MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014328	A	7	7	19887	19893	100 %	0 %	0 %	0 %	300853243
502	NC_014328	GGTA	2	8	19934	19941	25 %	25 %	50 %	0 %	300853243
503	NC_014328	TGA	2	6	19955	19960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853243
504	NC_014328	GA	3	6	19992	19997	50 %	0 %	50 %	0 %	300853244
505	NC_014328	AG	3	6	20040	20045	50 %	0 %	50 %	0 %	300853244
506	NC_014328	TA	3	6	20062	20067	50 %	50 %	0 %	0 %	300853244
507	NC_014328	GAA	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853244
508	NC_014328	AGA	2	6	20093	20098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853244
509	NC_014328	TAA	2	6	20099	20104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853244
510	NC_014328	AT	3	6	20110	20115	50 %	50 %	0 %	0 %	300853244
511	NC_014328	TAC	2	6	20117	20122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853244
512	NC_014328	TAA	2	6	20315	20320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853244
513	NC_014328	AAT	2	6	20329	20334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853244
514	NC_014328	TAT	2	6	20349	20354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014328	TAA	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014328	AT	3	6	20387	20392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014328	TA	3	6	20397	20402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014328	A	7	7	20420	20426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014328	TA	3	6	20427	20432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014328	TTAA	2	8	20434	20441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014328	TGA	2	6	20450	20455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014328	TAG	2	6	20462	20467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014328	AG	3	6	20483	20488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014328	ATA	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014328	AG	3	6	20577	20582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014328	TTAA	2	8	20599	20606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014328	TAT	2	6	20663	20668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014328	TA	3	6	20676	20681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014328	GAT	2	6	20682	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014328	GGA	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014328	A	7	7	20748	20754	100 %	0 %	0 %	0 %	300853245
532	NC_014328	GAGAA	2	10	20818	20827	60 %	0 %	40 %	0 %	300853245
533	NC_014328	GAT	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853245
534	NC_014328	CTA	2	6	21101	21106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853245
535	NC_014328	TAA	2	6	21242	21247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853245
536	NC_014328	TTA	2	6	21249	21254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853245
537	NC_014328	AAT	2	6	21379	21384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853245
538	NC_014328	CAG	2	6	21512	21517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853245
539	NC_014328	AAT	2	6	21534	21539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853245
540	NC_014328	ACA	2	6	21543	21548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853245
541	NC_014328	TAA	2	6	21555	21560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853245
542	NC_014328	GAA	2	6	21589	21594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853245
543	NC_014328	ATG	2	6	21599	21604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853245
544	NC_014328	ATG	2	6	21623	21628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853245
545	NC_014328	AGA	2	6	21630	21635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853245
546	NC_014328	AGT	2	6	21666	21671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853245
547	NC_014328	GCA	2	6	21703	21708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853245
548	NC_014328	GTA	2	6	21770	21775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853245
549	NC_014328	AAG	2	6	21917	21922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853245
550	NC_014328	AT	3	6	21957	21962	50 %	50 %	0 %	0 %	300853245
551	NC_014328	TAA	2	6	21977	21982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853245
552	NC_014328	GA	3	6	22050	22055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014328	AGT	2	6	22141	22146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014328	T	6	6	22156	22161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014328	A	7	7	22186	22192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014328	AT	3	6	22200	22205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014328	TGT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014328	TAA	2	6	22220	22225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014328	CTTT	2	8	22322	22329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_014328	ATA	2	6	22337	22342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014328	TAA	2	6	22465	22470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014328	CTT	2	6	22517	22522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014328	T	7	7	22521	22527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014328	TA	3	6	22543	22548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014328	CTC	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_014328	T	6	6	22725	22730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014328	TTATC	2	10	22814	22823	20 %	60 %	0 %	20 %	300853246
568	NC_014328	TAA	2	6	22896	22901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853246
