MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 7492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	GAA	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014109	AAT	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	ATT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014109	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014109	ATA	3	9	664	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014109	ATA	2	6	690	695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014109	ACT	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698241
9	NC_014109	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
10	NC_014109	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
11	NC_014109	GTT	2	6	981	986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698241
12	NC_014109	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
13	NC_014109	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
14	NC_014109	GAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698241
15	NC_014109	GGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698241
16	NC_014109	ATT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
17	NC_014109	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014109	TAG	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014109	TAT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	TAG	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014109	AAG	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	TCC	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698242
24	NC_014109	CTA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
25	NC_014109	TTC	2	6	2340	2345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698242
26	NC_014109	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698242
27	NC_014109	TGT	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698242
28	NC_014109	GTA	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698242
29	NC_014109	TAA	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
30	NC_014109	TAT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698242
31	NC_014109	CAT	2	6	2672	2677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
32	NC_014109	AAT	2	6	2680	2685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
33	NC_014109	AAG	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698242
34	NC_014109	TCT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
35	NC_014109	AAT	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
36	NC_014109	TAA	2	6	2997	3002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
37	NC_014109	CTC	3	9	3026	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
38	NC_014109	TAA	2	6	3165	3170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
39	NC_014109	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
40	NC_014109	CTG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698243
41	NC_014109	TCT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
42	NC_014109	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698243
43	NC_014109	TCC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
44	NC_014109	AGA	3	9	3360	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698243
45	NC_014109	AGT	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698243
46	NC_014109	CCT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
47	NC_014109	AGC	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698243
48	NC_014109	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
49	NC_014109	TTC	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
50	NC_014109	GCT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014109	TAA	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	TTG	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	ATT	3	9	3968	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	GAA	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014109	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014109	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014109	ATT	2	6	4172	4177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014109	GAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014109	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
60	NC_014109	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698245
61	NC_014109	AAG	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
62	NC_014109	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
63	NC_014109	TAA	2	6	5070	5075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698246
64	NC_014109	ATA	2	6	5193	5198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698246
65	NC_014109	ATT	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698246
66	NC_014109	TGT	2	6	5413	5418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698246
67	NC_014109	TTA	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698247
68	NC_014109	ATT	2	6	5658	5663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698247
69	NC_014109	ATA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
70	NC_014109	TGA	2	6	5876	5881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
71	NC_014109	AAT	2	6	5892	5897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
72	NC_014109	AGG	3	9	5948	5956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698247
73	NC_014109	TGT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698247
74	NC_014109	ATG	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
75	NC_014109	AAT	2	6	6075	6080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
76	NC_014109	GAA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698247
77	NC_014109	GAT	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
78	NC_014109	AGA	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698247
79	NC_014109	CAT	2	6	6597	6602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698247
80	NC_014109	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698247
81	NC_014109	ACA	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014109	AAG	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698248
83	NC_014109	CAG	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698248
84	NC_014109	GAT	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698248
85	NC_014109	CTT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
86	NC_014109	TCT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
87	NC_014109	TCT	2	6	7153	7158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
88	NC_014109	TTC	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
89	NC_014109	GAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698248
90	NC_014109	TGT	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698248
91	NC_014109	TCA	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698248
92	NC_014109	CTT	2	6	7472	7477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
93	NC_014109	AAT	2	6	7511	7516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698248
94	NC_014109	TGA	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698248
95	NC_014109	CCT	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698248
96	NC_014109	ATT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698248
97	NC_014109	ATA	2	6	7749	7754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014109	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014109	GTT	2	6	8095	8100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698249
100	NC_014109	TCT	2	6	8101	8106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698249
101	NC_014109	CAA	2	6	8144	8149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295698249
102	NC_014109	ATT	2	6	8185	8190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698249
103	NC_014109	GGA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698249
104	NC_014109	AAG	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698249
105	NC_014109	TTC	2	6	8517	8522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698249
106	NC_014109	TAA	2	6	8571	8576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014109	ATT	2	6	8579	8584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014109	TAT	2	6	8619	8624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014109	AAT	2	6	8625	8630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014109	AGA	2	6	8824	8829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698250
111	NC_014109	TAT	2	6	8938	8943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698250
112	NC_014109	CAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698250
113	NC_014109	GCT	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698250
114	NC_014109	ACA	2	6	9177	9182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295698250
115	NC_014109	TTA	3	9	9273	9281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698250
116	NC_014109	CTG	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698250
117	NC_014109	TCA	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698250
118	NC_014109	GGT	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698250
119	NC_014109	ATT	2	6	9506	9511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698250
120	NC_014109	TTA	2	6	9603	9608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698250
121	NC_014109	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014109	ATT	2	6	9889	9894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014109	TAA	2	6	9965	9970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698251
124	NC_014109	GGA	3	9	10019	10027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698251
125	NC_014109	CAT	2	6	10053	10058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698251
126	NC_014109	GCA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698251
127	NC_014109	AAG	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698251
128	NC_014109	TGA	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698251
129	NC_014109	CAA	3	9	10306	10314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295698251
130	NC_014109	TTC	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698251
131	NC_014109	GAA	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698251
132	NC_014109	GAA	3	9	10482	10490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698251
133	NC_014109	GAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698251
134	NC_014109	AGA	2	6	10535	10540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698251
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136	NC_014109	ATC	2	6	10647	10652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698251
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138	NC_014109	TCT	2	6	10782	10787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698251
139	NC_014109	TGT	2	6	10793	10798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_014109	AAT	2	6	21850	21855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698264
262	NC_014109	ATC	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698265
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266	NC_014109	GAA	2	6	22321	22326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_014109	TGA	2	6	22754	22759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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