MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014328	TTC	2	6	58171	58176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853284
1502	NC_014328	ATT	2	6	58177	58182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853284
1503	NC_014328	T	6	6	58181	58186	0 %	100 %	0 %	0 %	300853284
1504	NC_014328	AG	3	6	58264	58269	50 %	0 %	50 %	0 %	300853284
1505	NC_014328	T	6	6	58271	58276	0 %	100 %	0 %	0 %	300853284
1506	NC_014328	AGAA	2	8	58281	58288	75 %	0 %	25 %	0 %	300853284
1507	NC_014328	ATA	2	6	58312	58317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853284
1508	NC_014328	TGTTAA	2	12	58362	58373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300853284
1509	NC_014328	TGAC	2	8	58385	58392	25 %	25 %	25 %	25 %	300853284
1510	NC_014328	AT	3	6	58403	58408	50 %	50 %	0 %	0 %	300853284
1511	NC_014328	ACC	2	6	58447	58452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014328	TTA	2	6	58501	58506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014328	AAAT	2	8	58537	58544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014328	T	8	8	58592	58599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014328	TGACA	2	10	58629	58638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_014328	A	6	6	58638	58643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014328	ATT	2	6	58651	58656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014328	TA	3	6	58691	58696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014328	AAT	2	6	58715	58720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014328	ATT	2	6	58756	58761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014328	ATT	2	6	58799	58804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014328	AGT	2	6	58806	58811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014328	AT	3	6	58892	58897	50 %	50 %	0 %	0 %	300853285
1524	NC_014328	A	6	6	58899	58904	100 %	0 %	0 %	0 %	300853285
1525	NC_014328	GTT	2	6	58923	58928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853285
1526	NC_014328	TAAA	2	8	58966	58973	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
1527	NC_014328	TTA	2	6	59017	59022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853285
1528	NC_014328	CTATG	2	10	59042	59051	20 %	40 %	20 %	20 %	300853285
1529	NC_014328	AGGA	2	8	59064	59071	50 %	0 %	50 %	0 %	300853285
1530	NC_014328	TAAA	2	8	59098	59105	75 %	25 %	0 %	0 %	300853285
1531	NC_014328	TTA	2	6	59116	59121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853285
1532	NC_014328	AGA	2	6	59144	59149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853285
1533	NC_014328	GAT	2	6	59190	59195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1534	NC_014328	ATC	2	6	59202	59207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853285
1535	NC_014328	ATTT	2	8	59286	59293	25 %	75 %	0 %	0 %	300853285
1536	NC_014328	TTG	2	6	59371	59376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853285
1537	NC_014328	AATT	2	8	59416	59423	50 %	50 %	0 %	0 %	300853285
1538	NC_014328	TGA	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1539	NC_014328	TTCT	2	8	59494	59501	0 %	75 %	0 %	25 %	300853285
1540	NC_014328	AGC	2	6	59594	59599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853285
1541	NC_014328	AGC	2	6	59627	59632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853285
1542	NC_014328	A	7	7	59669	59675	100 %	0 %	0 %	0 %	300853285
1543	NC_014328	ATG	2	6	59679	59684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853285
1544	NC_014328	CTC	2	6	59719	59724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853285
1545	NC_014328	CAATT	2	10	59750	59759	40 %	40 %	0 %	20 %	300853285
1546	NC_014328	AAT	2	6	59797	59802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853285
1547	NC_014328	AG	3	6	59850	59855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014328	TTA	2	6	59862	59867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1549	NC_014328	GAA	2	6	59891	59896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1550	NC_014328	ATGGG	2	10	60020	60029	20 %	20 %	60 %	0 %	300853286
1551	NC_014328	GTG	2	6	60048	60053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853286
1552	NC_014328	AGG	2	6	60076	60081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1553	NC_014328	ATG	2	6	60093	60098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1554	NC_014328	TACA	2	8	60120	60127	50 %	25 %	0 %	25 %	300853286
1555	NC_014328	AGC	3	9	60157	60165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1556	NC_014328	GAA	2	6	60167	60172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1557	NC_014328	A	7	7	60175	60181	100 %	0 %	0 %	0 %	300853286
1558	NC_014328	TGC	2	6	60199	60204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1559	NC_014328	CGT	2	6	60323	60328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1560	NC_014328	CTGC	2	8	60362	60369	0 %	25 %	25 %	50 %	300853286
1561	NC_014328	ATG	3	9	60371	60379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1562	NC_014328	TAT	2	6	60409	60414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1563	NC_014328	GGA	2	6	60451	60456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1564	NC_014328	AAT	2	6	60494	60499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853286