569	NC_014328	ATT	2	6	22926	22931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853246
570	NC_014328	T	6	6	22974	22979	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
571	NC_014328	TAT	3	9	22988	22996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853246
572	NC_014328	T	6	6	22996	23001	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
573	NC_014328	CT	3	6	23006	23011	0 %	50 %	0 %	50 %	300853246
574	NC_014328	T	6	6	23077	23082	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
575	NC_014328	TCT	2	6	23105	23110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853246
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577	NC_014328	ATC	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853246
578	NC_014328	T	6	6	23439	23444	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
579	NC_014328	CAATA	2	10	23489	23498	60 %	20 %	0 %	20 %	300853246
580	NC_014328	TCA	2	6	23518	23523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853246
581	NC_014328	A	7	7	23535	23541	100 %	0 %	0 %	0 %	300853246
582	NC_014328	AGC	2	6	23548	23553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853246
583	NC_014328	T	6	6	23563	23568	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
584	NC_014328	TAAA	2	8	23594	23601	75 %	25 %	0 %	0 %	300853246
585	NC_014328	TAA	2	6	23608	23613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853246
586	NC_014328	TA	3	6	23673	23678	50 %	50 %	0 %	0 %	300853246
587	NC_014328	T	6	6	23735	23740	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
588	NC_014328	TACA	2	8	23756	23763	50 %	25 %	0 %	25 %	300853246
589	NC_014328	T	6	6	23847	23852	0 %	100 %	0 %	0 %	300853246
590	NC_014328	AGTT	2	8	23948	23955	25 %	50 %	25 %	0 %	300853246
591	NC_014328	TA	3	6	24115	24120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014328	TTTTA	2	10	24128	24137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014328	ATA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014328	ATC	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014328	AATT	2	8	24199	24206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014328	ATA	2	6	24223	24228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014328	AT	3	6	24242	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014328	T	6	6	24253	24258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014328	TATCT	2	10	24307	24316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_014328	TAAG	2	8	24318	24325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014328	ATT	2	6	24346	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014328	AGTAC	2	10	24397	24406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_014328	AAT	2	6	24408	24413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014328	GT	4	8	24426	24433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014328	TCC	2	6	24463	24468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_014328	AGTT	2	8	24551	24558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014328	AATAT	2	10	24559	24568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014328	AGA	2	6	24602	24607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014328	GAAAAA	2	12	24706	24717	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	300853247
610	NC_014328	CATA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	0 %	25 %	300853247
611	NC_014328	T	6	6	24782	24787	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
612	NC_014328	T	7	7	24791	24797	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
613	NC_014328	T	7	7	24799	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
614	NC_014328	AGT	2	6	24807	24812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853247
615	NC_014328	GA	3	6	24871	24876	50 %	0 %	50 %	0 %	300853247
616	NC_014328	ATTA	2	8	24912	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
617	NC_014328	TAT	2	6	25008	25013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853247
618	NC_014328	T	6	6	25013	25018	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
619	NC_014328	T	7	7	25033	25039	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
620	NC_014328	TTAA	2	8	25072	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
621	NC_014328	AT	3	6	25109	25114	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
622	NC_014328	T	7	7	25150	25156	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
623	NC_014328	TAAG	2	8	25158	25165	50 %	25 %	25 %	0 %	300853247
624	NC_014328	AT	4	8	25166	25173	50 %	50 %	0 %	0 %	300853247
625	NC_014328	TTC	3	9	25190	25198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853247
626	NC_014328	T	6	6	25236	25241	0 %	100 %	0 %	0 %	300853247
627	NC_014328	CTT	2	6	25270	25275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014328	TAT	3	9	25278	25286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014328	AAT	2	6	25311	25316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014328	TAATA	2	10	25354	25363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014328	ACA	2	6	25364	25369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014328	AG	3	6	25434	25439	50 %	0 %	50 %	0 %	300853248
633	NC_014328	GTT	2	6	25497	25502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853248
634	NC_014328	T	6	6	25585	25590	0 %	100 %	0 %	0 %	300853248
635	NC_014328	ATG	2	6	25592	25597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853248
636	NC_014328	AGG	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853248
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638	NC_014328	AT	3	6	25703	25708	50 %	50 %	0 %	0 %	300853249
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