MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 11242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	AC	3	6	122	127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013716	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
3	NC_013716	GC	3	6	841	846	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
4	NC_013716	GC	3	6	966	971	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
5	NC_013716	GC	3	6	1309	1314	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
6	NC_013716	GC	3	6	1425	1430	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
7	NC_013716	GC	4	8	1573	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	283783781
8	NC_013716	CT	3	6	2269	2274	0 %	50 %	0 %	50 %	283783781
9	NC_013716	GC	4	8	3336	3343	0 %	0 %	50 %	50 %	283783782
10	NC_013716	GC	3	6	3535	3540	0 %	0 %	50 %	50 %	283783782
11	NC_013716	GC	3	6	3938	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
12	NC_013716	CG	3	6	4183	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
13	NC_013716	CG	3	6	4639	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	283783783
14	NC_013716	AG	3	6	4859	4864	50 %	0 %	50 %	0 %	283783783
15	NC_013716	CG	3	6	5284	5289	0 %	0 %	50 %	50 %	283783784
16	NC_013716	GC	3	6	5690	5695	0 %	0 %	50 %	50 %	283783784
17	NC_013716	GC	3	6	6748	6753	0 %	0 %	50 %	50 %	283783785
18	NC_013716	GC	3	6	6815	6820	0 %	0 %	50 %	50 %	283783785
19	NC_013716	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	283783785
20	NC_013716	TA	3	6	7489	7494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013716	AC	3	6	7681	7686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013716	TC	3	6	7799	7804	0 %	50 %	0 %	50 %	283783786
23	NC_013716	CG	3	6	7886	7891	0 %	0 %	50 %	50 %	283783786
24	NC_013716	CT	3	6	7991	7996	0 %	50 %	0 %	50 %	283783786
25	NC_013716	TG	3	6	8930	8935	0 %	50 %	50 %	0 %	283783787
26	NC_013716	GT	3	6	9383	9388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013716	GC	3	6	10537	10542	0 %	0 %	50 %	50 %	283783788
28	NC_013716	GC	5	10	11008	11017	0 %	0 %	50 %	50 %	283783789
29	NC_013716	GC	3	6	11537	11542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013716	GC	3	6	11800	11805	0 %	0 %	50 %	50 %	283783790
31	NC_013716	CG	3	6	13127	13132	0 %	0 %	50 %	50 %	283783790
32	NC_013716	GC	3	6	13439	13444	0 %	0 %	50 %	50 %	283783790
33	NC_013716	TC	3	6	13689	13694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013716	GC	3	6	14446	14451	0 %	0 %	50 %	50 %	283783791
35	NC_013716	TA	3	6	15817	15822	50 %	50 %	0 %	0 %	283783792
36	NC_013716	AT	3	6	16112	16117	50 %	50 %	0 %	0 %	283783792
37	NC_013716	GC	3	6	16529	16534	0 %	0 %	50 %	50 %	283783793
38	NC_013716	CT	4	8	16712	16719	0 %	50 %	0 %	50 %	283783794
39	NC_013716	GA	3	6	16978	16983	50 %	0 %	50 %	0 %	283783794
40	NC_013716	TC	3	6	17066	17071	0 %	50 %	0 %	50 %	283783794
41	NC_013716	CT	3	6	17727	17732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013716	AT	3	6	17864	17869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013716	TA	3	6	18160	18165	50 %	50 %	0 %	0 %	283783796
44	NC_013716	TC	3	6	19126	19131	0 %	50 %	0 %	50 %	283783796
45	NC_013716	AG	3	6	20689	20694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013716	GC	3	6	20854	20859	0 %	0 %	50 %	50 %	283783797
47	NC_013716	CT	3	6	20960	20965	0 %	50 %	0 %	50 %	283783797
