MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014328	AGA	2	6	121501	121506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853335
3002	NC_014328	ATT	2	6	121508	121513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3003	NC_014328	A	6	6	121548	121553	100 %	0 %	0 %	0 %	300853335
3004	NC_014328	TAG	2	6	121591	121596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853335
3005	NC_014328	AT	3	6	121667	121672	50 %	50 %	0 %	0 %	300853335
3006	NC_014328	ACAA	2	8	121706	121713	75 %	0 %	0 %	25 %	300853335
3007	NC_014328	ACA	2	6	121733	121738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853335
3008	NC_014328	TA	3	6	121751	121756	50 %	50 %	0 %	0 %	300853335
3009	NC_014328	ATG	2	6	121794	121799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853335
3010	NC_014328	TAT	2	6	121815	121820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3011	NC_014328	GAA	2	6	121828	121833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853335
3012	NC_014328	AGC	2	6	121850	121855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853335
3013	NC_014328	A	6	6	121861	121866	100 %	0 %	0 %	0 %	300853335
3014	NC_014328	CA	3	6	121875	121880	50 %	0 %	0 %	50 %	300853335
3015	NC_014328	TAA	2	6	121945	121950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853335
3016	NC_014328	TAT	2	6	121975	121980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3017	NC_014328	GAT	2	6	122027	122032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853335
3018	NC_014328	G	6	6	122038	122043	0 %	0 %	100 %	0 %	300853335
3019	NC_014328	TTA	2	6	122142	122147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3020	NC_014328	ACT	2	6	122221	122226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853335
3021	NC_014328	ATG	2	6	122289	122294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853335
3022	NC_014328	AGA	2	6	122347	122352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853335
3023	NC_014328	ATT	2	6	122360	122365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3024	NC_014328	TGA	2	6	122371	122376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853335
3025	NC_014328	CAA	2	6	122388	122393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853335
3026	NC_014328	TGC	2	6	122449	122454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853335
3027	NC_014328	ATT	2	6	122462	122467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3028	NC_014328	ATTA	2	8	122470	122477	50 %	50 %	0 %	0 %	300853335
3029	NC_014328	ATA	3	9	122478	122486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853335
3030	NC_014328	TTA	2	6	122532	122537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853335
3031	NC_014328	AATTTA	2	12	122554	122565	50 %	50 %	0 %	0 %	300853335
3032	NC_014328	ATA	2	6	122571	122576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014328	T	6	6	122621	122626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014328	A	7	7	122629	122635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014328	TAA	2	6	122637	122642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014328	AAAAT	2	10	122684	122693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014328	ATT	3	9	122719	122727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014328	AGG	2	6	122761	122766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014328	GAT	2	6	122808	122813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014328	A	6	6	122945	122950	100 %	0 %	0 %	0 %	300853336
3041	NC_014328	GTTA	2	8	122951	122958	25 %	50 %	25 %	0 %	300853336
3042	NC_014328	TTA	3	9	122956	122964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853336
3043	NC_014328	TA	3	6	123003	123008	50 %	50 %	0 %	0 %	300853336
3044	NC_014328	TA	3	6	123039	123044	50 %	50 %	0 %	0 %	300853336
3045	NC_014328	TAA	2	6	123111	123116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853336
3046	NC_014328	TGA	2	6	123262	123267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853336
3047	NC_014328	A	7	7	123283	123289	100 %	0 %	0 %	0 %	300853336
3048	NC_014328	ATC	2	6	123369	123374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853336
3049	NC_014328	TATAA	2	10	123428	123437	60 %	40 %	0 %	0 %	300853336
3050	NC_014328	GAAAT	2	10	123453	123462	60 %	20 %	20 %	0 %	300853336
3051	NC_014328	CAG	2	6	123492	123497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853336
3052	NC_014328	A	7	7	123508	123514	100 %	0 %	0 %	0 %	300853336
3053	NC_014328	GCT	2	6	123524	123529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853336
3054	NC_014328	AGT	2	6	123578	123583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853336
3055	NC_014328	CAT	2	6	123711	123716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853336
3056	NC_014328	TGA	2	6	123727	123732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853336
3057	NC_014328	A	6	6	123739	123744	100 %	0 %	0 %	0 %	300853336
3058	NC_014328	A	6	6	123775	123780	100 %	0 %	0 %	0 %	300853336
3059	NC_014328	GAA	2	6	123785	123790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853336
3060	NC_014328	GAATG	2	10	123815	123824	40 %	20 %	40 %	0 %	300853336
3061	NC_014328	CGA	2	6	123859	123864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853336
3062	NC_014328	GAC	2	6	123877	123882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853336
3063	NC_014328	GAA	2	6	123911	123916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853336
3064	NC_014328	TGG	2	6	123967	123972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853336
3065	NC_014328	TAA	2	6	123987	123992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853336
3066	NC_014328	AATT	2	8	124029	124036	50 %	50 %	0 %	0 %	300853336
3067	NC_014328	GGA	2	6	124070	124075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853336
3068	NC_014328	TTA	2	6	124093	124098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853336
3069	NC_014328	TAG	2	6	124194	124199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853336
3070	NC_014328	AGC	2	6	124201	124206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853336
