MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 44198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014329	CGG	2	6	51784	51789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857470
1002	NC_014329	CTT	2	6	51856	51861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857470
1003	NC_014329	TGT	2	6	51904	51909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857470
1004	NC_014329	TGG	2	6	51919	51924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857470
1005	NC_014329	CGAT	2	8	51942	51949	25 %	25 %	25 %	25 %	300857470
1006	NC_014329	ATGA	2	8	52076	52083	50 %	25 %	25 %	0 %	300857470
1007	NC_014329	TGC	2	6	52088	52093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857470
1008	NC_014329	GCG	2	6	52131	52136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857470
1009	NC_014329	CAA	2	6	52165	52170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857470
1010	NC_014329	TCC	2	6	52412	52417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300857471
1011	NC_014329	CTGG	2	8	52477	52484	0 %	25 %	50 %	25 %	300857471
1012	NC_014329	GAT	2	6	52543	52548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857471
1013	NC_014329	GTG	2	6	52565	52570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857471
1014	NC_014329	TTC	2	6	52571	52576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857471
1015	NC_014329	TGT	2	6	52661	52666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014329	TTGGA	2	10	52672	52681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014329	AAC	2	6	52690	52695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014329	TTGAT	2	10	52707	52716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014329	CTT	2	6	52783	52788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014329	TGCAC	2	10	52801	52810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_014329	TGC	2	6	52814	52819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014329	TTG	3	9	52822	52830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014329	CGT	2	6	52831	52836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014329	GCC	2	6	52850	52855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_014329	AC	3	6	52930	52935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_014329	TTC	2	6	52997	53002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857472
1027	NC_014329	TTC	2	6	53006	53011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857472
1028	NC_014329	CTGGC	2	10	53060	53069	0 %	20 %	40 %	40 %	300857472
1029	NC_014329	TGG	2	6	53093	53098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857472
1030	NC_014329	TGC	2	6	53138	53143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857472
1031	NC_014329	TGG	2	6	53171	53176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857472
1032	NC_014329	TAA	2	6	53268	53273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857472
1033	NC_014329	GGC	2	6	53275	53280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857472
1034	NC_014329	TCG	2	6	53498	53503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857472
1035	NC_014329	CTGGCG	2	12	53515	53526	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300857472
1036	NC_014329	GCAGC	2	10	53559	53568	20 %	0 %	40 %	40 %	300857472
1037	NC_014329	GACTG	2	10	53575	53584	20 %	20 %	40 %	20 %	300857472
1038	NC_014329	ATG	2	6	53762	53767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857472
1039	NC_014329	ATGC	2	8	53798	53805	25 %	25 %	25 %	25 %	300857472
1040	NC_014329	GC	3	6	53928	53933	0 %	0 %	50 %	50 %	300857472
1041	NC_014329	GAA	2	6	53994	53999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857472
1042	NC_014329	TGAT	2	8	54032	54039	25 %	50 %	25 %	0 %	300857472
1043	NC_014329	AGC	2	6	54095	54100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857472
1044	NC_014329	CAAG	2	8	54117	54124	50 %	0 %	25 %	25 %	300857472
1045	NC_014329	TGG	3	9	54162	54170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857472
1046	NC_014329	AGC	2	6	54191	54196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857472
1047	NC_014329	ACTT	2	8	54208	54215	25 %	50 %	0 %	25 %	300857472
1048	NC_014329	AAT	3	9	54244	54252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857472
1049	NC_014329	T	6	6	54624	54629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014329	CCA	2	6	54670	54675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_014329	A	6	6	54683	54688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014329	GA	3	6	54742	54747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014329	ATC	2	6	54848	54853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857473
1054	NC_014329	CGG	2	6	54947	54952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857473
1055	NC_014329	TAG	2	6	55005	55010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857473
1056	NC_014329	AGT	2	6	55075	55080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857473
1057	NC_014329	T	6	6	55206	55211	0 %	100 %	0 %	0 %	300857473
1058	NC_014329	TGG	2	6	55273	55278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857473
1059	NC_014329	CGG	2	6	55282	55287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857473
1060	NC_014329	CCGT	2	8	55312	55319	0 %	25 %	25 %	50 %	300857473
1061	NC_014329	CGG	2	6	55355	55360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857473
1062	NC_014329	TG	3	6	55421	55426	0 %	50 %	50 %	0 %	300857474
1063	NC_014329	AGCA	2	8	55500	55507	50 %	0 %	25 %	25 %	300857474
1064	NC_014329	TA	3	6	55512	55517	50 %	50 %	0 %	0 %	300857474
1065	NC_014329	GCCGTG	2	12	55588	55599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300857474
1066	NC_014329	CGG	2	6	55637	55642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857474
1067	NC_014329	TAA	2	6	55667	55672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857474
1068	NC_014329	GC	4	8	55696	55703	0 %	0 %	50 %	50 %	300857474
1069	NC_014329	GTG	2	6	55793	55798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857474
1070	NC_014329	AAGGC	2	10	55816	55825	40 %	0 %	40 %	20 %	300857474
1071	NC_014329	GC	3	6	55856	55861	0 %	0 %	50 %	50 %	300857474
1072	NC_014329	CTA	2	6	55883	55888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857474
1073	NC_014329	GGC	2	6	55941	55946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857474
1074	NC_014329	CAC	2	6	56017	56022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857474