48	NC_013716	TG	3	6	21296	21301	0 %	50 %	50 %	0 %	283783797
49	NC_013716	CT	3	6	21806	21811	0 %	50 %	0 %	50 %	283783797
50	NC_013716	CG	4	8	21843	21850	0 %	0 %	50 %	50 %	283783797
51	NC_013716	GA	3	6	22748	22753	50 %	0 %	50 %	0 %	283783798
52	NC_013716	GC	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013716	GC	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013716	GC	3	6	23261	23266	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
55	NC_013716	GC	3	6	23540	23545	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
56	NC_013716	GC	3	6	23799	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
57	NC_013716	CG	3	6	24198	24203	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
58	NC_013716	CG	3	6	25529	25534	0 %	0 %	50 %	50 %	283783800
59	NC_013716	AT	3	6	25932	25937	50 %	50 %	0 %	0 %	283783800
60	NC_013716	GC	3	6	25996	26001	0 %	0 %	50 %	50 %	283783800
61	NC_013716	AT	3	6	26386	26391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013716	GC	3	6	26974	26979	0 %	0 %	50 %	50 %	283783802
63	NC_013716	GT	3	6	27381	27386	0 %	50 %	50 %	0 %	283783804
64	NC_013716	GC	3	6	27538	27543	0 %	0 %	50 %	50 %	283783804
65	NC_013716	CG	3	6	28808	28813	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
66	NC_013716	CG	3	6	29060	29065	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
67	NC_013716	GC	3	6	29481	29486	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
68	NC_013716	GC	4	8	29599	29606	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
69	NC_013716	CG	3	6	29769	29774	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
70	NC_013716	GC	3	6	30247	30252	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
71	NC_013716	CG	3	6	30283	30288	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
72	NC_013716	GC	3	6	30558	30563	0 %	0 %	50 %	50 %	283783805
73	NC_013716	GC	3	6	31445	31450	0 %	0 %	50 %	50 %	283783806
74	NC_013716	CT	3	6	32258	32263	0 %	50 %	0 %	50 %	283783807
75	NC_013716	CG	3	6	32606	32611	0 %	0 %	50 %	50 %	283783808
76	NC_013716	GC	3	6	32672	32677	0 %	0 %	50 %	50 %	283783808
77	NC_013716	GC	4	8	32902	32909	0 %	0 %	50 %	50 %	283783808
78	NC_013716	GA	3	6	33761	33766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013716	GC	3	6	34327	34332	0 %	0 %	50 %	50 %	283783809
80	NC_013716	GA	3	6	34680	34685	50 %	0 %	50 %	0 %	283783810
81	NC_013716	GC	3	6	35729	35734	0 %	0 %	50 %	50 %	283783811
82	NC_013716	CT	3	6	36664	36669	0 %	50 %	0 %	50 %	283783812
83	NC_013716	CT	3	6	37036	37041	0 %	50 %	0 %	50 %	283783813
84	NC_013716	GA	3	6	37239	37244	50 %	0 %	50 %	0 %	283783814
85	NC_013716	CG	3	6	38257	38262	0 %	0 %	50 %	50 %	283783814
86	NC_013716	GC	4	8	41289	41296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013716	CT	3	6	41818	41823	0 %	50 %	0 %	50 %	283783817
88	NC_013716	GC	3	6	42782	42787	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
89	NC_013716	GC	3	6	42986	42991	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
90	NC_013716	CG	3	6	43598	43603	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
91	NC_013716	CG	3	6	44023	44028	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
92	NC_013716	CG	3	6	44704	44709	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
93	NC_013716	CG	4	8	45224	45231	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
94	NC_013716	GC	3	6	45788	45793	0 %	0 %	50 %	50 %	283783818
