MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 13478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	AATG	2	8	100	107	50 %	25 %	25 %	0 %	300853233
2	NC_014328	ATTA	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	300853233
3	NC_014328	ATGC	2	8	587	594	25 %	25 %	25 %	25 %	300853233
4	NC_014328	AAAT	2	8	712	719	75 %	25 %	0 %	0 %	300853233
5	NC_014328	AAAG	2	8	770	777	75 %	0 %	25 %	0 %	300853233
6	NC_014328	TCTA	2	8	838	845	25 %	50 %	0 %	25 %	300853233
7	NC_014328	TAAT	2	8	1652	1659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014328	AAAT	2	8	1876	1883	75 %	25 %	0 %	0 %	300853234
9	NC_014328	ATGA	2	8	2841	2848	50 %	25 %	25 %	0 %	300853235
10	NC_014328	TAAA	2	8	3430	3437	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
11	NC_014328	GAAA	2	8	3603	3610	75 %	0 %	25 %	0 %	300853236
12	NC_014328	AAAT	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	300853236
13	NC_014328	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	300853236
14	NC_014328	TCAT	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	300853237
15	NC_014328	TAAA	2	8	4414	4421	75 %	25 %	0 %	0 %	300853237
16	NC_014328	ATTT	2	8	4431	4438	25 %	75 %	0 %	0 %	300853237
17	NC_014328	AATG	2	8	5872	5879	50 %	25 %	25 %	0 %	300853238
18	NC_014328	TAAA	2	8	5973	5980	75 %	25 %	0 %	0 %	300853238
19	NC_014328	ACTT	2	8	6049	6056	25 %	50 %	0 %	25 %	300853238
20	NC_014328	TATG	2	8	6597	6604	25 %	50 %	25 %	0 %	300853239
21	NC_014328	AATA	2	8	6855	6862	75 %	25 %	0 %	0 %	300853239
22	NC_014328	AGAT	2	8	7292	7299	50 %	25 %	25 %	0 %	300853239
23	NC_014328	AATT	2	8	7850	7857	50 %	50 %	0 %	0 %	300853239
24	NC_014328	TATT	2	8	8078	8085	25 %	75 %	0 %	0 %	300853239
25	NC_014328	TAAA	2	8	8954	8961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014328	TATT	2	8	8993	9000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014328	GTAT	2	8	9071	9078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	ACCT	2	8	9539	9546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014328	GTGA	2	8	9817	9824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014328	ATCT	2	8	10952	10959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014328	TAAG	2	8	10975	10982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014328	AGAT	2	8	11017	11024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014328	AGAA	2	8	11429	11436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014328	GGAA	2	8	12457	12464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014328	ATGT	2	8	12697	12704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014328	AGGT	2	8	12850	12857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014328	TGCT	2	8	13235	13242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014328	GCCA	2	8	13345	13352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014328	GACC	2	8	13876	13883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014328	CTGA	2	8	14067	14074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014328	GAAA	2	8	14109	14116	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014328	TAAT	2	8	15172	15179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014328	TAAA	2	8	15592	15599	75 %	25 %	0 %	0 %	300853241
44	NC_014328	TTTA	2	8	15950	15957	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
45	NC_014328	TTAT	2	8	16260	16267	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
46	NC_014328	TATT	2	8	16582	16589	25 %	75 %	0 %	0 %	300853242
47	NC_014328	ATAA	2	8	16848	16855	75 %	25 %	0 %	0 %	300853242
