MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 119367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013716	GCC	2	6	243489	243494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783984
5502	NC_013716	GGGC	2	8	243501	243508	0 %	0 %	75 %	25 %	283783984
5503	NC_013716	GCA	2	6	243617	243622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783984
5504	NC_013716	CGC	2	6	243632	243637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783984
5505	NC_013716	CTGG	2	8	243656	243663	0 %	25 %	50 %	25 %	283783984
5506	NC_013716	AGC	2	6	243781	243786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783985
5507	NC_013716	GCA	2	6	243817	243822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783985
5508	NC_013716	CGG	2	6	243887	243892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783985
5509	NC_013716	TGGT	2	8	243900	243907	0 %	50 %	50 %	0 %	283783985
5510	NC_013716	CGC	2	6	243922	243927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783985
5511	NC_013716	GCG	2	6	244003	244008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783985
5512	NC_013716	TGGAGT	2	12	244037	244048	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283783985
5513	NC_013716	CAA	2	6	244109	244114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783985
5514	NC_013716	ATA	2	6	244134	244139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783985
5515	NC_013716	AATG	2	8	244147	244154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_013716	CCG	2	6	244272	244277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783986
5517	NC_013716	GCT	2	6	244293	244298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5518	NC_013716	TCA	2	6	244308	244313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783986
5519	NC_013716	T	6	6	244334	244339	0 %	100 %	0 %	0 %	283783986
5520	NC_013716	CTGG	2	8	244445	244452	0 %	25 %	50 %	25 %	283783986
5521	NC_013716	GGT	2	6	244457	244462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783986
5522	NC_013716	GCG	2	6	244513	244518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783986
5523	NC_013716	GCA	2	6	244576	244581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5524	NC_013716	AGC	2	6	244626	244631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5525	NC_013716	GCG	2	6	244752	244757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783986
5526	NC_013716	CTG	2	6	244784	244789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5527	NC_013716	GCA	2	6	244855	244860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5528	NC_013716	CTG	2	6	244937	244942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783986
5529	NC_013716	TTTGAA	2	12	245051	245062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	283783986
5530	NC_013716	ATT	2	6	245086	245091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013716	TG	3	6	245097	245102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013716	ACGAT	2	10	245132	245141	40 %	20 %	20 %	20 %	283783987
5533	NC_013716	TAAA	2	8	245158	245165	75 %	25 %	0 %	0 %	283783987
5534	NC_013716	ACG	2	6	245171	245176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5535	NC_013716	TCA	2	6	245196	245201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783987
5536	NC_013716	ACC	2	6	245251	245256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783987
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5538	NC_013716	CCA	2	6	245289	245294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783987
5539	NC_013716	GCA	2	6	245346	245351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5540	NC_013716	CG	3	6	245389	245394	0 %	0 %	50 %	50 %	283783987
5541	NC_013716	CAG	2	6	245425	245430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5542	NC_013716	CCA	2	6	245439	245444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783987
5543	NC_013716	GCGCC	2	10	245460	245469	0 %	0 %	40 %	60 %	283783987
5544	NC_013716	GATG	2	8	245503	245510	25 %	25 %	50 %	0 %	283783987
5545	NC_013716	ATC	2	6	245537	245542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783987
5546	NC_013716	CAG	2	6	245548	245553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5547	NC_013716	CCG	2	6	245589	245594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783987
5548	NC_013716	CAG	2	6	245650	245655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5549	NC_013716	CAG	2	6	245737	245742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783987
5550	NC_013716	CAT	2	6	245746	245751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783987
5551	NC_013716	TTG	2	6	245825	245830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783988
5552	NC_013716	CGTGC	2	10	245831	245840	0 %	20 %	40 %	40 %	283783988
5553	NC_013716	ATG	2	6	245853	245858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783988
5554	NC_013716	CGC	2	6	245869	245874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783988
5555	NC_013716	GC	3	6	245890	245895	0 %	0 %	50 %	50 %	283783988
5556	NC_013716	TGA	2	6	245896	245901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783988
5557	NC_013716	TGT	2	6	245902	245907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783988
5558	NC_013716	GC	3	6	245924	245929	0 %	0 %	50 %	50 %	283783988
5559	NC_013716	AGC	2	6	245940	245945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
5560	NC_013716	GCA	2	6	245980	245985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
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5562	NC_013716	GCG	2	6	246082	246087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783988
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5565	NC_013716	AGC	2	6	246240	246245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
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5570	NC_013716	GCA	2	6	246301	246306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
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5572	NC_013716	CG	3	6	246326	246331	0 %	0 %	50 %	50 %	283783988
5573	NC_013716	GCC	2	6	246356	246361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783988
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5581	NC_013716	CAG	2	6	246626	246631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
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5584	NC_013716	TAT	2	6	246796	246801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5586	NC_013716	CAA	2	6	246855	246860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013716	ATCA	2	8	246890	246897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_013716	TGCC	2	8	246922	246929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5592	NC_013716	GC	3	6	247153	247158	0 %	0 %	50 %	50 %	283783989
5593	NC_013716	ATGG	2	8	247197	247204	25 %	25 %	50 %	0 %	283783989
5594	NC_013716	TAT	2	6	247246	247251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783989
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5606	NC_013716	AAAT	2	8	247573	247580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_013716	CGG	2	6	247638	247643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_013716	TG	3	6	247801	247806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_013716	GGC	2	6	247953	247958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_013716	AGC	2	6	247993	247998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5613	NC_013716	TTG	2	6	248164	248169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_013716	CGA	2	6	248192	248197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_013716	GCA	2	6	248266	248271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5617	NC_013716	GGA	2	6	248361	248366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_013716	TAA	2	6	248379	248384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_013716	AGA	2	6	248408	248413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_013716	CAG	2	6	248434	248439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_013716	G	9	9	248581	248589	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_013716	GGA	2	6	248625	248630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_013716	GGC	2	6	248645	248650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_013716	GAA	2	6	248888	248893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_013716	TGC	2	6	248964	248969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_013716	GTC	2	6	248976	248981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_013716	TTG	2	6	249037	249042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_013716	CCGG	2	8	249051	249058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_013716	GGA	2	6	249089	249094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_013716	AC	3	6	249309	249314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5633	NC_013716	GTAG	2	8	249350	249357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_013716	CCT	2	6	249450	249455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5643	NC_013716	GTT	2	6	249830	249835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5646	NC_013716	AAC	2	6	249961	249966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5656	NC_013716	GGA	2	6	250744	250749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5658	NC_013716	CGTC	2	8	250980	250987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5659	NC_013716	AAC	2	6	250999	251004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5663	NC_013716	AGCGA	2	10	251229	251238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5666	NC_013716	G	6	6	251521	251526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5671	NC_013716	GCTG	2	8	251865	251872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5743	NC_013716	C	6	6	255965	255970	0 %	0 %	0 %	100 %	283783990
5744	NC_013716	GATGTT	2	12	255979	255990	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	283783990
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