95	NC_013716	TG	3	6	46166	46171	0 %	50 %	50 %	0 %	283783819
96	NC_013716	GC	3	6	46876	46881	0 %	0 %	50 %	50 %	283783820
97	NC_013716	GC	3	6	48243	48248	0 %	0 %	50 %	50 %	283783821
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99	NC_013716	GC	3	6	49514	49519	0 %	0 %	50 %	50 %	283783822
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102	NC_013716	CG	4	8	52065	52072	0 %	0 %	50 %	50 %	283783824
103	NC_013716	GC	3	6	52233	52238	0 %	0 %	50 %	50 %	283783824
104	NC_013716	CG	3	6	53932	53937	0 %	0 %	50 %	50 %	283783826
105	NC_013716	GC	4	8	54386	54393	0 %	0 %	50 %	50 %	283783826
106	NC_013716	CG	3	6	54553	54558	0 %	0 %	50 %	50 %	283783827
107	NC_013716	GC	3	6	55302	55307	0 %	0 %	50 %	50 %	283783827
108	NC_013716	GC	3	6	55812	55817	0 %	0 %	50 %	50 %	283783828
109	NC_013716	GC	3	6	56634	56639	0 %	0 %	50 %	50 %	283783828
110	NC_013716	CA	3	6	56798	56803	50 %	0 %	0 %	50 %	283783829
111	NC_013716	GC	3	6	56957	56962	0 %	0 %	50 %	50 %	283783829
112	NC_013716	CG	3	6	56981	56986	0 %	0 %	50 %	50 %	283783829
113	NC_013716	AG	3	6	58325	58330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013716	GC	3	6	58836	58841	0 %	0 %	50 %	50 %	283783831
115	NC_013716	AG	3	6	60578	60583	50 %	0 %	50 %	0 %	283783833
116	NC_013716	AT	3	6	62754	62759	50 %	50 %	0 %	0 %	283783833
117	NC_013716	AT	3	6	63047	63052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013716	GC	3	6	64163	64168	0 %	0 %	50 %	50 %	283783835
119	NC_013716	GC	3	6	64486	64491	0 %	0 %	50 %	50 %	283783835
120	NC_013716	CA	3	6	66419	66424	50 %	0 %	0 %	50 %	283783837
121	NC_013716	GC	3	6	66834	66839	0 %	0 %	50 %	50 %	283783838
122	NC_013716	CG	4	8	66938	66945	0 %	0 %	50 %	50 %	283783838
123	NC_013716	AC	4	8	67712	67719	50 %	0 %	0 %	50 %	283783839
124	NC_013716	CG	3	6	67815	67820	0 %	0 %	50 %	50 %	283783840
125	NC_013716	GC	3	6	68340	68345	0 %	0 %	50 %	50 %	283783840
126	NC_013716	CG	3	6	69302	69307	0 %	0 %	50 %	50 %	283783841
127	NC_013716	GC	3	6	69578	69583	0 %	0 %	50 %	50 %	283783842
128	NC_013716	GC	3	6	69732	69737	0 %	0 %	50 %	50 %	283783842
129	NC_013716	CG	3	6	69971	69976	0 %	0 %	50 %	50 %	283783842
130	NC_013716	CG	3	6	71708	71713	0 %	0 %	50 %	50 %	283783843
131	NC_013716	CG	3	6	73278	73283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013716	GC	3	6	74164	74169	0 %	0 %	50 %	50 %	283783844
133	NC_013716	CG	3	6	74632	74637	0 %	0 %	50 %	50 %	283783845
134	NC_013716	CG	3	6	74788	74793	0 %	0 %	50 %	50 %	283783845
135	NC_013716	GC	3	6	75225	75230	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
136	NC_013716	GC	3	6	75298	75303	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
137	NC_013716	GC	3	6	76330	76335	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
138	NC_013716	CG	3	6	76531	76536	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
139	NC_013716	CG	3	6	76606	76611	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
140	NC_013716	CG	3	6	76632	76637	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
141	NC_013716	GC	3	6	76813	76818	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
142	NC_013716	CA	3	6	77191	77196	50 %	0 %	0 %	50 %	283783846
143	NC_013716	GA	3	6	77412	77417	50 %	0 %	50 %	0 %	283783846
144	NC_013716	CG	3	6	77485	77490	0 %	0 %	50 %	50 %	283783846
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