MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 119367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013716	CGG	2	6	178011	178016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783932
4003	NC_013716	GAA	2	6	178102	178107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783933
4004	NC_013716	GCC	2	6	178148	178153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783933
4005	NC_013716	GCC	2	6	178172	178177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783933
4006	NC_013716	CGC	2	6	178188	178193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783933
4007	NC_013716	CTG	2	6	178199	178204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783933
4008	NC_013716	GC	3	6	178206	178211	0 %	0 %	50 %	50 %	283783933
4009	NC_013716	GAA	2	6	178275	178280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783933
4010	NC_013716	CTG	2	6	178286	178291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783933
4011	NC_013716	GGC	2	6	178306	178311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783933
4012	NC_013716	GC	3	6	178310	178315	0 %	0 %	50 %	50 %	283783933
4013	NC_013716	AGC	2	6	178338	178343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783933
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4015	NC_013716	CGG	2	6	178357	178362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783933
4016	NC_013716	GC	4	8	178381	178388	0 %	0 %	50 %	50 %	283783933
4017	NC_013716	CTGGCG	2	12	178529	178540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283783933
4018	NC_013716	CTG	3	9	178541	178549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783933
4019	NC_013716	GCA	2	6	178555	178560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783933
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4023	NC_013716	TGCC	2	8	178628	178635	0 %	25 %	25 %	50 %	283783933
4024	NC_013716	CGG	2	6	178644	178649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783933
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4030	NC_013716	TGC	2	6	178848	178853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783933
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4032	NC_013716	AGC	2	6	178887	178892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783933
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4041	NC_013716	CGCC	2	8	179267	179274	0 %	0 %	25 %	75 %	283783933
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4044	NC_013716	A	6	6	179355	179360	100 %	0 %	0 %	0 %	283783933
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4071	NC_013716	CCCG	2	8	180298	180305	0 %	0 %	25 %	75 %	283783933
4072	NC_013716	GCT	2	6	180388	180393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783933
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4077	NC_013716	TCT	3	9	180622	180630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_013716	AGA	2	6	180641	180646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013716	GTC	2	6	180761	180766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
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4089	NC_013716	CTG	2	6	181066	181071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
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4092	NC_013716	CG	4	8	181195	181202	0 %	0 %	50 %	50 %	283783934
4093	NC_013716	ATA	2	6	181247	181252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783934
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4101	NC_013716	AGCG	2	8	181525	181532	25 %	0 %	50 %	25 %	283783934
4102	NC_013716	GATG	2	8	181575	181582	25 %	25 %	50 %	0 %	283783934
4103	NC_013716	GCG	2	6	181643	181648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783934
4104	NC_013716	CAG	2	6	181723	181728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4105	NC_013716	GCT	2	6	181731	181736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4106	NC_013716	GCG	2	6	181800	181805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783934
4107	NC_013716	TGC	2	6	181814	181819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4108	NC_013716	CTG	2	6	181822	181827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4109	NC_013716	CAG	3	9	181831	181839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4110	NC_013716	CG	3	6	181895	181900	0 %	0 %	50 %	50 %	283783934
4111	NC_013716	TC	3	6	181910	181915	0 %	50 %	0 %	50 %	283783934
4112	NC_013716	TC	3	6	181983	181988	0 %	50 %	0 %	50 %	283783934
4113	NC_013716	CAC	2	6	182004	182009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783934
4114	NC_013716	CGC	2	6	182031	182036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783934
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4116	NC_013716	GAA	2	6	182070	182075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783934
4117	NC_013716	TGG	2	6	182111	182116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783934
4118	NC_013716	GC	3	6	182139	182144	0 %	0 %	50 %	50 %	283783934
4119	NC_013716	CGG	2	6	182151	182156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783934
4120	NC_013716	CG	3	6	182185	182190	0 %	0 %	50 %	50 %	283783934
4121	NC_013716	GC	3	6	182197	182202	0 %	0 %	50 %	50 %	283783934
4122	NC_013716	ACCT	2	8	182233	182240	25 %	25 %	0 %	50 %	283783934
4123	NC_013716	AGCC	2	8	182251	182258	25 %	0 %	25 %	50 %	283783934
4124	NC_013716	CGC	2	6	182333	182338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783934
4125	NC_013716	ACG	2	6	182342	182347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783934
4126	NC_013716	TGG	2	6	182381	182386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783934
4127	NC_013716	CGG	2	6	182447	182452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783934
4128	NC_013716	TGAC	2	8	182453	182460	25 %	25 %	25 %	25 %	283783934
4129	NC_013716	TGC	2	6	182513	182518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783934
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4132	NC_013716	GGC	2	6	182682	182687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783934
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4136	NC_013716	TGGG	2	8	182851	182858	0 %	25 %	75 %	0 %	283783934
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4153	NC_013716	GTT	2	6	183398	183403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_013716	TGCT	2	8	183437	183444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_013716	ATT	2	6	183465	183470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_013716	ATA	3	9	183479	183487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_013716	TCA	2	6	183515	183520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4197	NC_013716	GCG	2	6	185345	185350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783935
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4231	NC_013716	TTA	2	6	186665	186670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783937
4232	NC_013716	GCCCG	2	10	186708	186717	0 %	0 %	40 %	60 %	283783937
4233	NC_013716	CG	3	6	186716	186721	0 %	0 %	50 %	50 %	283783937
4234	NC_013716	CTG	3	9	186773	186781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783937
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4236	NC_013716	CTG	2	6	186902	186907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783937
4237	NC_013716	TGGTC	2	10	186930	186939	0 %	40 %	40 %	20 %	283783937
4238	NC_013716	GC	3	6	186971	186976	0 %	0 %	50 %	50 %	283783937
4239	NC_013716	AAC	2	6	187014	187019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783937
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4242	NC_013716	CGG	2	6	187077	187082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783937
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4245	NC_013716	GCA	2	6	187284	187289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783937
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4487	NC_013716	GCA	2	6	195462	195467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4488	NC_013716	GCT	2	6	195519	195524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4489	NC_013716	TTG	2	6	195569	195574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783945
4490	NC_013716	CCTG	2	8	195581	195588	0 %	25 %	25 %	50 %	283783945
4491	NC_013716	CCG	2	6	195607	195612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783945
4492	NC_013716	GCG	2	6	195631	195636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783945
4493	NC_013716	CGG	2	6	195668	195673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783945
4494	NC_013716	AGCC	2	8	195682	195689	25 %	0 %	25 %	50 %	283783945
4495	NC_013716	CTGCGC	2	12	195721	195732	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283783945
4496	NC_013716	GCG	2	6	195759	195764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783945
4497	NC_013716	ACCTG	2	10	195842	195851	20 %	20 %	20 %	40 %	283783945
4498	NC_013716	TGG	2	6	195892	195897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783945
4499	NC_013716	ATT	2	6	195923	195928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783945
4500	NC_013716	CTA	2	6	195945	195950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783945

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