MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014328	GTA	2	6	142882	142887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853348
3502	NC_014328	ATA	2	6	142946	142951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853349
3503	NC_014328	A	6	6	142978	142983	100 %	0 %	0 %	0 %	300853349
3504	NC_014328	TCT	2	6	143050	143055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853349
3505	NC_014328	AT	3	6	143076	143081	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3506	NC_014328	A	6	6	143086	143091	100 %	0 %	0 %	0 %	300853349
3507	NC_014328	AGA	2	6	143158	143163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853349
3508	NC_014328	A	6	6	143167	143172	100 %	0 %	0 %	0 %	300853349
3509	NC_014328	AGA	2	6	143179	143184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853349
3510	NC_014328	AATA	2	8	143185	143192	75 %	25 %	0 %	0 %	300853349
3511	NC_014328	A	6	6	143192	143197	100 %	0 %	0 %	0 %	300853349
3512	NC_014328	A	6	6	143213	143218	100 %	0 %	0 %	0 %	300853349
3513	NC_014328	TAA	2	6	143220	143225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853349
3514	NC_014328	TA	3	6	143229	143234	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3515	NC_014328	AGC	2	6	143254	143259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853349
3516	NC_014328	TTA	2	6	143270	143275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853349
3517	NC_014328	TA	3	6	143370	143375	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3518	NC_014328	T	6	6	143410	143415	0 %	100 %	0 %	0 %	300853349
3519	NC_014328	GAA	2	6	143444	143449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853349
3520	NC_014328	ATTT	2	8	143500	143507	25 %	75 %	0 %	0 %	300853349
3521	NC_014328	AT	3	6	143511	143516	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3522	NC_014328	AT	3	6	143547	143552	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3523	NC_014328	TA	3	6	143603	143608	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3524	NC_014328	GGA	2	6	143629	143634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853349
3525	NC_014328	AT	3	6	143656	143661	50 %	50 %	0 %	0 %	300853349
3526	NC_014328	TAT	2	6	143704	143709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853349
3527	NC_014328	TAA	2	6	143761	143766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853349
3528	NC_014328	ATT	2	6	143777	143782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853349
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3530	NC_014328	AT	3	6	143922	143927	50 %	50 %	0 %	0 %	300853350
3531	NC_014328	TAG	2	6	143974	143979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853350
3532	NC_014328	GT	3	6	144008	144013	0 %	50 %	50 %	0 %	300853350
3533	NC_014328	AG	4	8	144033	144040	50 %	0 %	50 %	0 %	300853350
3534	NC_014328	CAC	2	6	144052	144057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853350
3535	NC_014328	AGA	3	9	144083	144091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853350
3536	NC_014328	AT	3	6	144139	144144	50 %	50 %	0 %	0 %	300853350
3537	NC_014328	A	6	6	144151	144156	100 %	0 %	0 %	0 %	300853350
3538	NC_014328	ACA	3	9	144158	144166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853350
3539	NC_014328	ACA	2	6	144208	144213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853350
3540	NC_014328	GACG	2	8	144240	144247	25 %	0 %	50 %	25 %	300853350
3541	NC_014328	TGT	2	6	144375	144380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853350
3542	NC_014328	CTA	2	6	144451	144456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853350
3543	NC_014328	TGT	2	6	144486	144491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853350
3544	NC_014328	A	6	6	144517	144522	100 %	0 %	0 %	0 %	300853350
3545	NC_014328	TAGT	2	8	144553	144560	25 %	50 %	25 %	0 %	300853350
3546	NC_014328	GTA	2	6	144597	144602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853350
3547	NC_014328	TGA	2	6	144641	144646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853350
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3549	NC_014328	AGG	2	6	144689	144694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853350
3550	NC_014328	TGA	2	6	144731	144736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853350
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3553	NC_014328	AGG	2	6	144785	144790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853350
3554	NC_014328	TAA	2	6	144843	144848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853351
3555	NC_014328	AGT	2	6	144868	144873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853351
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3557	NC_014328	AGTA	2	8	144915	144922	50 %	25 %	25 %	0 %	300853351
3558	NC_014328	AGA	2	6	144972	144977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853351
3559	NC_014328	TAT	2	6	144992	144997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853351
3560	NC_014328	T	6	6	145039	145044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014328	CCT	2	6	145098	145103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_014328	A	6	6	145112	145117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014328	TTTC	2	8	145144	145151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_014328	AGG	2	6	145228	145233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014328	GAA	2	6	145407	145412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853352
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3567	NC_014328	AGG	2	6	145424	145429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014328	TA	3	6	145455	145460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014328	AAT	2	6	145500	145505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014328	ATAG	2	8	145510	145517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014328	TAAA	2	8	145523	145530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014328	AT	3	6	145569	145574	50 %	50 %	0 %	0 %	300853353
3573	NC_014328	TGT	2	6	145576	145581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853353
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3576	NC_014328	CGG	2	6	145657	145662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300853353
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3580	NC_014328	A	7	7	145894	145900	100 %	0 %	0 %	0 %	300853353
3581	NC_014328	GTA	2	6	145913	145918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853353
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3583	NC_014328	AGG	2	6	146017	146022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853353
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3589	NC_014328	A	6	6	146220	146225	100 %	0 %	0 %	0 %	300853353
3590	NC_014328	TA	3	6	146247	146252	50 %	50 %	0 %	0 %	300853353
3591	NC_014328	AAG	2	6	146256	146261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853353
3592	NC_014328	ATGG	2	8	146336	146343	25 %	25 %	50 %	0 %	300853353
3593	NC_014328	GAA	3	9	146358	146366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853353
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3595	NC_014328	GATG	2	8	146402	146409	25 %	25 %	50 %	0 %	300853354
3596	NC_014328	CTT	2	6	146434	146439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853354
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3598	NC_014328	ATA	2	6	146492	146497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853354
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3600	NC_014328	GAG	2	6	146528	146533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853354
3601	NC_014328	AAT	2	6	146541	146546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853354
3602	NC_014328	ATA	2	6	146555	146560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853354
3603	NC_014328	GAA	2	6	146620	146625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853354
3604	NC_014328	AAAT	2	8	146643	146650	75 %	25 %	0 %	0 %	300853354
3605	NC_014328	A	6	6	146661	146666	100 %	0 %	0 %	0 %	300853354
3606	NC_014328	AGAT	2	8	146720	146727	50 %	25 %	25 %	0 %	300853354
3607	NC_014328	TTG	2	6	146738	146743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853354
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3609	NC_014328	AAT	2	6	146893	146898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853354
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3613	NC_014328	CAA	2	6	147196	147201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853354
3614	NC_014328	TAGT	2	8	147211	147218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014328	TATT	2	8	147226	147233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014328	ATTTT	2	10	147255	147264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014328	T	6	6	147261	147266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014328	ACA	2	6	147302	147307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_014328	TATTT	2	10	147308	147317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014328	AAAT	2	8	147353	147360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014328	TGA	2	6	147405	147410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853355
3622	NC_014328	GAT	2	6	147418	147423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853355
3623	NC_014328	AAAT	2	8	147428	147435	75 %	25 %	0 %	0 %	300853355
3624	NC_014328	TAT	2	6	147444	147449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853355
3625	NC_014328	A	8	8	147454	147461	100 %	0 %	0 %	0 %	300853355
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3879	NC_014328	TAGT	2	8	156509	156516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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