MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_014328	ATA	2	6	237784	237789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853437
6003	NC_014328	ATTT	2	8	237808	237815	25 %	75 %	0 %	0 %	300853437
6004	NC_014328	AAG	2	6	237824	237829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853437
6005	NC_014328	TGA	2	6	237833	237838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
6006	NC_014328	TGA	2	6	237872	237877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
6007	NC_014328	TGA	2	6	237898	237903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853437
6008	NC_014328	TAAA	2	8	237910	237917	75 %	25 %	0 %	0 %	300853437
6009	NC_014328	CTG	2	6	237919	237924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853437
6010	NC_014328	AGG	2	6	237983	237988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_014328	AT	3	6	238007	238012	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
6012	NC_014328	TTTG	2	8	238015	238022	0 %	75 %	25 %	0 %	300853438
6013	NC_014328	ATT	2	6	238067	238072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853438
6014	NC_014328	TG	3	6	238073	238078	0 %	50 %	50 %	0 %	300853438
6015	NC_014328	CAG	2	6	238103	238108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853438
6016	NC_014328	AGT	2	6	238116	238121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853438
6017	NC_014328	CAAA	2	8	238161	238168	75 %	0 %	0 %	25 %	300853438
6018	NC_014328	AGC	2	6	238186	238191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853438
6019	NC_014328	TA	3	6	238258	238263	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
6020	NC_014328	AGA	2	6	238277	238282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853438
6021	NC_014328	TA	3	6	238307	238312	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
6022	NC_014328	AGA	2	6	238371	238376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853438
6023	NC_014328	A	6	6	238401	238406	100 %	0 %	0 %	0 %	300853438
6024	NC_014328	TAT	2	6	238415	238420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853438
6025	NC_014328	ATTA	2	8	238450	238457	50 %	50 %	0 %	0 %	300853438
6026	NC_014328	TCT	2	6	238468	238473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014328	T	7	7	238473	238479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014328	TAA	2	6	238511	238516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_014328	TAAA	2	8	238526	238533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014328	T	6	6	238554	238559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014328	A	7	7	238601	238607	100 %	0 %	0 %	0 %	300853439
6032	NC_014328	TCC	2	6	238671	238676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853439
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6034	NC_014328	ATA	2	6	238852	238857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853439
6035	NC_014328	ACTA	2	8	238868	238875	50 %	25 %	0 %	25 %	300853439
6036	NC_014328	AG	3	6	238882	238887	50 %	0 %	50 %	0 %	300853439
6037	NC_014328	GACA	2	8	238950	238957	50 %	0 %	25 %	25 %	300853439
6038	NC_014328	GATA	2	8	238967	238974	50 %	25 %	25 %	0 %	300853439
6039	NC_014328	AAAT	2	8	239004	239011	75 %	25 %	0 %	0 %	300853439
6040	NC_014328	TA	3	6	239018	239023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014328	TTTC	2	8	239092	239099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_014328	ATGAA	2	10	239109	239118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014328	AGG	2	6	239123	239128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_014328	AT	4	8	239130	239137	50 %	50 %	0 %	0 %	300853440
6045	NC_014328	AGTAA	2	10	239139	239148	60 %	20 %	20 %	0 %	300853440
6046	NC_014328	TAA	2	6	239188	239193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853440
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6053	NC_014328	TGCT	2	8	239533	239540	0 %	50 %	25 %	25 %	300853440
6054	NC_014328	AGG	2	6	239543	239548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853440
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6056	NC_014328	A	6	6	239580	239585	100 %	0 %	0 %	0 %	300853440
6057	NC_014328	AGATGT	2	12	239660	239671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853440
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6059	NC_014328	AT	3	6	239711	239716	50 %	50 %	0 %	0 %	300853440
6060	NC_014328	ATA	2	6	239762	239767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853440
6061	NC_014328	GTA	2	6	239777	239782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014328	CTTTA	2	10	239811	239820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_014328	TAA	2	6	239880	239885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_014328	TA	3	6	239887	239892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014328	TTA	2	6	239905	239910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853441
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6074	NC_014328	A	6	6	240280	240285	100 %	0 %	0 %	0 %	300853441
6075	NC_014328	GAATT	2	10	240292	240301	40 %	40 %	20 %	0 %	300853441
6076	NC_014328	AAGG	2	8	240357	240364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014328	TTA	2	6	240365	240370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853442
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6083	NC_014328	CTA	2	6	240608	240613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853442
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6085	NC_014328	GAT	2	6	240637	240642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853442
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6093	NC_014328	TAT	2	6	240944	240949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853442
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6096	NC_014328	AAG	2	6	241149	241154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853442
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6098	NC_014328	TAT	2	6	241173	241178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853442
6099	NC_014328	CAT	2	6	241201	241206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853442
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6102	NC_014328	GTATA	2	10	241254	241263	40 %	40 %	20 %	0 %	300853442
6103	NC_014328	CTTC	2	8	241323	241330	0 %	50 %	0 %	50 %	300853442
6104	NC_014328	TAA	2	6	241331	241336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853442
6105	NC_014328	T	6	6	241378	241383	0 %	100 %	0 %	0 %	300853442
6106	NC_014328	AG	3	6	241390	241395	50 %	0 %	50 %	0 %	300853442
6107	NC_014328	A	6	6	241397	241402	100 %	0 %	0 %	0 %	300853442
6108	NC_014328	GAGAA	2	10	241494	241503	60 %	0 %	40 %	0 %	300853443
6109	NC_014328	ATA	2	6	241513	241518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853443
6110	NC_014328	ACT	3	9	241713	241721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853443
6111	NC_014328	GCT	2	6	241737	241742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853443
6112	NC_014328	A	7	7	241749	241755	100 %	0 %	0 %	0 %	300853443
6113	NC_014328	AGA	2	6	241814	241819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853443
6114	NC_014328	ACCA	2	8	241865	241872	50 %	0 %	0 %	50 %	300853443
6115	NC_014328	GT	3	6	241903	241908	0 %	50 %	50 %	0 %	300853443
6116	NC_014328	ATG	2	6	241990	241995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853443
6117	NC_014328	ATA	2	6	242017	242022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853443
6118	NC_014328	A	6	6	242022	242027	100 %	0 %	0 %	0 %	300853443
6119	NC_014328	GTA	2	6	242157	242162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853443
6120	NC_014328	TA	3	6	242173	242178	50 %	50 %	0 %	0 %	300853443
6121	NC_014328	TTG	2	6	242208	242213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853443
6122	NC_014328	AC	3	6	242235	242240	50 %	0 %	0 %	50 %	300853443
6123	NC_014328	TGG	2	6	242279	242284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853443
6124	NC_014328	AGG	2	6	242290	242295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853443
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6126	NC_014328	GAA	2	6	242394	242399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853443
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6247	NC_014328	A	7	7	246848	246854	100 %	0 %	0 %	0 %	300853449
6248	NC_014328	A	7	7	246905	246911	100 %	0 %	0 %	0 %	300853449
6249	NC_014328	TCT	2	6	246934	246939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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