MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 1138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013717	GCC	2	6	22913	22918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777771
502	NC_013717	C	6	6	22917	22922	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
503	NC_013717	GCT	2	6	22961	22966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
504	NC_013717	T	6	6	23021	23026	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
505	NC_013717	CTG	2	6	23074	23079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
506	NC_013717	GTT	2	6	23159	23164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
507	NC_013717	GTG	2	6	23280	23285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777771
508	NC_013717	CCGG	2	8	23361	23368	0 %	0 %	50 %	50 %	283777771
509	NC_013717	TTC	2	6	23412	23417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777771
510	NC_013717	TTC	2	6	23564	23569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777771
511	NC_013717	GTT	2	6	23600	23605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
512	NC_013717	CCG	2	6	23664	23669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777771
513	NC_013717	GTA	2	6	23681	23686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777771
514	NC_013717	TGC	2	6	23687	23692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
515	NC_013717	AGA	2	6	23735	23740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777771
516	NC_013717	TGG	2	6	23776	23781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777771
517	NC_013717	CTG	2	6	23819	23824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
518	NC_013717	ATGT	2	8	23874	23881	25 %	50 %	25 %	0 %	283777771
519	NC_013717	TTC	2	6	23946	23951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283777771
520	NC_013717	ACC	2	6	24002	24007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777771
521	NC_013717	AG	3	6	24017	24022	50 %	0 %	50 %	0 %	283777771
522	NC_013717	GCA	2	6	24052	24057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777771
523	NC_013717	GGTGA	2	10	24066	24075	20 %	20 %	60 %	0 %	283777771
524	NC_013717	CCG	2	6	24105	24110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777771
525	NC_013717	GTT	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
526	NC_013717	CGT	2	6	24181	24186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
527	NC_013717	CTG	2	6	24187	24192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
528	NC_013717	CAT	2	6	24250	24255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283777771
529	NC_013717	AATA	2	8	24263	24270	75 %	25 %	0 %	0 %	283777771
530	NC_013717	TGT	2	6	24566	24571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
531	NC_013717	TG	3	6	24619	24624	0 %	50 %	50 %	0 %	283777771
532	NC_013717	AAT	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777771
533	NC_013717	GCT	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
534	NC_013717	T	7	7	24663	24669	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
535	NC_013717	GATA	2	8	24715	24722	50 %	25 %	25 %	0 %	283777771
536	NC_013717	T	6	6	24755	24760	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
537	NC_013717	C	8	8	24845	24852	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
538	NC_013717	AAAT	2	8	24861	24868	75 %	25 %	0 %	0 %	283777771
539	NC_013717	ATAG	2	8	24941	24948	50 %	25 %	25 %	0 %	283777771
540	NC_013717	CAA	2	6	25087	25092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777771
541	NC_013717	AAT	2	6	25153	25158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777771
542	NC_013717	C	6	6	25163	25168	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
543	NC_013717	TCC	2	6	25181	25186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283777771
544	NC_013717	CCG	2	6	25224	25229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777771
545	NC_013717	TTTATT	2	12	25247	25258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	283777771
546	NC_013717	GTT	2	6	25281	25286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
547	NC_013717	TAT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777771
548	NC_013717	TTG	2	6	25332	25337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
549	NC_013717	TTG	2	6	25419	25424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
550	NC_013717	T	6	6	25463	25468	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
551	NC_013717	TTA	2	6	25473	25478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777771
552	NC_013717	GTT	2	6	25515	25520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
553	NC_013717	GCAT	2	8	25551	25558	25 %	25 %	25 %	25 %	283777771
554	NC_013717	TAA	2	6	25595	25600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777771
555	NC_013717	TGCC	2	8	25610	25617	0 %	25 %	25 %	50 %	283777771
556	NC_013717	TAT	2	6	25667	25672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777771
557	NC_013717	CTG	2	6	25756	25761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777771
558	NC_013717	GTT	2	6	25920	25925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777771
559	NC_013717	CAC	2	6	25984	25989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777771
560	NC_013717	T	6	6	25992	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
561	NC_013717	CAAGAT	2	12	26050	26061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	283777771
562	NC_013717	AGC	2	6	26096	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777771
563	NC_013717	AAT	2	6	26114	26119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777771
