MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014328	TTA	2	6	199767	199772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853404
5002	NC_014328	A	7	7	199780	199786	100 %	0 %	0 %	0 %	300853404
5003	NC_014328	A	6	6	199816	199821	100 %	0 %	0 %	0 %	300853404
5004	NC_014328	A	6	6	199830	199835	100 %	0 %	0 %	0 %	300853404
5005	NC_014328	AT	3	6	199855	199860	50 %	50 %	0 %	0 %	300853404
5006	NC_014328	ATT	2	6	199949	199954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014328	TAATA	2	10	199974	199983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014328	TGT	2	6	200013	200018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014328	TAA	2	6	200024	200029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014328	TTATT	2	10	200042	200051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014328	AAT	2	6	200094	200099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014328	T	7	7	200123	200129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014328	ATT	2	6	200132	200137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014328	T	6	6	200172	200177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014328	ATT	3	9	200195	200203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014328	AGG	2	6	200208	200213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014328	AGA	2	6	200302	200307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853405
5018	NC_014328	A	7	7	200347	200353	100 %	0 %	0 %	0 %	300853405
5019	NC_014328	ATT	2	6	200435	200440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853405
5020	NC_014328	TAA	2	6	200449	200454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853405
5021	NC_014328	T	6	6	200482	200487	0 %	100 %	0 %	0 %	300853405
5022	NC_014328	AG	3	6	200519	200524	50 %	0 %	50 %	0 %	300853405
5023	NC_014328	T	6	6	200528	200533	0 %	100 %	0 %	0 %	300853405
5024	NC_014328	TGA	2	6	200568	200573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853405
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5026	NC_014328	TAGA	2	8	200658	200665	50 %	25 %	25 %	0 %	300853405
5027	NC_014328	ATT	2	6	200666	200671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853405
5028	NC_014328	TAT	2	6	200696	200701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853405
5029	NC_014328	TGG	2	6	200713	200718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853405
5030	NC_014328	AT	3	6	200748	200753	50 %	50 %	0 %	0 %	300853405
5031	NC_014328	A	6	6	200756	200761	100 %	0 %	0 %	0 %	300853405
5032	NC_014328	TGA	2	6	200806	200811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853405
5033	NC_014328	GATAA	2	10	200822	200831	60 %	20 %	20 %	0 %	300853405
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5036	NC_014328	A	6	6	200915	200920	100 %	0 %	0 %	0 %	300853405
5037	NC_014328	ATGC	2	8	200924	200931	25 %	25 %	25 %	25 %	300853405
5038	NC_014328	GAG	2	6	200952	200957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853405
5039	NC_014328	TTG	2	6	201033	201038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853405
5040	NC_014328	GGT	2	6	201057	201062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853405
5041	NC_014328	TTAT	2	8	201068	201075	25 %	75 %	0 %	0 %	300853405
5042	NC_014328	ATGTAA	2	12	201096	201107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300853405
5043	NC_014328	CAGAG	2	10	201117	201126	40 %	0 %	40 %	20 %	300853405
5044	NC_014328	A	6	6	201141	201146	100 %	0 %	0 %	0 %	300853405
5045	NC_014328	T	7	7	201187	201193	0 %	100 %	0 %	0 %	300853405
5046	NC_014328	ATG	2	6	201195	201200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853405
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5049	NC_014328	T	7	7	201340	201346	0 %	100 %	0 %	0 %	300853405
5050	NC_014328	ATA	2	6	201372	201377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853405
5051	NC_014328	ATG	2	6	201398	201403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853405
5052	NC_014328	ATG	2	6	201476	201481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853405
5053	NC_014328	AAC	2	6	201504	201509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853405
5054	NC_014328	A	6	6	201557	201562	100 %	0 %	0 %	0 %	300853405
5055	NC_014328	AG	3	6	201620	201625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014328	TAT	3	9	201695	201703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014328	AT	3	6	201752	201757	50 %	50 %	0 %	0 %	300853406
5058	NC_014328	TAA	2	6	201775	201780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853406
5059	NC_014328	TAA	2	6	201815	201820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853406
5060	NC_014328	A	6	6	201819	201824	100 %	0 %	0 %	0 %	300853406
5061	NC_014328	AAT	2	6	201837	201842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853406
5062	NC_014328	GCA	2	6	201909	201914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853406
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5064	NC_014328	ATT	2	6	202121	202126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853406
5065	NC_014328	TA	3	6	202204	202209	50 %	50 %	0 %	0 %	300853406
5066	NC_014328	AT	3	6	202216	202221	50 %	50 %	0 %	0 %	300853406
5067	NC_014328	AAG	2	6	202228	202233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853406
5068	NC_014328	TA	3	6	202269	202274	50 %	50 %	0 %	0 %	300853406
5069	NC_014328	AGGA	2	8	202280	202287	50 %	0 %	50 %	0 %	300853406
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5075	NC_014328	TAAA	2	8	202675	202682	75 %	25 %	0 %	0 %	300853406
5076	NC_014328	TAAA	2	8	202759	202766	75 %	25 %	0 %	0 %	300853406
5077	NC_014328	TAAA	2	8	202813	202820	75 %	25 %	0 %	0 %	300853406
5078	NC_014328	A	6	6	202898	202903	100 %	0 %	0 %	0 %	300853406
5079	NC_014328	A	6	6	202921	202926	100 %	0 %	0 %	0 %	300853406
5080	NC_014328	CAAA	2	8	202944	202951	75 %	0 %	0 %	25 %	300853406
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5083	NC_014328	T	6	6	203078	203083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_014328	ATAA	2	8	203087	203094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014328	AGT	2	6	203116	203121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014328	TTTTA	2	10	203129	203138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_014328	T	6	6	203193	203198	0 %	100 %	0 %	0 %	300853407
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5097	NC_014328	TCT	2	6	203492	203497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853407
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5101	NC_014328	ACC	2	6	203674	203679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853407
5102	NC_014328	TA	3	6	203680	203685	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
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5104	NC_014328	TGT	2	6	203724	203729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853407
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5106	NC_014328	T	7	7	203830	203836	0 %	100 %	0 %	0 %	300853407
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5109	NC_014328	TA	3	6	203938	203943	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
5110	NC_014328	T	6	6	203987	203992	0 %	100 %	0 %	0 %	300853407
5111	NC_014328	TA	3	6	204023	204028	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
5112	NC_014328	T	6	6	204041	204046	0 %	100 %	0 %	0 %	300853407
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5116	NC_014328	TA	3	6	204120	204125	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
5117	NC_014328	TA	3	6	204155	204160	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
5118	NC_014328	AT	3	6	204191	204196	50 %	50 %	0 %	0 %	300853407
5119	NC_014328	TTATA	2	10	204323	204332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014328	AAT	2	6	204377	204382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014328	CA	3	6	204404	204409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_014328	TAC	2	6	204428	204433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_014328	AT	3	6	204434	204439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014328	GGA	2	6	204450	204455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014328	AT	3	6	204468	204473	50 %	50 %	0 %	0 %	300853408
5126	NC_014328	A	7	7	204481	204487	100 %	0 %	0 %	0 %	300853408
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