MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 117670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_014328	AGA	2	6	179403	179408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853389
4503	NC_014328	AT	3	6	179420	179425	50 %	50 %	0 %	0 %	300853389
4504	NC_014328	GTA	2	6	179431	179436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853389
4505	NC_014328	CTT	2	6	179536	179541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853389
4506	NC_014328	A	6	6	179571	179576	100 %	0 %	0 %	0 %	300853389
4507	NC_014328	AAG	2	6	179587	179592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853389
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4509	NC_014328	TAA	2	6	179637	179642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853389
4510	NC_014328	A	7	7	179649	179655	100 %	0 %	0 %	0 %	300853389
4511	NC_014328	ATT	2	6	179667	179672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_014328	ATA	2	6	179673	179678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_014328	ATT	2	6	179682	179687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_014328	ATA	2	6	179694	179699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014328	TA	3	6	179725	179730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014328	GAG	2	6	179733	179738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014328	TTA	2	6	179749	179754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014328	GATG	2	8	179845	179852	25 %	25 %	50 %	0 %	300853390
4519	NC_014328	A	6	6	179976	179981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014328	CA	3	6	180040	180045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_014328	AAAAC	2	10	180063	180072	80 %	0 %	0 %	20 %	300853391
4522	NC_014328	TGGA	2	8	180115	180122	25 %	25 %	50 %	0 %	300853391
4523	NC_014328	TATT	2	8	180123	180130	25 %	75 %	0 %	0 %	300853391
4524	NC_014328	GGT	2	6	180152	180157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853391
4525	NC_014328	AGT	2	6	180181	180186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853391
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4527	NC_014328	TCC	2	6	180252	180257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014328	TA	3	6	180270	180275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_014328	ATT	2	6	180302	180307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014328	T	6	6	180413	180418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014328	AT	3	6	180419	180424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014328	TAA	2	6	180434	180439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014328	AT	3	6	180456	180461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014328	AGT	2	6	180462	180467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014328	GGA	2	6	180470	180475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014328	TGT	2	6	180490	180495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853392
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4539	NC_014328	ATCTTA	2	12	180636	180647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300853392
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4541	NC_014328	GAA	2	6	180683	180688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853392
4542	NC_014328	GAA	2	6	180697	180702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853392
4543	NC_014328	AGA	2	6	180740	180745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853392
4544	NC_014328	ACAG	2	8	180812	180819	50 %	0 %	25 %	25 %	300853392
4545	NC_014328	AT	4	8	180942	180949	50 %	50 %	0 %	0 %	300853392
4546	NC_014328	TAACT	2	10	180970	180979	40 %	40 %	0 %	20 %	300853392
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4549	NC_014328	CTG	2	6	181071	181076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853392
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4551	NC_014328	TTG	2	6	181167	181172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853392
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4554	NC_014328	AAG	3	9	181258	181266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853392
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4556	NC_014328	AAC	2	6	181437	181442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853392
4557	NC_014328	TAATA	2	10	181453	181462	60 %	40 %	0 %	0 %	300853392
4558	NC_014328	A	6	6	181472	181477	100 %	0 %	0 %	0 %	300853392
4559	NC_014328	TTA	3	9	181504	181512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853392
4560	NC_014328	TTTA	2	8	181513	181520	25 %	75 %	0 %	0 %	300853392
4561	NC_014328	GAAT	2	8	181548	181555	50 %	25 %	25 %	0 %	300853392
4562	NC_014328	TAA	2	6	181585	181590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853392
4563	NC_014328	GTAA	2	8	181745	181752	50 %	25 %	25 %	0 %	300853392
4564	NC_014328	T	6	6	181754	181759	0 %	100 %	0 %	0 %	300853392
4565	NC_014328	ATT	2	6	181762	181767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853392
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4570	NC_014328	GCT	2	6	182091	182096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853392
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4573	NC_014328	TA	3	6	182294	182299	50 %	50 %	0 %	0 %	300853392
4574	NC_014328	TGA	2	6	182305	182310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853392
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4577	NC_014328	TA	3	6	182375	182380	50 %	50 %	0 %	0 %	300853392
4578	NC_014328	TGTC	2	8	182440	182447	0 %	50 %	25 %	25 %	300853392
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4584	NC_014328	AAG	2	6	182615	182620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014328	A	7	7	182642	182648	100 %	0 %	0 %	0 %	300853393
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4593	NC_014328	A	6	6	183038	183043	100 %	0 %	0 %	0 %	300853393
4594	NC_014328	AAAATT	2	12	183049	183060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853393
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4598	NC_014328	GAG	2	6	183179	183184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014328	ATA	2	6	183188	183193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853394
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4601	NC_014328	ATT	2	6	183354	183359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853394
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4608	NC_014328	A	6	6	183585	183590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014328	A	7	7	183665	183671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014328	T	6	6	183722	183727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014328	TA	3	6	183748	183753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014328	T	6	6	183808	183813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014328	T	6	6	183836	183841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014328	CTG	2	6	183891	183896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014328	C	6	6	183916	183921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4616	NC_014328	AAT	2	6	183927	183932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014328	AT	3	6	183931	183936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014328	TAA	2	6	183967	183972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014328	ACCTAA	2	12	184001	184012	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014328	TTCT	2	8	184108	184115	0 %	75 %	0 %	25 %	300853395
4621	NC_014328	AT	3	6	184125	184130	50 %	50 %	0 %	0 %	300853395
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4626	NC_014328	ATATT	2	10	184378	184387	40 %	60 %	0 %	0 %	300853395
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