564	NC_013717	AGGA	2	8	26124	26131	50 %	0 %	50 %	0 %	283777771
565	NC_013717	CAA	2	6	26137	26142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777771
566	NC_013717	CCTG	2	8	26159	26166	0 %	25 %	25 %	50 %	283777771
567	NC_013717	CG	3	6	26179	26184	0 %	0 %	50 %	50 %	283777771
568	NC_013717	AT	3	6	26240	26245	50 %	50 %	0 %	0 %	283777771
569	NC_013717	ATA	2	6	26280	26285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013717	AAAT	2	8	26290	26297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013717	ATAACC	2	12	26316	26327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013717	AGG	2	6	26341	26346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013717	AT	3	6	26350	26355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013717	TTTTA	2	10	26415	26424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013717	GTT	2	6	26455	26460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013717	AGA	2	6	26478	26483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013717	CGG	2	6	26485	26490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013717	ATT	2	6	26554	26559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013717	TGTGT	2	10	26560	26569	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013717	TGT	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013717	CTGA	2	8	26644	26651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013717	GCC	2	6	26830	26835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_013717	TAC	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013717	GAT	2	6	26934	26939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013717	GAAA	2	8	26948	26955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013717	CAG	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013717	AAT	2	6	26989	26994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013717	TGG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013717	TTA	2	6	27067	27072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777772
590	NC_013717	GGA	2	6	27081	27086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777772
591	NC_013717	CCAG	2	8	27114	27121	25 %	0 %	25 %	50 %	283777772
592	NC_013717	GAA	2	6	27124	27129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283777772
593	NC_013717	GTG	2	6	27208	27213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283777772
594	NC_013717	TTA	2	6	27314	27319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777772
595	NC_013717	GCA	2	6	27329	27334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283777772
596	NC_013717	TGA	2	6	27521	27526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013717	CAA	2	6	27527	27532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013717	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013717	TTC	2	6	27635	27640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013717	CT	3	6	27657	27662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_013717	G	6	6	27734	27739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013717	CCTGAC	2	12	27774	27785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013717	TGA	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013717	CCT	2	6	27829	27834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_013717	AGT	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013717	GGT	2	6	27907	27912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013717	GAACA	2	10	27959	27968	60 %	0 %	20 %	20 %	283777773
608	NC_013717	ATT	2	6	27970	27975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283777773
609	NC_013717	CTG	2	6	27981	27986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777773
610	NC_013717	GCC	2	6	27987	27992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777773
611	NC_013717	GT	3	6	28010	28015	0 %	50 %	50 %	0 %	283777773
612	NC_013717	ATCA	2	8	28134	28141	50 %	25 %	0 %	25 %	283777773
613	NC_013717	TTG	2	6	28174	28179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777773
614	NC_013717	ATA	2	6	28213	28218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283777773
615	NC_013717	GCT	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283777773
616	NC_013717	A	6	6	28304	28309	100 %	0 %	0 %	0 %	283777773
617	NC_013717	ATTT	2	8	28325	28332	25 %	75 %	0 %	0 %	283777773
618	NC_013717	CCA	2	6	28357	28362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283777773
619	NC_013717	C	6	6	28442	28447	0 %	0 %	0 %	100 %	283777773
620	NC_013717	ATG	2	6	28599	28604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777773
621	NC_013717	AGAC	2	8	28765	28772	50 %	0 %	25 %	25 %	283777773
622	NC_013717	GTT	2	6	28812	28817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283777773
623	NC_013717	GAT	2	6	28911	28916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283777773
624	NC_013717	GA	3	6	29021	29026	50 %	0 %	50 %	0 %	283777773
625	NC_013717	CAA	2	6	29088	29093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283777773
626	NC_013717	CA	3	6	29240	29245	50 %	0 %	0 %	50 %	283777773
627	NC_013717	T	6	6	29372	29377	0 %	100 %	0 %	0 %	283777773
628	NC_013717	GAG	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283777773
629	NC_013717	TGGC	2	8	29411	29418	0 %	25 %	50 %	25 %	283777773
630	NC_013717	CCG	2	6	29495	29500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283777773
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632	NC_013717	G	7	7	29612	29618	0 %	0 %	100 %	0 %	283777773
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