48	NC_014328	ATAG	2	8	16944	16951	50 %	25 %	25 %	0 %	300853242
49	NC_014328	GGAT	2	8	17971	17978	25 %	25 %	50 %	0 %	300853242
50	NC_014328	ATTG	2	8	18662	18669	25 %	50 %	25 %	0 %	300853243
51	NC_014328	TACT	2	8	18834	18841	25 %	50 %	0 %	25 %	300853243
52	NC_014328	AAAG	2	8	18855	18862	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
53	NC_014328	TGTA	2	8	18879	18886	25 %	50 %	25 %	0 %	300853243
54	NC_014328	AAAG	2	8	18977	18984	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
55	NC_014328	CTAT	2	8	18985	18992	25 %	50 %	0 %	25 %	300853243
56	NC_014328	AAAC	2	8	19589	19596	75 %	0 %	0 %	25 %	300853243
57	NC_014328	GAAA	2	8	19671	19678	75 %	0 %	25 %	0 %	300853243
58	NC_014328	GGTA	2	8	19934	19941	25 %	25 %	50 %	0 %	300853243
59	NC_014328	TTAA	2	8	20434	20441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014328	TTAA	2	8	20599	20606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014328	CTTT	2	8	22322	22329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014328	TAAA	2	8	23594	23601	75 %	25 %	0 %	0 %	300853246
63	NC_014328	TACA	2	8	23756	23763	50 %	25 %	0 %	25 %	300853246
64	NC_014328	AGTT	2	8	23948	23955	25 %	50 %	25 %	0 %	300853246
65	NC_014328	AATT	2	8	24199	24206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014328	TAAG	2	8	24318	24325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014328	AGTT	2	8	24551	24558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014328	CATA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	0 %	25 %	300853247
69	NC_014328	ATTA	2	8	24912	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
70	NC_014328	TTAA	2	8	25072	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
71	NC_014328	TAAG	2	8	25158	25165	50 %	25 %	25 %	0 %	300853247
72	NC_014328	TTAT	2	8	27553	27560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014328	TACT	2	8	27605	27612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014328	AATT	2	8	27737	27744	50 %	50 %	0 %	0 %	300853252
75	NC_014328	ATAA	2	8	27891	27898	75 %	25 %	0 %	0 %	300853252
76	NC_014328	AGAA	2	8	28064	28071	75 %	0 %	25 %	0 %	300853252
77	NC_014328	ACAA	2	8	28304	28311	75 %	0 %	0 %	25 %	300853253
78	NC_014328	AATG	2	8	28436	28443	50 %	25 %	25 %	0 %	300853254
79	NC_014328	GAAA	2	8	28523	28530	75 %	0 %	25 %	0 %	300853254
80	NC_014328	TAAA	2	8	28681	28688	75 %	25 %	0 %	0 %	300853254
81	NC_014328	CAAG	2	8	28856	28863	50 %	0 %	25 %	25 %	300853254
82	NC_014328	AGTT	2	8	28894	28901	25 %	50 %	25 %	0 %	300853254
83	NC_014328	GAAA	2	8	28955	28962	75 %	0 %	25 %	0 %	300853254
84	NC_014328	ATGA	2	8	29004	29011	50 %	25 %	25 %	0 %	300853254
85	NC_014328	AATG	2	8	29459	29466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014328	TTAA	2	8	29493	29500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014328	ATAA	2	8	29585	29592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014328	ATGG	2	8	29801	29808	25 %	25 %	50 %	0 %	300853255
89	NC_014328	TATT	2	8	31484	31491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014328	AATA	2	8	31586	31593	75 %	25 %	0 %	0 %	300853258
91	NC_014328	TAAA	2	8	32440	32447	75 %	25 %	0 %	0 %	300853260
92	NC_014328	AGAT	2	8	32458	32465	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
93	NC_014328	AAGT	2	8	32498	32505	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
94	NC_014328	ATGG	2	8	32548	32555	25 %	25 %	50 %	0 %	300853260
95	NC_014328	AAAG	2	8	32559	32566	75 %	0 %	25 %	0 %	300853260
96	NC_014328	GCAG	2	8	33260	33267	25 %	0 %	50 %	25 %	300853260
97	NC_014328	ATGA	2	8	33309	33316	50 %	25 %	25 %	0 %	300853260