3071	NC_014328	TGA	2	6	124228	124233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853336
3072	NC_014328	TAT	2	6	124332	124337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853336
3073	NC_014328	GTT	2	6	124430	124435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853336
3074	NC_014328	CTT	2	6	124611	124616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853337
3075	NC_014328	TGT	2	6	124648	124653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3076	NC_014328	CTG	2	6	124662	124667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853337
3077	NC_014328	TAT	2	6	124669	124674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853337
3078	NC_014328	TAT	2	6	124681	124686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853337
3079	NC_014328	GTT	2	6	124687	124692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3080	NC_014328	GTT	2	6	124698	124703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3081	NC_014328	TTG	2	6	124737	124742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3082	NC_014328	TGT	2	6	124804	124809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3083	NC_014328	AG	3	6	124962	124967	50 %	0 %	50 %	0 %	300853337
3084	NC_014328	ATTT	2	8	125046	125053	25 %	75 %	0 %	0 %	300853337
3085	NC_014328	GGA	2	6	125054	125059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853337
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3087	NC_014328	AGT	2	6	125098	125103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853337
3088	NC_014328	TAT	3	9	125109	125117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853337
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3090	NC_014328	A	6	6	125169	125174	100 %	0 %	0 %	0 %	300853337
3091	NC_014328	AAAT	2	8	125209	125216	75 %	25 %	0 %	0 %	300853337
3092	NC_014328	T	6	6	125237	125242	0 %	100 %	0 %	0 %	300853337
3093	NC_014328	GTA	2	6	125277	125282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853337
3094	NC_014328	TAT	2	6	125288	125293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853337
3095	NC_014328	TCT	2	6	125302	125307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853337
3096	NC_014328	TTC	2	6	125314	125319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853337
3097	NC_014328	GGA	2	6	125327	125332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853337
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3099	NC_014328	GGT	2	6	125444	125449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853337
3100	NC_014328	AAT	2	6	125461	125466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853337
3101	NC_014328	GTT	2	6	125486	125491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853337
3102	NC_014328	AGG	2	6	125536	125541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853337
3103	NC_014328	ATT	2	6	125551	125556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853337
3104	NC_014328	GGAT	2	8	125672	125679	25 %	25 %	50 %	0 %	300853337
3105	NC_014328	GGA	2	6	125690	125695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853337
3106	NC_014328	AAT	3	9	125767	125775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853337
3107	NC_014328	AT	3	6	125774	125779	50 %	50 %	0 %	0 %	300853337
3108	NC_014328	ATTAT	2	10	125789	125798	40 %	60 %	0 %	0 %	300853337
3109	NC_014328	TAA	2	6	125885	125890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853337
3110	NC_014328	AATAA	2	10	125964	125973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014328	AAAT	2	8	125975	125982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014328	AAG	2	6	125983	125988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014328	ATA	2	6	125992	125997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014328	T	7	7	126018	126024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014328	GAT	2	6	126034	126039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014328	CT	3	6	126041	126046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_014328	T	6	6	126050	126055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_014328	ATA	2	6	126093	126098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014328	A	6	6	126157	126162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014328	ATT	2	6	126187	126192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014328	TAA	2	6	126287	126292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014328	T	6	6	126314	126319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014328	TTAAAT	2	12	126349	126360	50 %	50 %	0 %	0 %	300853338
3124	NC_014328	TAT	2	6	126388	126393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853338
3125	NC_014328	AAGTAC	2	12	126437	126448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300853338
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3239	NC_014328	ATC	2	6	131654	131659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3242	NC_014328	AC	3	6	131849	131854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_014328	AGG	2	6	131906	131911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_014328	CCT	2	6	131988	131993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3245	NC_014328	ATCT	2	8	132021	132028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3246	NC_014328	TAAG	2	8	132044	132051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_014328	ATT	2	6	132083	132088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_014328	ATT	2	6	132146	132151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_014328	A	6	6	132164	132169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_014328	TAAAG	2	10	132204	132213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_014328	GTA	2	6	132236	132241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3254	NC_014328	ATA	2	6	132268	132273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3256	NC_014328	GGA	2	6	132436	132441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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