MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 119367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013716	GGCA	2	8	21662	21669	25 %	0 %	50 %	25 %	283783797
502	NC_013716	GGC	2	6	21753	21758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783797
503	NC_013716	CT	3	6	21806	21811	0 %	50 %	0 %	50 %	283783797
504	NC_013716	CG	4	8	21843	21850	0 %	0 %	50 %	50 %	283783797
505	NC_013716	G	6	6	21883	21888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013716	ACC	2	6	21948	21953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783798
507	NC_013716	TTA	2	6	21955	21960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783798
508	NC_013716	GGT	2	6	21988	21993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783798
509	NC_013716	TTTA	2	8	22011	22018	25 %	75 %	0 %	0 %	283783798
510	NC_013716	CGC	2	6	22020	22025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783798
511	NC_013716	GAG	2	6	22055	22060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783798
512	NC_013716	ATT	2	6	22075	22080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783798
513	NC_013716	GGAAG	2	10	22086	22095	40 %	0 %	60 %	0 %	283783798
514	NC_013716	CTG	2	6	22205	22210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783798
515	NC_013716	CAG	2	6	22252	22257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783798
516	NC_013716	GCG	2	6	22268	22273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783798
517	NC_013716	TGC	2	6	22326	22331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783798
518	NC_013716	TCAG	2	8	22341	22348	25 %	25 %	25 %	25 %	283783798
519	NC_013716	GCA	2	6	22393	22398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783798
520	NC_013716	GCG	2	6	22431	22436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783798
521	NC_013716	CTG	2	6	22502	22507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783798
522	NC_013716	GCG	2	6	22516	22521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783798
523	NC_013716	GAC	2	6	22595	22600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783798
524	NC_013716	TCG	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783798
525	NC_013716	CGA	2	6	22681	22686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783798
526	NC_013716	GGA	2	6	22723	22728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783798
527	NC_013716	GA	3	6	22748	22753	50 %	0 %	50 %	0 %	283783798
528	NC_013716	CGG	2	6	22767	22772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783798
529	NC_013716	ATT	2	6	22804	22809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783798
530	NC_013716	CTGA	2	8	22818	22825	25 %	25 %	25 %	25 %	283783798
531	NC_013716	GC	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_013716	GC	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_013716	GCA	2	6	22868	22873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783799
534	NC_013716	GCG	2	6	22922	22927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783799
535	NC_013716	TCC	2	6	22947	22952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783799
536	NC_013716	GATC	2	8	22976	22983	25 %	25 %	25 %	25 %	283783799
537	NC_013716	CCA	2	6	23045	23050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783799
538	NC_013716	TGA	2	6	23101	23106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783799
539	NC_013716	GCAG	2	8	23204	23211	25 %	0 %	50 %	25 %	283783799
540	NC_013716	GC	3	6	23261	23266	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
541	NC_013716	AAC	2	6	23383	23388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783799
542	NC_013716	CCG	2	6	23416	23421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783799
543	NC_013716	CCA	2	6	23445	23450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783799
544	NC_013716	GACCA	2	10	23530	23539	40 %	0 %	20 %	40 %	283783799
545	NC_013716	GC	3	6	23540	23545	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
546	NC_013716	GCGCA	2	10	23569	23578	20 %	0 %	40 %	40 %	283783799
547	NC_013716	TGC	2	6	23593	23598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783799
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549	NC_013716	TCGTAG	2	12	23698	23709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283783799
550	NC_013716	CCAG	2	8	23735	23742	25 %	0 %	25 %	50 %	283783799
551	NC_013716	GTA	2	6	23763	23768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783799
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553	NC_013716	GC	3	6	23799	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
554	NC_013716	CCAG	2	8	23882	23889	25 %	0 %	25 %	50 %	283783799
555	NC_013716	GTTCC	2	10	23957	23966	0 %	40 %	20 %	40 %	283783799
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558	NC_013716	CG	3	6	24198	24203	0 %	0 %	50 %	50 %	283783799
559	NC_013716	CCG	2	6	24224	24229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783799
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564	NC_013716	CCG	2	6	24508	24513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783799
565	NC_013716	CGA	2	6	24570	24575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783799
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573	NC_013716	CCAGA	2	10	24861	24870	40 %	0 %	20 %	40 %	283783799
574	NC_013716	TAA	2	6	24887	24892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783799
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599	NC_013716	GC	3	6	25996	26001	0 %	0 %	50 %	50 %	283783800
600	NC_013716	GGC	2	6	26041	26046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783800
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607	NC_013716	AT	3	6	26386	26391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013716	TGA	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013716	TAG	2	6	26423	26428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013716	TGA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013716	AATT	2	8	26508	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013716	AACAA	2	10	26588	26597	80 %	0 %	0 %	20 %	283783801
613	NC_013716	ATT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783801
614	NC_013716	CGCAG	2	10	26618	26627	20 %	0 %	40 %	40 %	283783801
615	NC_013716	AAG	2	6	26628	26633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783801
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618	NC_013716	A	7	7	26692	26698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013716	CAAC	2	8	26728	26735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_013716	TTG	2	6	26752	26757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783802
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622	NC_013716	GCA	2	6	26866	26871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783802
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625	NC_013716	GC	3	6	26974	26979	0 %	0 %	50 %	50 %	283783802
626	NC_013716	CTT	2	6	27069	27074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013716	GCG	2	6	27113	27118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783803
628	NC_013716	AATTG	2	10	27188	27197	40 %	40 %	20 %	0 %	283783803
629	NC_013716	TTAACC	2	12	27276	27287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783803
630	NC_013716	CATA	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	283783804
631	NC_013716	TCAG	2	8	27362	27369	25 %	25 %	25 %	25 %	283783804
632	NC_013716	GT	3	6	27381	27386	0 %	50 %	50 %	0 %	283783804
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653	NC_013716	TGA	2	6	28308	28313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783805
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658	NC_013716	A	7	7	28451	28457	100 %	0 %	0 %	0 %	283783805
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756	NC_013716	GCT	2	6	33732	33737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_013716	CCG	2	6	33747	33752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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