98	NC_014328	AATT	2	8	33469	33476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014328	AAGT	2	8	33583	33590	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
100	NC_014328	GTAA	2	8	33800	33807	50 %	25 %	25 %	0 %	300853261
101	NC_014328	TATG	2	8	33966	33973	25 %	50 %	25 %	0 %	300853261
102	NC_014328	ATTT	2	8	34131	34138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014328	AGTA	2	8	34407	34414	50 %	25 %	25 %	0 %	300853262
104	NC_014328	TAAA	2	8	34547	34554	75 %	25 %	0 %	0 %	300853262
105	NC_014328	AATA	2	8	34770	34777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014328	TTTA	2	8	34919	34926	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
107	NC_014328	ATTT	2	8	35222	35229	25 %	75 %	0 %	0 %	300853263
108	NC_014328	GTTT	2	8	35338	35345	0 %	75 %	25 %	0 %	300853263
109	NC_014328	ATTT	2	8	35766	35773	25 %	75 %	0 %	0 %	300853264
110	NC_014328	TTAA	2	8	35774	35781	50 %	50 %	0 %	0 %	300853264
111	NC_014328	CTTT	2	8	35874	35881	0 %	75 %	0 %	25 %	300853264
112	NC_014328	AATA	2	8	36151	36158	75 %	25 %	0 %	0 %	300853264
113	NC_014328	TAAA	2	8	36836	36843	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
114	NC_014328	AATA	2	8	36900	36907	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
115	NC_014328	TAAA	2	8	36932	36939	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
116	NC_014328	TAAA	2	8	37004	37011	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
117	NC_014328	AATT	2	8	37640	37647	50 %	50 %	0 %	0 %	300853265
118	NC_014328	TAAA	2	8	37721	37728	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
119	NC_014328	ATGA	2	8	37909	37916	50 %	25 %	25 %	0 %	300853265
120	NC_014328	TAAA	2	8	37934	37941	75 %	25 %	0 %	0 %	300853265
121	NC_014328	TAGA	2	8	39053	39060	50 %	25 %	25 %	0 %	300853265
122	NC_014328	GAAG	2	8	39193	39200	50 %	0 %	50 %	0 %	300853265
123	NC_014328	GTTG	2	8	39590	39597	0 %	50 %	50 %	0 %	300853265
124	NC_014328	ATAC	2	8	39653	39660	50 %	25 %	0 %	25 %	300853265
125	NC_014328	CATC	2	8	39682	39689	25 %	25 %	0 %	50 %	300853265
126	NC_014328	ATTA	2	8	40187	40194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014328	AATA	2	8	40199	40206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014328	AAAT	2	8	40220	40227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014328	TAAT	2	8	40704	40711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014328	AAAT	2	8	40858	40865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014328	AATT	2	8	41039	41046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014328	AATG	2	8	41210	41217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014328	AACA	2	8	41336	41343	75 %	0 %	0 %	25 %	300853266
134	NC_014328	AATA	2	8	42058	42065	75 %	25 %	0 %	0 %	300853266
135	NC_014328	CTAA	2	8	42127	42134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014328	TAAA	2	8	42139	42146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014328	ATAA	2	8	42318	42325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014328	ACAT	2	8	42577	42584	50 %	25 %	0 %	25 %	300853267
139	NC_014328	AGCA	2	8	42986	42993	50 %	0 %	25 %	25 %	300853268
140	NC_014328	AAAG	2	8	43007	43014	75 %	0 %	25 %	0 %	300853268
141	NC_014328	AATT	2	8	43349	43356	50 %	50 %	0 %	0 %	300853268
142	NC_014328	AATT	2	8	43495	43502	50 %	50 %	0 %	0 %	300853268
143	NC_014328	ATTC	2	8	43552	43559	25 %	50 %	0 %	25 %	300853268
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145	NC_014328	CAAT	2	8	44319	44326	50 %	25 %	0 %	25 %	300853268
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