1565	NC_014328	AGA	2	6	60511	60516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1566	NC_014328	CTG	2	6	60549	60554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1567	NC_014328	GGA	2	6	60557	60562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1568	NC_014328	GAAA	2	8	60664	60671	75 %	0 %	25 %	0 %	300853286
1569	NC_014328	ATT	2	6	60734	60739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1570	NC_014328	GCT	2	6	60776	60781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1571	NC_014328	CAA	2	6	60792	60797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853286
1572	NC_014328	CTT	2	6	60803	60808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853286
1573	NC_014328	TGC	2	6	60829	60834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1574	NC_014328	TAA	2	6	60874	60879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853286
1575	NC_014328	AGTG	2	8	60895	60902	25 %	25 %	50 %	0 %	300853286
1576	NC_014328	TTC	2	6	60903	60908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853286
1577	NC_014328	CTG	2	6	60995	61000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1578	NC_014328	TGG	2	6	61052	61057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853286
1579	NC_014328	TGA	2	6	61120	61125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1580	NC_014328	AAAG	2	8	61151	61158	75 %	0 %	25 %	0 %	300853286
1581	NC_014328	AGT	2	6	61213	61218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1582	NC_014328	TGA	2	6	61252	61257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1583	NC_014328	GAA	2	6	61397	61402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1584	NC_014328	AGG	2	6	61531	61536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853286
1585	NC_014328	ATT	2	6	61565	61570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1586	NC_014328	ATA	2	6	61574	61579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853286
1587	NC_014328	AATT	2	8	61606	61613	50 %	50 %	0 %	0 %	300853286
1588	NC_014328	GAA	2	6	61646	61651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853286
1589	NC_014328	GAT	2	6	61715	61720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1590	NC_014328	GCA	2	6	61733	61738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853286
1591	NC_014328	ATG	2	6	61779	61784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853286
1592	NC_014328	ATT	2	6	61793	61798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853286
1593	NC_014328	AT	3	6	61880	61885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014328	ATT	2	6	61892	61897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1595	NC_014328	TAAATT	2	12	61940	61951	50 %	50 %	0 %	0 %	300853287
1596	NC_014328	TTTC	2	8	61959	61966	0 %	75 %	0 %	25 %	300853287
1597	NC_014328	CTG	2	6	61968	61973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853287
1598	NC_014328	TTAA	2	8	62148	62155	50 %	50 %	0 %	0 %	300853287
1599	NC_014328	TGT	2	6	62186	62191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853287
1600	NC_014328	TGT	2	6	62204	62209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853287
1601	NC_014328	T	6	6	62223	62228	0 %	100 %	0 %	0 %	300853287
1602	NC_014328	TTA	2	6	62244	62249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1603	NC_014328	TCC	2	6	62288	62293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853287
1604	NC_014328	AT	3	6	62295	62300	50 %	50 %	0 %	0 %	300853287
1605	NC_014328	TGCT	2	8	62314	62321	0 %	50 %	25 %	25 %	300853287
1606	NC_014328	TTA	2	6	62325	62330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1607	NC_014328	AC	3	6	62334	62339	50 %	0 %	0 %	50 %	300853287
1608	NC_014328	TAT	2	6	62410	62415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1609	NC_014328	TAT	2	6	62420	62425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1610	NC_014328	TTA	2	6	62443	62448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1611	NC_014328	A	7	7	62478	62484	100 %	0 %	0 %	0 %	300853287
1612	NC_014328	A	6	6	62503	62508	100 %	0 %	0 %	0 %	300853287
1613	NC_014328	A	6	6	62536	62541	100 %	0 %	0 %	0 %	300853287
1614	NC_014328	AGA	2	6	62552	62557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853287
1615	NC_014328	TTA	2	6	62580	62585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1616	NC_014328	TGA	3	9	62608	62616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853287
1617	NC_014328	AAT	2	6	62624	62629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853287
1618	NC_014328	A	6	6	62641	62646	100 %	0 %	0 %	0 %	300853287
1619	NC_014328	CAG	2	6	62647	62652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853287
1620	NC_014328	T	6	6	62670	62675	0 %	100 %	0 %	0 %	300853287
1621	NC_014328	TGT	2	6	62678	62683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853287
1622	NC_014328	TA	3	6	62737	62742	50 %	50 %	0 %	0 %	300853287
1623	NC_014328	GAA	2	6	62755	62760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853287
1624	NC_014328	CAGCTG	2	12	62794	62805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300853287
1625	NC_014328	ATG	2	6	62817	62822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853287
1626	NC_014328	ATT	2	6	62829	62834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
1627	NC_014328	GGC	2	6	62835	62840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300853287
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1629	NC_014328	ATT	2	6	62897	62902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853287
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