MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_014328	CAG	2	6	218057	218062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853419
5503	NC_014328	TA	3	6	218066	218071	50 %	50 %	0 %	0 %	300853419
5504	NC_014328	TAAAA	2	10	218088	218097	80 %	20 %	0 %	0 %	300853419
5505	NC_014328	A	7	7	218196	218202	100 %	0 %	0 %	0 %	300853419
5506	NC_014328	T	7	7	218292	218298	0 %	100 %	0 %	0 %	300853419
5507	NC_014328	GAT	2	6	218299	218304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853419
5508	NC_014328	ATA	2	6	218330	218335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853419
5509	NC_014328	AG	3	6	218350	218355	50 %	0 %	50 %	0 %	300853419
5510	NC_014328	TTA	2	6	218360	218365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853419
5511	NC_014328	TA	3	6	218383	218388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014328	GAT	2	6	218465	218470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014328	TCT	2	6	218473	218478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_014328	T	6	6	218650	218655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_014328	AAAT	2	8	218667	218674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_014328	AATA	2	8	218694	218701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_014328	TTA	2	6	218706	218711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014328	T	7	7	218800	218806	0 %	100 %	0 %	0 %	300853420
5519	NC_014328	CATT	2	8	218838	218845	25 %	50 %	0 %	25 %	300853420
5520	NC_014328	A	7	7	218851	218857	100 %	0 %	0 %	0 %	300853420
5521	NC_014328	TC	3	6	218923	218928	0 %	50 %	0 %	50 %	300853420
5522	NC_014328	TCTA	2	8	218948	218955	25 %	50 %	0 %	25 %	300853420
5523	NC_014328	AGA	2	6	218984	218989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
5524	NC_014328	AAG	2	6	218993	218998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
5525	NC_014328	TCT	2	6	219006	219011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853421
5526	NC_014328	GAT	2	6	219054	219059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5527	NC_014328	TA	3	6	219084	219089	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
5528	NC_014328	ATA	2	6	219199	219204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5529	NC_014328	ATG	2	6	219216	219221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5530	NC_014328	A	6	6	219255	219260	100 %	0 %	0 %	0 %	300853421
5531	NC_014328	TA	3	6	219321	219326	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
5532	NC_014328	CTA	2	6	219331	219336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
5533	NC_014328	AGA	3	9	219441	219449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
5534	NC_014328	TAA	2	6	219514	219519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5535	NC_014328	TA	3	6	219522	219527	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
5536	NC_014328	A	6	6	219565	219570	100 %	0 %	0 %	0 %	300853421
5537	NC_014328	AGA	2	6	219629	219634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
5538	NC_014328	GTA	2	6	219684	219689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5539	NC_014328	TAG	2	6	219724	219729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5540	NC_014328	GAT	2	6	219789	219794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5541	NC_014328	TAT	2	6	219795	219800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853421
5542	NC_014328	AT	3	6	219810	219815	50 %	50 %	0 %	0 %	300853421
5543	NC_014328	CTA	2	6	219820	219825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
5544	NC_014328	AAT	2	6	219830	219835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5545	NC_014328	TAT	2	6	219848	219853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853421
5546	NC_014328	CTT	2	6	219892	219897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853421
5547	NC_014328	AAT	2	6	219908	219913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5548	NC_014328	CTA	2	6	219916	219921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
5549	NC_014328	TAG	2	6	220063	220068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853421
5550	NC_014328	TTA	2	6	220075	220080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853421
5551	NC_014328	GCAG	2	8	220085	220092	25 %	0 %	50 %	25 %	300853421
5552	NC_014328	AAT	2	6	220118	220123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5553	NC_014328	ATA	3	9	220125	220133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853421
5554	NC_014328	TAC	2	6	220160	220165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853421
5555	NC_014328	TTA	2	6	220198	220203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853421
5556	NC_014328	TACCT	2	10	220306	220315	20 %	40 %	0 %	40 %	300853421
5557	NC_014328	T	6	6	220380	220385	0 %	100 %	0 %	0 %	300853421
5558	NC_014328	AGA	2	6	220389	220394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853421
5559	NC_014328	TTA	2	6	220504	220509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_014328	A	7	7	220518	220524	100 %	0 %	0 %	0 %	300853422
5561	NC_014328	TAA	2	6	220560	220565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853422
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5563	NC_014328	ATGG	2	8	220626	220633	25 %	25 %	50 %	0 %	300853422
5564	NC_014328	TAG	2	6	220644	220649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853422
5565	NC_014328	TAC	2	6	220728	220733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853422
5566	NC_014328	ATATA	2	10	220786	220795	60 %	40 %	0 %	0 %	300853422
5567	NC_014328	T	6	6	220796	220801	0 %	100 %	0 %	0 %	300853422
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5569	NC_014328	ATCT	2	8	220901	220908	25 %	50 %	0 %	25 %	300853422
5570	NC_014328	AAACA	2	10	221002	221011	80 %	0 %	0 %	20 %	300853422
5571	NC_014328	AAC	2	6	221018	221023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853422
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5575	NC_014328	ATA	2	6	221108	221113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853422
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5584	NC_014328	TA	3	6	221455	221460	50 %	50 %	0 %	0 %	300853422
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5588	NC_014328	TCT	2	6	221758	221763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853422
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5597	NC_014328	CTT	2	6	222024	222029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853422
5598	NC_014328	TA	3	6	222044	222049	50 %	50 %	0 %	0 %	300853422
5599	NC_014328	AT	3	6	222076	222081	50 %	50 %	0 %	0 %	300853422
5600	NC_014328	AGA	2	6	222112	222117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853422
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5602	NC_014328	TAGT	2	8	222189	222196	25 %	50 %	25 %	0 %	300853422
5603	NC_014328	ATA	2	6	222218	222223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853422
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5605	NC_014328	ATT	2	6	222337	222342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853422
5606	NC_014328	A	6	6	222355	222360	100 %	0 %	0 %	0 %	300853422
5607	NC_014328	AT	3	6	222374	222379	50 %	50 %	0 %	0 %	300853422
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5609	NC_014328	A	6	6	222493	222498	100 %	0 %	0 %	0 %	300853422
5610	NC_014328	TTA	2	6	222499	222504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853422
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5613	NC_014328	ATC	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853422
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5619	NC_014328	AAT	2	6	222803	222808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_014328	TTA	2	6	222830	222835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_014328	GAA	2	6	222856	222861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853423
5622	NC_014328	TTA	2	6	222866	222871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853423
5623	NC_014328	GTAAA	2	10	222921	222930	60 %	20 %	20 %	0 %	300853423
5624	NC_014328	GAT	2	6	222947	222952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853423
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5626	NC_014328	CTAAA	2	10	223059	223068	60 %	20 %	0 %	20 %	300853423
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