MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA plasmid pPAN

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013962	GAAA	2	8	33	40	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013962	GGAA	3	12	232	243	50 %	0 %	50 %	0 %	292493921
3	NC_013962	GTTG	2	8	481	488	0 %	50 %	50 %	0 %	292493921
4	NC_013962	CGAA	2	8	682	689	50 %	0 %	25 %	25 %	292493921
5	NC_013962	GTTC	2	8	891	898	0 %	50 %	25 %	25 %	292493921
6	NC_013962	GATT	2	8	1194	1201	25 %	50 %	25 %	0 %	292493922
7	NC_013962	AAGG	2	8	1513	1520	50 %	0 %	50 %	0 %	292493922
8	NC_013962	TGAT	2	8	1796	1803	25 %	50 %	25 %	0 %	292493922
9	NC_013962	CATT	2	8	2227	2234	25 %	50 %	0 %	25 %	292493924
10	NC_013962	ATCA	2	8	2305	2312	50 %	25 %	0 %	25 %	292493924
11	NC_013962	TCGA	2	8	2389	2396	25 %	25 %	25 %	25 %	292493924
12	NC_013962	GGAT	2	8	2431	2438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013962	CATC	2	8	2464	2471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013962	TCCT	2	8	2672	2679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013962	CAAG	2	8	2873	2880	50 %	0 %	25 %	25 %	292493925
16	NC_013962	GATC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	25 %	25 %	292493925
17	NC_013962	CGTC	2	8	3302	3309	0 %	25 %	25 %	50 %	292493925
18	NC_013962	TGAT	2	8	3523	3530	25 %	50 %	25 %	0 %	292493925
19	NC_013962	TCGA	2	8	3567	3574	25 %	25 %	25 %	25 %	292493926
20	NC_013962	GGAT	2	8	3609	3616	25 %	25 %	50 %	0 %	292493926
21	NC_013962	CATC	2	8	3642	3649	25 %	25 %	0 %	50 %	292493926
22	NC_013962	TCCT	2	8	3850	3857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013962	CAAG	2	8	4051	4058	50 %	0 %	25 %	25 %	292493927
24	NC_013962	GATC	2	8	4311	4318	25 %	25 %	25 %	25 %	292493927
25	NC_013962	CGTC	2	8	4480	4487	0 %	25 %	25 %	50 %	292493927
26	NC_013962	TGAT	2	8	4701	4708	25 %	50 %	25 %	0 %	292493927
27	NC_013962	TCGA	2	8	4745	4752	25 %	25 %	25 %	25 %	292493928
28	NC_013962	GGAT	2	8	4787	4794	25 %	25 %	50 %	0 %	292493928
29	NC_013962	CATC	2	8	4820	4827	25 %	25 %	0 %	50 %	292493928
30	NC_013962	TCCT	2	8	5028	5035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013962	ATCG	2	8	5235	5242	25 %	25 %	25 %	25 %	292493929
32	NC_013962	GTTT	2	8	6208	6215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013962	CTTA	2	8	6875	6882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013962	ATTA	2	8	6945	6952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013962	GAAT	2	8	7059	7066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013962	ATTA	2	8	7288	7295	50 %	50 %	0 %	0 %	292493932
37	NC_013962	TTGT	2	8	7483	7490	0 %	75 %	25 %	0 %	292493932
38	NC_013962	GAAA	2	8	7661	7668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.