MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	TTATT	2	10	308	317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	AAATT	2	10	571	580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AAAAT	2	10	1915	1924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	TTTTC	2	10	2503	2512	0 %	80 %	0 %	20 %	295698242
5	NC_014109	ATTTT	2	10	4715	4724	20 %	80 %	0 %	0 %	295698245
6	NC_014109	ATCTT	2	10	4848	4857	20 %	60 %	0 %	20 %	295698245
7	NC_014109	AAATA	2	10	5804	5813	80 %	20 %	0 %	0 %	295698247
8	NC_014109	AGGAT	2	10	5913	5922	40 %	20 %	40 %	0 %	295698247
9	NC_014109	AATTA	2	10	6259	6268	60 %	40 %	0 %	0 %	295698247
10	NC_014109	TTAAA	2	10	8594	8603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	ATTTT	2	10	9023	9032	20 %	80 %	0 %	0 %	295698250
12	NC_014109	TCAAT	2	10	9263	9272	40 %	40 %	0 %	20 %	295698250
13	NC_014109	AAAAT	2	10	9303	9312	80 %	20 %	0 %	0 %	295698250
14	NC_014109	ATCCT	2	10	11720	11729	20 %	40 %	0 %	40 %	295698252
15	NC_014109	AGATA	2	10	12786	12795	60 %	20 %	20 %	0 %	295698254
16	NC_014109	AAAAT	2	10	12918	12927	80 %	20 %	0 %	0 %	295698254
17	NC_014109	AGAAA	2	10	15130	15139	80 %	0 %	20 %	0 %	295698257
18	NC_014109	ATTTT	2	10	15719	15728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	AATTT	2	10	17066	17075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	AAATA	2	10	17328	17337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TAAAA	2	10	18610	18619	80 %	20 %	0 %	0 %	295698261
22	NC_014109	AGTTT	2	10	19124	19133	20 %	60 %	20 %	0 %	295698261
23	NC_014109	CAAAT	2	10	20993	21002	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014109	GTTTT	2	10	21884	21893	0 %	80 %	20 %	0 %	295698265
25	NC_014109	AAATG	2	10	22275	22284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014109	AAATG	2	10	24361	24370	60 %	20 %	20 %	0 %	295698268
27	NC_014109	ATGAT	2	10	24417	24426	40 %	40 %	20 %	0 %	295698268
28	NC_014109	TTTTC	2	10	24989	24998	0 %	80 %	0 %	20 %	295698268
29	NC_014109	TGATT	2	10	25310	25319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014109	ATTCG	2	10	26029	26038	20 %	40 %	20 %	20 %	295698269
31	NC_014109	ATTTG	2	10	26535	26544	20 %	60 %	20 %	0 %	295698269
32	NC_014109	AAAAT	2	10	27231	27240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014109	AAAAT	2	10	27798	27807	80 %	20 %	0 %	0 %	295698271
34	NC_014109	AAATC	2	10	28301	28310	60 %	20 %	0 %	20 %	295698271
35	NC_014109	CATTG	2	10	29512	29521	20 %	40 %	20 %	20 %	295698272
36	NC_014109	CAATC	2	10	30531	30540	40 %	20 %	0 %	40 %	295698274
37	NC_014109	TCATA	2	10	32283	32292	40 %	40 %	0 %	20 %	295698276
38	NC_014109	TAATC	2	10	34415	34424	40 %	40 %	0 %	20 %	295698278
39	NC_014109	TCTAG	2	10	35494	35503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014109	TCGGT	2	10	37577	37586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014109	TTCGC	2	10	38135	38144	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014109	AACTT	2	10	39620	39629	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014109	TTTGA	2	10	40610	40619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014109	GACTT	2	10	43158	43167	20 %	40 %	20 %	20 %	295698283
45	NC_014109	TAACT	2	10	43622	43631	40 %	40 %	0 %	20 %	295698284
46	NC_014109	TAAAT	2	10	44707	44716	60 %	40 %	0 %	0 %	295698285
47	NC_014109	AAATT	2	10	45089	45098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014109	ATCGA	2	10	45779	45788	40 %	20 %	20 %	20 %	295698286
