MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 12483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	CAGA	2	8	132	139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013716	CAGG	2	8	396	403	25 %	0 %	50 %	25 %	283783781
3	NC_013716	ACCA	2	8	442	449	50 %	0 %	0 %	50 %	283783781
4	NC_013716	CCAG	2	8	1979	1986	25 %	0 %	25 %	50 %	283783781
5	NC_013716	GATG	2	8	2340	2347	25 %	25 %	50 %	0 %	283783781
6	NC_013716	ACCA	2	8	2916	2923	50 %	0 %	0 %	50 %	283783782
7	NC_013716	ATGA	2	8	3105	3112	50 %	25 %	25 %	0 %	283783782
8	NC_013716	CAGC	2	8	3260	3267	25 %	0 %	25 %	50 %	283783782
9	NC_013716	CTGG	2	8	3620	3627	0 %	25 %	50 %	25 %	283783782
10	NC_013716	TAAT	2	8	3705	3712	50 %	50 %	0 %	0 %	283783782
11	NC_013716	GATG	2	8	4610	4617	25 %	25 %	50 %	0 %	283783783
12	NC_013716	AGCC	2	8	4620	4627	25 %	0 %	25 %	50 %	283783783
13	NC_013716	CAAA	2	8	6343	6350	75 %	0 %	0 %	25 %	283783785
14	NC_013716	TGCC	2	8	6424	6431	0 %	25 %	25 %	50 %	283783785
15	NC_013716	GCCA	2	8	6688	6695	25 %	0 %	25 %	50 %	283783785
16	NC_013716	CGCC	2	8	7183	7190	0 %	0 %	25 %	75 %	283783785
17	NC_013716	CAAC	2	8	7788	7795	50 %	0 %	0 %	50 %	283783786
18	NC_013716	TTGA	2	8	7841	7848	25 %	50 %	25 %	0 %	283783786
19	NC_013716	AAGA	2	8	8264	8271	75 %	0 %	25 %	0 %	283783786
20	NC_013716	GCTG	3	12	8395	8406	0 %	25 %	50 %	25 %	283783786
21	NC_013716	CTGT	2	8	8695	8702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013716	CCTT	2	8	8703	8710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013716	GCTT	2	8	8850	8857	0 %	50 %	25 %	25 %	283783787
24	NC_013716	TCTT	2	8	10113	10120	0 %	75 %	0 %	25 %	283783788
25	NC_013716	CTGC	2	8	10345	10352	0 %	25 %	25 %	50 %	283783788
26	NC_013716	ATTT	2	8	10467	10474	25 %	75 %	0 %	0 %	283783788
27	NC_013716	ATTG	2	8	11394	11401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013716	ATTT	2	8	11543	11550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013716	CAAC	2	8	11762	11769	50 %	0 %	0 %	50 %	283783790
30	NC_013716	TGGT	2	8	11876	11883	0 %	50 %	50 %	0 %	283783790
31	NC_013716	ACCG	2	8	12243	12250	25 %	0 %	25 %	50 %	283783790
32	NC_013716	CAAC	2	8	12389	12396	50 %	0 %	0 %	50 %	283783790
33	NC_013716	AAGA	2	8	12463	12470	75 %	0 %	25 %	0 %	283783790
34	NC_013716	GTAA	2	8	13663	13670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013716	AAAG	2	8	13739	13746	75 %	0 %	25 %	0 %	283783791
36	NC_013716	GTCC	2	8	14666	14673	0 %	25 %	25 %	50 %	283783791
37	NC_013716	TCAT	2	8	14913	14920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013716	ATAA	2	8	14948	14955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013716	TTTA	2	8	14972	14979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013716	CGCC	2	8	15274	15281	0 %	0 %	25 %	75 %	283783792
41	NC_013716	GAAC	2	8	15900	15907	50 %	0 %	25 %	25 %	283783792
42	NC_013716	GGGA	2	8	16314	16321	25 %	0 %	75 %	0 %	283783793
43	NC_013716	TAAA	2	8	16572	16579	75 %	25 %	0 %	0 %	283783793
44	NC_013716	TTTG	2	8	17255	17262	0 %	75 %	25 %	0 %	283783795
45	NC_013716	ATTA	2	8	17682	17689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013716	TAAA	2	8	17778	17785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013716	TGAA	2	8	17848	17855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013716	GAAC	2	8	17981	17988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013716	ATTA	2	8	18041	18048	50 %	50 %	0 %	0 %	283783796
