MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CGT	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013717	TCG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013717	GTA	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013717	GAG	2	6	229	234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013717	CGT	2	6	355	360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777747
6	NC_013717	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777747
7	NC_013717	AGA	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013717	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013717	CAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013717	CTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777748
11	NC_013717	CAA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777749
12	NC_013717	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
13	NC_013717	GCT	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
14	NC_013717	CAC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777749
15	NC_013717	CTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
16	NC_013717	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
17	NC_013717	CGC	2	6	1301	1306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
18	NC_013717	CGT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
19	NC_013717	CGT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
20	NC_013717	CCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013717	AAT	2	6	1670	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013717	TCA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013717	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013717	ACT	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013717	GCG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777750
26	NC_013717	ACA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777750
27	NC_013717	ACC	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777750
28	NC_013717	TGT	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777750
29	NC_013717	TCT	2	6	2229	2234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777750
30	NC_013717	TCG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777750
31	NC_013717	CGG	2	6	2438	2443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013717	AAC	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013717	GCC	2	6	2476	2481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013717	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777751
35	NC_013717	CTG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
36	NC_013717	CCG	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777751
37	NC_013717	GTG	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
38	NC_013717	CTG	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
39	NC_013717	CGT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
40	NC_013717	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
41	NC_013717	TCG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
42	NC_013717	CTG	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
43	NC_013717	TGG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
44	NC_013717	GTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
45	NC_013717	CTG	3	9	3187	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
46	NC_013717	TGC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
47	NC_013717	TTG	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
48	NC_013717	GAA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
49	NC_013717	ACC	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777752
50	NC_013717	GAA	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
51	NC_013717	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777752
52	NC_013717	CTG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777752
53	NC_013717	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
54	NC_013717	AGG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777752
55	NC_013717	AGC	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777753
56	NC_013717	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777753
57	NC_013717	GTT	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777753
58	NC_013717	GCC	2	6	3905	3910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777753
59	NC_013717	ACA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013717	CTG	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013717	GCC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777754
62	NC_013717	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777754
63	NC_013717	GCA	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777754
64	NC_013717	TCT	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
65	NC_013717	TCA	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777754
66	NC_013717	TCG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777754
67	NC_013717	CTT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
68	NC_013717	GCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013717	CGT	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013717	ATT	2	6	4858	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013717	TGT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777755
72	NC_013717	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777755
73	NC_013717	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777755
74	NC_013717	TCT	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777755
75	NC_013717	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777756
76	NC_013717	ATG	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777757
77	NC_013717	AAT	2	6	5677	5682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777757
78	NC_013717	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013717	TAT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013717	TCC	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283777758
81	NC_013717	ACA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777758
82	NC_013717	ATG	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777758
83	NC_013717	CTG	2	6	5858	5863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
84	NC_013717	CTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
85	NC_013717	AAT	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777758
86	NC_013717	CAG	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777758
87	NC_013717	CTG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
88	NC_013717	CTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
89	NC_013717	CAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777758
90	NC_013717	CTG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
91	NC_013717	CAC	2	6	6150	6155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777758
92	NC_013717	TGG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777758
93	NC_013717	CTG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
94	NC_013717	CAG	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777758
95	NC_013717	TGA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777758
96	NC_013717	GTC	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
97	NC_013717	ACC	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
98	NC_013717	GTG	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
99	NC_013717	GTG	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
100	NC_013717	GCG	2	6	7276	7281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
101	NC_013717	ACC	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
102	NC_013717	GTG	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
103	NC_013717	GCG	2	6	7333	7338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
104	NC_013717	ACC	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
105	NC_013717	GTG	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
106	NC_013717	GGC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
107	NC_013717	TGC	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
108	NC_013717	TGG	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
109	NC_013717	TCA	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777759
110	NC_013717	ACC	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
111	NC_013717	GTG	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
112	NC_013717	TGC	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
113	NC_013717	CAT	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777759
114	NC_013717	GTG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
115	NC_013717	CGG	2	6	7940	7945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
116	NC_013717	ACC	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777759
117	NC_013717	GTG	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
118	NC_013717	GGC	2	6	7998	8003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
119	NC_013717	TGC	2	6	8122	8127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
120	NC_013717	GGA	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777759
121	NC_013717	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
122	NC_013717	GGC	2	6	8217	8222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
123	NC_013717	TGC	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
124	NC_013717	GGA	2	6	8355	8360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777759
125	NC_013717	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
126	NC_013717	GGC	2	6	8436	8441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
127	NC_013717	TGC	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
128	NC_013717	GGA	2	6	8574	8579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777759
129	NC_013717	TGG	2	6	8594	8599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
130	NC_013717	GTG	2	6	8629	8634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777759
131	NC_013717	GGC	2	6	8655	8660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777759
132	NC_013717	TGC	2	6	8779	8784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777759
133	NC_013717	GGA	2	6	8793	8798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777759
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259	NC_013717	CCT	2	6	17265	17270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283777765
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