49	NC_014109	AGCTA	2	10	46850	46859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014109	AAAAT	2	10	47379	47388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014109	CTTTT	2	10	48652	48661	0 %	80 %	0 %	20 %	295698289
52	NC_014109	ATTTT	2	10	49337	49346	20 %	80 %	0 %	0 %	295698289
53	NC_014109	GAAAA	2	10	49869	49878	80 %	0 %	20 %	0 %	295698290
54	NC_014109	GAAAT	2	10	53815	53824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014109	AAAAT	2	10	55773	55782	80 %	20 %	0 %	0 %	295698295
56	NC_014109	CAATC	2	10	56157	56166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014109	TTTTC	2	10	57067	57076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014109	GAAAA	2	10	57081	57090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	TTTCG	2	10	57863	57872	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014109	TTTCT	2	10	58569	58578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014109	AAAAG	2	10	59105	59114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014109	ATCGA	2	10	59981	59990	40 %	20 %	20 %	20 %	295698298
63	NC_014109	ATTGA	2	10	60341	60350	40 %	40 %	20 %	0 %	295698298
64	NC_014109	TTAGT	2	10	62737	62746	20 %	60 %	20 %	0 %	295698299
65	NC_014109	TCATT	2	10	63891	63900	20 %	60 %	0 %	20 %	295698300
66	NC_014109	ATAAA	2	10	63987	63996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014109	AGAAA	2	10	65125	65134	80 %	0 %	20 %	0 %	295698301
68	NC_014109	CCAAG	2	10	65166	65175	40 %	0 %	20 %	40 %	295698301
69	NC_014109	TCATT	2	10	65204	65213	20 %	60 %	0 %	20 %	295698301
70	NC_014109	AATTT	2	10	67102	67111	40 %	60 %	0 %	0 %	295698302
71	NC_014109	TTTCT	2	10	67223	67232	0 %	80 %	0 %	20 %	295698302
72	NC_014109	AATAC	2	10	68017	68026	60 %	20 %	0 %	20 %	295698303
73	NC_014109	TCTCT	2	10	69138	69147	0 %	60 %	0 %	40 %	295698304
74	NC_014109	TTTTC	2	10	70482	70491	0 %	80 %	0 %	20 %	295698305
75	NC_014109	TTTTA	2	10	71704	71713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014109	TCTGT	2	10	71947	71956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014109	AATTT	2	10	72717	72726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014109	TATAT	2	10	73242	73251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014109	ATGGG	2	10	73528	73537	20 %	20 %	60 %	0 %	295698309
80	NC_014109	GAAGA	2	10	73973	73982	60 %	0 %	40 %	0 %	295698309
81	NC_014109	CAATT	2	10	74733	74742	40 %	40 %	0 %	20 %	295698309
82	NC_014109	TTTCA	2	10	75472	75481	20 %	60 %	0 %	20 %	295698309
83	NC_014109	TTGAT	2	10	79343	79352	20 %	60 %	20 %	0 %	295698312
84	NC_014109	ATATA	2	10	79806	79815	60 %	40 %	0 %	0 %	295698312
85	NC_014109	GTTAT	2	10	80218	80227	20 %	60 %	20 %	0 %	295698313
86	NC_014109	TATCA	2	10	80719	80728	40 %	40 %	0 %	20 %	295698313
87	NC_014109	TATTT	2	10	80888	80897	20 %	80 %	0 %	0 %	295698313
88	NC_014109	TTTTA	2	10	83235	83244	20 %	80 %	0 %	0 %	295698318
89	NC_014109	TAATA	2	10	84607	84616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014109	TAAAA	2	10	84648	84657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014109	TTTAC	2	10	85508	85517	20 %	60 %	0 %	20 %	295698321
92	NC_014109	AAACT	2	10	86353	86362	60 %	20 %	0 %	20 %	295698322
93	NC_014109	AACTA	2	10	87279	87288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014109	AAAAG	2	10	88513	88522	80 %	0 %	20 %	0 %	295698325
95	NC_014109	TAACA	2	10	88817	88826	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