50	NC_013716	AAGT	2	8	18106	18113	50 %	25 %	25 %	0 %	283783796
51	NC_013716	AGGG	2	8	18235	18242	25 %	0 %	75 %	0 %	283783796
52	NC_013716	AGAC	2	8	20206	20213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013716	GTAC	2	8	20365	20372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013716	CATC	2	8	20434	20441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013716	GGCG	2	8	21386	21393	0 %	0 %	75 %	25 %	283783797
56	NC_013716	TGGC	2	8	21627	21634	0 %	25 %	50 %	25 %	283783797
57	NC_013716	GGCA	2	8	21662	21669	25 %	0 %	50 %	25 %	283783797
58	NC_013716	TTTA	2	8	22011	22018	25 %	75 %	0 %	0 %	283783798
59	NC_013716	TCAG	2	8	22341	22348	25 %	25 %	25 %	25 %	283783798
60	NC_013716	CTGA	2	8	22818	22825	25 %	25 %	25 %	25 %	283783798
61	NC_013716	GATC	2	8	22976	22983	25 %	25 %	25 %	25 %	283783799
62	NC_013716	GCAG	2	8	23204	23211	25 %	0 %	50 %	25 %	283783799
63	NC_013716	CCAG	2	8	23735	23742	25 %	0 %	25 %	50 %	283783799
64	NC_013716	CCAG	2	8	23882	23889	25 %	0 %	25 %	50 %	283783799
65	NC_013716	ATAG	2	8	24839	24846	50 %	25 %	25 %	0 %	283783799
66	NC_013716	GCCA	2	8	25338	25345	25 %	0 %	25 %	50 %	283783800
67	NC_013716	AGAA	2	8	25987	25994	75 %	0 %	25 %	0 %	283783800
68	NC_013716	TTTC	2	8	26374	26381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013716	AATT	2	8	26508	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013716	AGAA	2	8	26645	26652	75 %	0 %	25 %	0 %	283783801
71	NC_013716	CAAC	2	8	26728	26735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013716	CATA	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	283783804
73	NC_013716	TCAG	2	8	27362	27369	25 %	25 %	25 %	25 %	283783804
74	NC_013716	GGCG	2	8	28077	28084	0 %	0 %	75 %	25 %	283783804
75	NC_013716	CGGT	2	8	29376	29383	0 %	25 %	50 %	25 %	283783805
76	NC_013716	GTTC	2	8	30480	30487	0 %	50 %	25 %	25 %	283783805
77	NC_013716	GCTG	2	8	31157	31164	0 %	25 %	50 %	25 %	283783806
78	NC_013716	TCAT	2	8	33544	33551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013716	CCTT	2	8	33665	33672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013716	AGCC	2	8	33675	33682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013716	GATG	2	8	33951	33958	25 %	25 %	50 %	0 %	283783809
82	NC_013716	CAGC	2	8	34080	34087	25 %	0 %	25 %	50 %	283783809
83	NC_013716	CCCG	2	8	34489	34496	0 %	0 %	25 %	75 %	283783809
84	NC_013716	GCCA	2	8	34982	34989	25 %	0 %	25 %	50 %	283783810
85	NC_013716	TGAC	2	8	36360	36367	25 %	25 %	25 %	25 %	283783812
86	NC_013716	GTGG	2	8	37149	37156	0 %	25 %	75 %	0 %	283783813
87	NC_013716	TTCT	2	8	37452	37459	0 %	75 %	0 %	25 %	283783814
88	NC_013716	CCGG	2	8	37691	37698	0 %	0 %	50 %	50 %	283783814
89	NC_013716	CAAG	2	8	38310	38317	50 %	0 %	25 %	25 %	283783814
90	NC_013716	AGAA	2	8	38839	38846	75 %	0 %	25 %	0 %	283783814
91	NC_013716	GGGC	2	8	39145	39152	0 %	0 %	75 %	25 %	283783815
92	NC_013716	GCCT	2	8	40141	40148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013716	CCCG	2	8	40490	40497	0 %	0 %	25 %	75 %	283783816
94	NC_013716	GCGG	2	8	40884	40891	0 %	0 %	75 %	25 %	283783816
