MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD2

Total Repeats: 498

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013718	GAT	2	6	67	72	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488384
2	NC_013718	CTT	2	6	79	84	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488384
3	NC_013718	TTA	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488384
4	NC_013718	TCT	2	6	123	128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488384
5	NC_013718	CGA	2	6	150	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488384
6	NC_013718	TCC	2	6	219	224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283488384
7	NC_013718	ATT	2	6	341	346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488384
8	NC_013718	ATA	2	6	399	404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488384
9	NC_013718	ACC	2	6	445	450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283488385
10	NC_013718	ACC	3	9	770	778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013718	CTG	2	6	861	866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013718	TGG	2	6	920	925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013718	AAC	2	6	926	931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013718	CTT	2	6	966	971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488386
15	NC_013718	TCT	3	9	1099	1107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488386
16	NC_013718	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488386
17	NC_013718	AGC	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488386
18	NC_013718	ATT	2	6	1248	1253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488386
19	NC_013718	ACA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488387
20	NC_013718	TGT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488387
21	NC_013718	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488387
22	NC_013718	AAT	2	6	1752	1757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488388
23	NC_013718	GCA	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488388
24	NC_013718	GCG	2	6	1901	1906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283488388
25	NC_013718	TGA	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488388
26	NC_013718	CAG	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488388
27	NC_013718	GCA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013718	CCT	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283488389
29	NC_013718	TAT	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488389
30	NC_013718	TGT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488390
31	NC_013718	CAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488390
32	NC_013718	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488390
33	NC_013718	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283488391
34	NC_013718	ATG	2	6	2935	2940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488391
35	NC_013718	ATC	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488391
36	NC_013718	GCT	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013718	ATA	2	6	3223	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013718	TCT	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488392
39	NC_013718	GCC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283488392
40	NC_013718	TCA	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488392
41	NC_013718	TCA	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488392
42	NC_013718	TCA	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488392
43	NC_013718	GAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488392
44	NC_013718	TGC	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488392
45	NC_013718	AAT	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488393
46	NC_013718	GCA	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488393
47	NC_013718	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283488393
48	NC_013718	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488393
49	NC_013718	CAG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488393
50	NC_013718	GCA	2	6	4135	4140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013718	CAA	2	6	4589	4594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488394
52	NC_013718	ACC	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283488394
53	NC_013718	ACC	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283488394
54	NC_013718	TTC	2	6	4626	4631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488394
55	NC_013718	TTC	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488394
56	NC_013718	GGC	2	6	4692	4697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283488394
57	NC_013718	GCT	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488395
58	NC_013718	CTT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488395
59	NC_013718	TCA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488395
60	NC_013718	TCA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488396
61	NC_013718	TAG	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488396
62	NC_013718	TGG	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283488396
63	NC_013718	ATA	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013718	TTA	2	6	5365	5370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013718	ATG	2	6	5572	5577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488397
66	NC_013718	TGA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013718	TCA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013718	AAC	3	9	5920	5928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013718	CGC	2	6	5964	5969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013718	GCA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013718	ATA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013718	TGA	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013718	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013718	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013718	AAT	2	6	6683	6688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488398
76	NC_013718	ATG	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488398
77	NC_013718	TTG	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488398
78	NC_013718	TCT	2	6	6781	6786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488398
79	NC_013718	CTG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488398
80	NC_013718	TTC	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488398
81	NC_013718	CTG	2	6	7317	7322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488398
82	NC_013718	TGT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488398
83	NC_013718	ATG	2	6	7431	7436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488398
84	NC_013718	ATG	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488398
85	NC_013718	TGC	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013718	GAT	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013718	ATG	2	6	7814	7819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488399
88	NC_013718	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488399
89	NC_013718	GCT	2	6	7888	7893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488399
90	NC_013718	GTT	3	9	7906	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488399
91	NC_013718	TTG	2	6	7948	7953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488399
92	NC_013718	GTT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488399
93	NC_013718	TGC	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488399
94	NC_013718	TGG	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283488399
95	NC_013718	GAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283488399