96	NC_014109	ATCAA	2	10	89926	89935	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
97	NC_014109	TACAA	2	10	90557	90566	60 %	20 %	0 %	20 %	295698325
98	NC_014109	TTGGA	2	10	92723	92732	20 %	40 %	40 %	0 %	295698328
99	NC_014109	TGGTT	2	10	94035	94044	0 %	60 %	40 %	0 %	295698329
100	NC_014109	TTGAT	2	10	94139	94148	20 %	60 %	20 %	0 %	295698329
101	NC_014109	ACAAT	2	10	95263	95272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014109	AAATT	2	10	95820	95829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014109	AGAAA	2	10	97839	97848	80 %	0 %	20 %	0 %	295698332
104	NC_014109	AAAAT	2	10	98711	98720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014109	TTAAT	2	10	101242	101251	40 %	60 %	0 %	0 %	295698336
106	NC_014109	AATTT	2	10	102403	102412	40 %	60 %	0 %	0 %	295698336
107	NC_014109	TATAA	2	10	103136	103145	60 %	40 %	0 %	0 %	295698337
108	NC_014109	TGAAA	2	10	103610	103619	60 %	20 %	20 %	0 %	295698337
109	NC_014109	TAATC	2	10	107657	107666	40 %	40 %	0 %	20 %	295698339
110	NC_014109	CAGAT	2	10	109330	109339	40 %	20 %	20 %	20 %	295698339
111	NC_014109	CAATT	2	10	111456	111465	40 %	40 %	0 %	20 %	295698342
112	NC_014109	AAATC	2	10	111868	111877	60 %	20 %	0 %	20 %	295698342
113	NC_014109	TGGAT	2	10	112097	112106	20 %	40 %	40 %	0 %	295698342
114	NC_014109	ATTTT	2	10	112531	112540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014109	ATACA	2	10	113974	113983	60 %	20 %	0 %	20 %	295698344
116	NC_014109	TCTTT	2	10	114903	114912	0 %	80 %	0 %	20 %	295698344
117	NC_014109	AAAAG	2	10	117610	117619	80 %	0 %	20 %	0 %	295698346
118	NC_014109	AATCA	2	10	117874	117883	60 %	20 %	0 %	20 %	295698346
119	NC_014109	GAAAT	2	10	118511	118520	60 %	20 %	20 %	0 %	295698347
120	NC_014109	AAGAA	2	10	118527	118536	80 %	0 %	20 %	0 %	295698347
121	NC_014109	TTCGA	2	10	119925	119934	20 %	40 %	20 %	20 %	295698347
122	NC_014109	AAATT	2	10	120436	120445	60 %	40 %	0 %	0 %	295698348
123	NC_014109	ATTTT	2	10	120906	120915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014109	TGCAA	2	10	123773	123782	40 %	20 %	20 %	20 %	295698350
125	NC_014109	CTGAG	2	10	124204	124213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014109	AAAAT	2	10	125262	125271	80 %	20 %	0 %	0 %	295698352
127	NC_014109	TTTAA	2	10	127377	127386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014109	ACTTT	2	10	130642	130651	20 %	60 %	0 %	20 %	295698358
129	NC_014109	TTTTA	2	10	131263	131272	20 %	80 %	0 %	0 %	295698359
130	NC_014109	TATCT	2	10	132147	132156	20 %	60 %	0 %	20 %	295698360
131	NC_014109	TTGAT	2	10	133560	133569	20 %	60 %	20 %	0 %	295698361
132	NC_014109	CTTTT	2	10	133673	133682	0 %	80 %	0 %	20 %	295698361
133	NC_014109	TTTGT	2	10	135577	135586	0 %	80 %	20 %	0 %	295698362
134	NC_014109	ATGAT	2	10	136161	136170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014109	GAATT	2	10	136703	136712	40 %	40 %	20 %	0 %	295698365
136	NC_014109	TCTAT	2	10	136810	136819	20 %	60 %	0 %	20 %	295698365
137	NC_014109	TTAAA	2	10	137757	137766	60 %	40 %	0 %	0 %	295698365
138	NC_014109	TCTTT	2	10	138574	138583	0 %	80 %	0 %	20 %	295698366
139	NC_014109	AGAAA	2	10	139569	139578	80 %	0 %	20 %	0 %	295698367
140	NC_014109	TCAAT	2	10	140318	140327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014109	GTAAA	2	10	141476	141485	60 %	20 %	20 %	0 %	295698368
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