MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 1138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	CTCCG	2	10	4	13	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013717	CGT	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013717	TCG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013717	A	6	6	184	189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013717	GTA	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013717	GAG	2	6	229	234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013717	CAGA	2	8	246	253	50 %	0 %	25 %	25 %	283777747
8	NC_013717	CGT	2	6	355	360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777747
9	NC_013717	TGA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777747
10	NC_013717	AGA	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013717	TGGC	2	8	562	569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013717	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013717	CAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013717	CTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777748
15	NC_013717	CAA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777749
16	NC_013717	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
17	NC_013717	GCT	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
18	NC_013717	CAC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777749
19	NC_013717	CTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
20	NC_013717	CT	3	6	1130	1135	0 %	50 %	0 %	50 %	283777749
21	NC_013717	TACC	2	8	1186	1193	25 %	25 %	0 %	50 %	283777749
22	NC_013717	CCGA	2	8	1229	1236	25 %	0 %	25 %	50 %	283777749
23	NC_013717	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
24	NC_013717	GGTGGC	2	12	1282	1293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	283777749
25	NC_013717	CGC	2	6	1301	1306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777749
26	NC_013717	ACAG	2	8	1326	1333	50 %	0 %	25 %	25 %	283777749
27	NC_013717	CAGA	2	8	1421	1428	50 %	0 %	25 %	25 %	283777749
28	NC_013717	GC	3	6	1450	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	283777749
29	NC_013717	CGT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
30	NC_013717	CGT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777749
31	NC_013717	CCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013717	AAT	2	6	1670	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013717	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013717	A	6	6	1743	1748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013717	TCA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013717	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013717	ACT	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013717	CATT	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013717	CCTGT	2	10	1995	2004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013717	GACA	2	8	2006	2013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013717	GCG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777750
42	NC_013717	ACA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777750
43	NC_013717	ACC	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777750
44	NC_013717	CCCT	2	8	2128	2135	0 %	25 %	0 %	75 %	283777750
45	NC_013717	GCCCC	2	10	2151	2160	0 %	0 %	20 %	80 %	283777750
46	NC_013717	TGT	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777750
47	NC_013717	TCT	2	6	2229	2234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777750
48	NC_013717	TCG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777750
49	NC_013717	CT	3	6	2348	2353	0 %	50 %	0 %	50 %	283777750
50	NC_013717	ATCA	2	8	2409	2416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013717	CGG	2	6	2438	2443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013717	AAC	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013717	GCC	2	6	2476	2481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013717	TA	3	6	2539	2544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013717	GCTG	2	8	2637	2644	0 %	25 %	50 %	25 %	283777751
56	NC_013717	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	283777751
57	NC_013717	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777751
58	NC_013717	CTG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
59	NC_013717	TG	3	6	2756	2761	0 %	50 %	50 %	0 %	283777751
60	NC_013717	CCG	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777751
61	NC_013717	GTG	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
62	NC_013717	CTGC	2	8	2896	2903	0 %	25 %	25 %	50 %	283777751
63	NC_013717	CTG	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
64	NC_013717	CGT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
65	NC_013717	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
66	NC_013717	TCG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
67	NC_013717	CTG	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
68	NC_013717	TGG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
69	NC_013717	GTG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777751
70	NC_013717	CTG	3	9	3187	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
71	NC_013717	TGC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777751
72	NC_013717	TTG	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777751
73	NC_013717	GT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013717	T	7	7	3290	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013717	GAA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
76	NC_013717	ACC	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777752
77	NC_013717	GAA	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
78	NC_013717	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777752
79	NC_013717	CTG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777752
80	NC_013717	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777752
81	NC_013717	AGG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777752
82	NC_013717	AGC	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777753
83	NC_013717	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283777753
84	NC_013717	GCCT	2	8	3710	3717	0 %	25 %	25 %	50 %	283777753
85	NC_013717	GTT	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777753
86	NC_013717	GCC	2	6	3905	3910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777753
87	NC_013717	G	6	6	3935	3940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013717	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013717	ACA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013717	CCAG	2	8	4261	4268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013717	CTG	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013717	TCCG	2	8	4336	4343	0 %	25 %	25 %	50 %	283777754
93	NC_013717	GCC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777754
94	NC_013717	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777754
95	NC_013717	GCA	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777754
96	NC_013717	TCT	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
97	NC_013717	TCA	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777754
98	NC_013717	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	283777754
99	NC_013717	TCG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777754
100	NC_013717	CTT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777754
101	NC_013717	AGCCGC	2	12	4745	4756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013717	GCCT	2	8	4759	4766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013717	GCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013717	CGT	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013717	ATT	2	6	4858	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013717	G	7	7	4893	4899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013717	TGT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777755
108	NC_013717	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777755
109	NC_013717	T	6	6	5045	5050	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
110	NC_013717	TCCCC	2	10	5066	5075	0 %	20 %	0 %	80 %	283777755
111	NC_013717	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777755
112	NC_013717	T	9	9	5108	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
113	NC_013717	TCT	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777755
114	NC_013717	TATT	2	8	5167	5174	25 %	75 %	0 %	0 %	283777755
115	NC_013717	T	7	7	5177	5183	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
116	NC_013717	TA	3	6	5193	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	283777755
117	NC_013717	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	283777755
118	NC_013717	A	8	8	5214	5221	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
119	NC_013717	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
120	NC_013717	T	7	7	5275	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	283777756
121	NC_013717	GT	3	6	5302	5307	0 %	50 %	50 %	0 %	283777756
122	NC_013717	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777756
123	NC_013717	ATG	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777757
124	NC_013717	GACA	2	8	5592	5599	50 %	0 %	25 %	25 %	283777757
125	NC_013717	CTGT	2	8	5602	5609	0 %	50 %	25 %	25 %	283777757
126	NC_013717	T	6	6	5632	5637	0 %	100 %	0 %	0 %	283777757
127	NC_013717	AAT	2	6	5677	5682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777757
128	NC_013717	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013717	TAT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013717	T	6	6	5747	5752	0 %	100 %	0 %	0 %	283777758
131	NC_013717	TCC	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283777758
132	NC_013717	ACA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777758
133	NC_013717	ATG	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777758
134	NC_013717	TCCT	2	8	5829	5836	0 %	50 %	0 %	50 %	283777758
135	NC_013717	CTG	2	6	5858	5863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
136	NC_013717	CTG	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
137	NC_013717	AAT	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777758
138	NC_013717	CAG	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777758
139	NC_013717	CTG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
140	NC_013717	CTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777758
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