95	NC_013716	AGTT	2	8	41314	41321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013716	AGTG	2	8	41499	41506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013716	TCCT	2	8	41661	41668	0 %	50 %	0 %	50 %	283783817
98	NC_013716	CTTA	2	8	41689	41696	25 %	50 %	0 %	25 %	283783817
99	NC_013716	AGCC	2	8	42591	42598	25 %	0 %	25 %	50 %	283783817
100	NC_013716	GACC	2	8	42858	42865	25 %	0 %	25 %	50 %	283783818
101	NC_013716	CGTC	2	8	43198	43205	0 %	25 %	25 %	50 %	283783818
102	NC_013716	CACC	2	8	43289	43296	25 %	0 %	0 %	75 %	283783818
103	NC_013716	CGCC	2	8	43445	43452	0 %	0 %	25 %	75 %	283783818
104	NC_013716	GTCG	2	8	43830	43837	0 %	25 %	50 %	25 %	283783818
105	NC_013716	ATCG	2	8	44065	44072	25 %	25 %	25 %	25 %	283783818
106	NC_013716	TCCG	2	8	44355	44362	0 %	25 %	25 %	50 %	283783818
107	NC_013716	GCAG	2	8	45042	45049	25 %	0 %	50 %	25 %	283783818
108	NC_013716	CCAC	2	8	45611	45618	25 %	0 %	0 %	75 %	283783818
109	NC_013716	CTGG	2	8	45987	45994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013716	CAAG	2	8	46030	46037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013716	TCAG	2	8	47301	47308	25 %	25 %	25 %	25 %	283783820
112	NC_013716	CGCC	2	8	47398	47405	0 %	0 %	25 %	75 %	283783820
113	NC_013716	CAGC	2	8	47973	47980	25 %	0 %	25 %	50 %	283783821
114	NC_013716	CAGA	2	8	48272	48279	50 %	0 %	25 %	25 %	283783821
115	NC_013716	GCCA	2	8	49545	49552	25 %	0 %	25 %	50 %	283783822
116	NC_013716	GGTG	2	8	50038	50045	0 %	25 %	75 %	0 %	283783822
117	NC_013716	AGAC	2	8	50432	50439	50 %	0 %	25 %	25 %	283783822
118	NC_013716	ATAA	2	8	50445	50452	75 %	25 %	0 %	0 %	283783822
119	NC_013716	TCCA	2	8	51466	51473	25 %	25 %	0 %	50 %	283783823
120	NC_013716	CACG	2	8	52208	52215	25 %	0 %	25 %	50 %	283783824
121	NC_013716	CACC	2	8	52269	52276	25 %	0 %	0 %	75 %	283783824
122	NC_013716	CCAG	2	8	53036	53043	25 %	0 %	25 %	50 %	283783824
123	NC_013716	GTGC	2	8	53647	53654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013716	CCGG	2	8	55168	55175	0 %	0 %	50 %	50 %	283783827
125	NC_013716	ATGG	2	8	55192	55199	25 %	25 %	50 %	0 %	283783827
126	NC_013716	CAGG	2	8	55432	55439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013716	CTGT	2	8	56074	56081	0 %	50 %	25 %	25 %	283783828
128	NC_013716	GGAT	2	8	56394	56401	25 %	25 %	50 %	0 %	283783828
129	NC_013716	GAGC	2	8	56718	56725	25 %	0 %	50 %	25 %	283783828
130	NC_013716	CCGG	2	8	56860	56867	0 %	0 %	50 %	50 %	283783829
131	NC_013716	GTCG	2	8	58657	58664	0 %	25 %	50 %	25 %	283783831
132	NC_013716	GCTG	2	8	59012	59019	0 %	25 %	50 %	25 %	283783831
133	NC_013716	GCTG	2	8	59420	59427	0 %	25 %	50 %	25 %	283783831
134	NC_013716	CCGA	2	8	59509	59516	25 %	0 %	25 %	50 %	283783831
135	NC_013716	GCTG	2	8	59703	59710	0 %	25 %	50 %	25 %	283783831
136	NC_013716	GAGC	2	8	60071	60078	25 %	0 %	50 %	25 %	283783832
137	NC_013716	TTCA	2	8	60235	60242	25 %	50 %	0 %	25 %	283783833
138	NC_013716	AATC	2	8	60549	60556	50 %	25 %	0 %	25 %	283783833
139	NC_013716	GCCA	2	8	60802	60809	25 %	0 %	25 %	50 %	283783833
140	NC_013716	CGCC	2	8	60906	60913	0 %	0 %	25 %	75 %	283783833
141	NC_013716	CAAT	2	8	61566	61573	50 %	25 %	0 %	25 %	283783833
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143	NC_013716	AAAT	2	8	63256	63263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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