96	NC_013718	TAA	2	6	8298	8303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488400
97	NC_013718	AAC	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488400
98	NC_013718	TTC	2	6	8325	8330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488400
99	NC_013718	TGT	2	6	8331	8336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488400
100	NC_013718	TTA	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488400
101	NC_013718	ATT	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488400
102	NC_013718	ATG	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488400
103	NC_013718	ATG	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488400
104	NC_013718	GAT	2	6	8797	8802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488400
105	NC_013718	TGC	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488401
106	NC_013718	ATA	3	9	8975	8983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283488401
107	NC_013718	TGA	2	6	9039	9044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488401
108	NC_013718	GTT	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488402
109	NC_013718	GAT	2	6	9291	9296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488402
110	NC_013718	TAT	2	6	9368	9373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013718	TCT	2	6	9396	9401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488403
112	NC_013718	CTT	3	9	9424	9432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488403
113	NC_013718	AAC	2	6	9473	9478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488403
114	NC_013718	ATC	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488404
115	NC_013718	TTC	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488404
116	NC_013718	TGC	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488404
117	NC_013718	ATC	3	9	9839	9847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488404
118	NC_013718	GCA	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488404
119	NC_013718	CAT	2	6	10008	10013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013718	CCG	2	6	10080	10085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013718	TAT	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013718	AAT	2	6	10128	10133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013718	ATC	2	6	10202	10207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488405
124	NC_013718	GTT	2	6	10229	10234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488405
125	NC_013718	ATC	2	6	10298	10303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488405
126	NC_013718	CAA	2	6	10540	10545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488405
127	NC_013718	GCC	2	6	10760	10765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283488405
128	NC_013718	TCC	2	6	10806	10811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013718	ATT	2	6	10899	10904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488406
130	NC_013718	ATT	2	6	10909	10914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488406
131	NC_013718	AAG	2	6	10933	10938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283488406
132	NC_013718	CTT	2	6	11027	11032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488406
133	NC_013718	CAG	2	6	11047	11052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488406
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138	NC_013718	TGG	2	6	11367	11372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283488406
139	NC_013718	TCT	2	6	11386	11391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488406
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155	NC_013718	TAT	2	6	12962	12967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_013718	GAT	2	6	19248	19253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283488416
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249	NC_013718	TAA	2	6	19450	19455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_013718	GAT	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_013718	TAA	2	6	19513	19518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_013718	AGA	2	6	19630	19635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_013718	TCG	2	6	19827	19832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283488417
254	NC_013718	TTC	2	6	20202	20207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488418
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256	NC_013718	GAC	2	6	20257	20262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488418
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258	NC_013718	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283488418
259	NC_013718	TTA	2	6	20482	20487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488418
260	NC_013718	ACA	2	6	20506	20511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488418
261	NC_013718	TCA	2	6	20591	20596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488418
262	NC_013718	GTT	2	6	20615	20620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013718	CGC	2	6	20624	20629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_013718	GCG	2	6	20656	20661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_013718	TCA	2	6	20706	20711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488419
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272	NC_013718	TTA	2	6	21269	21274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488420
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291	NC_013718	ATC	2	6	22712	22717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_013718	AGC	2	6	22830	22835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488421
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351	NC_013718	ATC	2	6	27479	27484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283488425
352	NC_013718	ATT	2	6	27504	27509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488425
353	NC_013718	CAA	2	6	27590	27595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283488426
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372	NC_013718	TCT	2	6	29065	29070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488427
373	NC_013718	TTA	2	6	29220	29225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_013718	GAA	2	6	29264	29269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
375	NC_013718	AAG	2	6	29286	29291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
376	NC_013718	AAG	2	6	29379	29384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_013718	AAT	2	6	29414	29419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_013718	ATA	2	6	29489	29494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
379	NC_013718	TTA	2	6	29502	29507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_013718	CAA	2	6	29547	29552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_013718	TCT	2	6	29646	29651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488429
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383	NC_013718	TTC	2	6	29780	29785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283488429
384	NC_013718	CAG	2	6	29855	29860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283488429
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391	NC_013718	TAT	2	6	30659	30664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283488429
392	NC_013718	TGT	2	6	30725	30730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
393	NC_013718	TGT	2	6	30749	30754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
394	NC_013718	CAT	2	6	30798	30803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_013718	TTG	2	6	31061	31066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_013718	AAT	2	6	32424	32429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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