	NC_014329	TCC	2	6	1670412	1670417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858948
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31456	NC_014329	GA	3	6	1670615	1670620	50 %	0 %	50 %	0 %	300858948
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31465	NC_014329	CA	4	8	1670994	1671001	50 %	0 %	0 %	50 %	300858948
31466	NC_014329	TCG	2	6	1671005	1671010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858948
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31469	NC_014329	TGA	2	6	1671239	1671244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858948
31470	NC_014329	TAA	2	6	1671285	1671290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300858948
31471	NC_014329	A	6	6	1671344	1671349	100 %	0 %	0 %	0 %	300858948
31472	NC_014329	TGC	2	6	1671441	1671446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858948
31473	NC_014329	AGA	2	6	1671634	1671639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858948
31474	NC_014329	CGC	2	6	1671793	1671798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300858949
31475	NC_014329	AAC	2	6	1671828	1671833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300858949
31476	NC_014329	TTGT	2	8	1671853	1671860	0 %	75 %	25 %	0 %	300858949
31477	NC_014329	AAG	2	6	1671890	1671895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858949
31478	NC_014329	CTGC	2	8	1671958	1671965	0 %	25 %	25 %	50 %	300858949
31479	NC_014329	GAT	2	6	1671989	1671994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300858949
31480	NC_014329	AGGC	2	8	1672006	1672013	25 %	0 %	50 %	25 %	300858949
31481	NC_014329	TCA	2	6	1672072	1672077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858949
31482	NC_014329	TCCA	2	8	1672098	1672105	25 %	25 %	0 %	50 %	300858949
31483	NC_014329	TGG	2	6	1672126	1672131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300858949
31484	NC_014329	CGA	2	6	1672138	1672143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300858949
31485	NC_014329	CATC	2	8	1672174	1672181	25 %	25 %	0 %	50 %	300858949
31486	NC_014329	TC	3	6	1672180	1672185	0 %	50 %	0 %	50 %	300858949
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31488	NC_014329	TTC	2	6	1672319	1672324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858950
31489	NC_014329	GTC	2	6	1672328	1672333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858950
31490	NC_014329	CTG	2	6	1672378	1672383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300858950
31491	NC_014329	AAGT	2	8	1672384	1672391	50 %	25 %	25 %	0 %	300858950
31492	NC_014329	TCT	2	6	1672407	1672412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300858950
31493	NC_014329	GAA	2	6	1672420	1672425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858950
31494	NC_014329	TCC	2	6	1672457	1672462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300858950
31495	NC_014329	ACC	2	6	1672494	1672499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858950
31496	NC_014329	CAT	2	6	1672585	1672590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300858950
31497	NC_014329	G	6	6	1672618	1672623	0 %	0 %	100 %	0 %	300858950
31498	NC_014329	CCA	2	6	1672672	1672677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300858950
31499	NC_014329	GATC	2	8	1672714	1672721	25 %	25 %	25 %	25 %	300858950
31500	NC_014329	GAA	2	6	1672741	1672746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300858950

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