1075	NC_014329	CAG	2	6	56173	56178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857475
1076	NC_014329	AAG	2	6	56420	56425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857475
1077	NC_014329	CG	3	6	56569	56574	0 %	0 %	50 %	50 %	300857475
1078	NC_014329	GCGG	2	8	56579	56586	0 %	0 %	75 %	25 %	300857475
1079	NC_014329	TAA	2	6	56620	56625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300857475
1080	NC_014329	GCT	2	6	56655	56660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857475
1081	NC_014329	CGAC	2	8	56720	56727	25 %	0 %	25 %	50 %	300857476
1082	NC_014329	GAC	2	6	56730	56735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857476
1083	NC_014329	GTG	2	6	56774	56779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857476
1084	NC_014329	CAC	2	6	56896	56901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857476
1085	NC_014329	CAT	2	6	56934	56939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857476
1086	NC_014329	CAC	4	12	56944	56955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857476
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1088	NC_014329	GC	3	6	57002	57007	0 %	0 %	50 %	50 %	300857476
1089	NC_014329	CATC	2	8	57039	57046	25 %	25 %	0 %	50 %	300857476
1090	NC_014329	GCT	3	9	57093	57101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857476
1091	NC_014329	CCG	2	6	57104	57109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857476
1092	NC_014329	GAGG	2	8	57252	57259	25 %	0 %	75 %	0 %	300857476
1093	NC_014329	GCC	2	6	57262	57267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857476
1094	NC_014329	GGA	2	6	57409	57414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857476
1095	NC_014329	CAA	2	6	57417	57422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300857476
1096	NC_014329	GGT	2	6	57427	57432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857476
1097	NC_014329	GTT	2	6	57460	57465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857476
1098	NC_014329	CTG	2	6	57507	57512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857476
1099	NC_014329	ATTG	2	8	57587	57594	25 %	50 %	25 %	0 %	300857476
1100	NC_014329	TGG	2	6	57723	57728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014329	CAT	2	6	57768	57773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014329	AGC	2	6	57800	57805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014329	TTGG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014329	TGC	3	9	57867	57875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014329	TCT	2	6	57962	57967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857477
1106	NC_014329	TCG	2	6	58021	58026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857477
1107	NC_014329	TTG	2	6	58096	58101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300857477
1108	NC_014329	TCT	2	6	58250	58255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857478
1109	NC_014329	TCA	2	6	58268	58273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300857478
1110	NC_014329	TGCGCG	2	12	58286	58297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300857478
1111	NC_014329	CGC	2	6	58344	58349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857478
1112	NC_014329	GC	3	6	58352	58357	0 %	0 %	50 %	50 %	300857478
1113	NC_014329	GCC	2	6	58378	58383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857478
1114	NC_014329	GAA	2	6	58417	58422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300857478
1115	NC_014329	CAG	2	6	58426	58431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857478
1116	NC_014329	TC	3	6	58436	58441	0 %	50 %	0 %	50 %	300857478
1117	NC_014329	TGA	2	6	58491	58496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857478
1118	NC_014329	AGGG	2	8	58576	58583	25 %	0 %	75 %	0 %	300857478
1119	NC_014329	GGA	2	6	58644	58649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300857478
1120	NC_014329	ATGGC	2	10	58676	58685	20 %	20 %	40 %	20 %	300857478
1121	NC_014329	TGC	2	6	58690	58695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857478
1122	NC_014329	CG	3	6	58771	58776	0 %	0 %	50 %	50 %	300857478
1123	NC_014329	GTC	2	6	58795	58800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857478
1124	NC_014329	ACG	2	6	58831	58836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300857478
1125	NC_014329	GTG	2	6	59038	59043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300857478
1126	NC_014329	T	6	6	59125	59130	0 %	100 %	0 %	0 %	300857478
1127	NC_014329	TCT	2	6	59213	59218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857478
1128	NC_014329	TCT	2	6	59250	59255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300857478
1129	NC_014329	CAC	2	6	59266	59271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300857478
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1138	NC_014329	GAG	2	6	59716	59721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1169	NC_014329	CTTT	2	8	61446	61453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1182	NC_014329	CATG	2	8	62120	62127	25 %	25 %	25 %	25 %	300857482
1183	NC_014329	CG	3	6	62218	62223	0 %	0 %	50 %	50 %	300857482
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1220	NC_014329	ACT	2	6	64542	64547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1222	NC_014329	AAT	2	6	64730	64735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1223	NC_014329	ATT	2	6	64767	64772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1244	NC_014329	CTG	2	6	65793	65798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857484
1245	NC_014329	GC	3	6	65855	65860	0 %	0 %	50 %	50 %	300857484
1246	NC_014329	CGC	2	6	65912	65917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300857484
1247	NC_014329	TTG	2	6	65969	65974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_014329	CG	3	6	66015	66020	0 %	0 %	50 %	50 %	300857485
1249	NC_014329	TCG	2	6	66028	66033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300857485
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1254	NC_014329	GAT	3	9	66135	66143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300857485
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1263	NC_014329	GGC	2	6	66891	66896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300857485
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1362	NC_014329	A	8	8	71873	71880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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