MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 119367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_013716	GC	3	6	219220	219225	0 %	0 %	50 %	50 %	283783966
5003	NC_013716	TGC	2	6	219266	219271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
5004	NC_013716	CGCGG	2	10	219280	219289	0 %	0 %	60 %	40 %	283783966
5005	NC_013716	GTG	3	9	219361	219369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783966
5006	NC_013716	CTG	2	6	219493	219498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
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5009	NC_013716	CTGG	2	8	219579	219586	0 %	25 %	50 %	25 %	283783966
5010	NC_013716	CTG	2	6	219628	219633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
5011	NC_013716	GGGAA	2	10	219636	219645	40 %	0 %	60 %	0 %	283783966
5012	NC_013716	CTG	2	6	219700	219705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
5013	NC_013716	GCT	2	6	219708	219713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
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5016	NC_013716	TGCTG	2	10	219804	219813	0 %	40 %	40 %	20 %	283783966
5017	NC_013716	GGT	2	6	219902	219907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783967
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5022	NC_013716	GGC	2	6	220346	220351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783967
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5122	NC_013716	GCG	2	6	224758	224763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783969
5123	NC_013716	GCT	2	6	224807	224812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783969
5124	NC_013716	CGT	2	6	224862	224867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783969
5125	NC_013716	TGA	2	6	224878	224883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783969
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5127	NC_013716	T	6	6	224913	224918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013716	T	6	6	224945	224950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013716	A	7	7	224958	224964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_013716	GCCA	2	8	225029	225036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_013716	A	8	8	225093	225100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_013716	CAG	3	9	225168	225176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5135	NC_013716	GGC	2	6	225312	225317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_013716	ATT	2	6	225349	225354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_013716	GTCTG	2	10	225425	225434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5138	NC_013716	TCC	2	6	225437	225442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5139	NC_013716	AAT	2	6	225454	225459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783970
5140	NC_013716	CAT	2	6	225463	225468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783970
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5144	NC_013716	A	7	7	225748	225754	100 %	0 %	0 %	0 %	283783970
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5147	NC_013716	CTG	2	6	225908	225913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783970
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5153	NC_013716	TTA	2	6	226091	226096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783970
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5161	NC_013716	GGC	2	6	226612	226617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783972
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5165	NC_013716	CCTG	2	8	226895	226902	0 %	25 %	25 %	50 %	283783972
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5245	NC_013716	ACG	2	6	231053	231058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5246	NC_013716	CGA	2	6	231138	231143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5247	NC_013716	CGC	2	6	231153	231158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783973
5248	NC_013716	GCGTG	2	10	231183	231192	0 %	20 %	60 %	20 %	283783973
5249	NC_013716	CTG	2	6	231220	231225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5250	NC_013716	GCT	2	6	231267	231272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5251	NC_013716	GC	3	6	231294	231299	0 %	0 %	50 %	50 %	283783973
5252	NC_013716	TGC	2	6	231440	231445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5253	NC_013716	GC	3	6	231444	231449	0 %	0 %	50 %	50 %	283783973
5254	NC_013716	GAT	3	9	231468	231476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783973
5255	NC_013716	GCT	2	6	231594	231599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783973
5256	NC_013716	TCT	2	6	231648	231653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783973
5257	NC_013716	A	6	6	231750	231755	100 %	0 %	0 %	0 %	283783973
5258	NC_013716	CAT	2	6	231849	231854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783974
5259	NC_013716	CGAC	2	8	231868	231875	25 %	0 %	25 %	50 %	283783974
5260	NC_013716	GTAA	2	8	231882	231889	50 %	25 %	25 %	0 %	283783974
5261	NC_013716	GCT	2	6	231920	231925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783974
5262	NC_013716	CCG	2	6	232020	232025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783974
5263	NC_013716	GAT	2	6	232077	232082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783974
5264	NC_013716	TTC	2	6	232170	232175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783974
5265	NC_013716	CGA	2	6	232230	232235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_013716	GTAA	2	8	232266	232273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_013716	ACA	2	6	232282	232287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783975
5268	NC_013716	GCG	2	6	232340	232345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783975
5269	NC_013716	TCC	2	6	232361	232366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783975
5270	NC_013716	GGCG	2	8	232385	232392	0 %	0 %	75 %	25 %	283783975
5271	NC_013716	CAT	2	6	232429	232434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783975
5272	NC_013716	GTGG	2	8	232458	232465	0 %	25 %	75 %	0 %	283783975
5273	NC_013716	GC	3	6	232484	232489	0 %	0 %	50 %	50 %	283783975
5274	NC_013716	AGGC	2	8	232561	232568	25 %	0 %	50 %	25 %	283783975
5275	NC_013716	GC	3	6	232567	232572	0 %	0 %	50 %	50 %	283783975
5276	NC_013716	CTG	2	6	232654	232659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783975
5277	NC_013716	CAG	2	6	232725	232730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783975
5278	NC_013716	GCT	2	6	232743	232748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783975
5279	NC_013716	AG	3	6	232783	232788	50 %	0 %	50 %	0 %	283783975
5280	NC_013716	GAC	2	6	232825	232830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783975
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5282	NC_013716	GCT	2	6	232944	232949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783975
5283	NC_013716	CTG	2	6	232957	232962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783975
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5285	NC_013716	GAC	2	6	232986	232991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783975
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5287	NC_013716	CGC	2	6	233056	233061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783975
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5289	NC_013716	CG	3	6	233070	233075	0 %	0 %	50 %	50 %	283783975
5290	NC_013716	CG	3	6	233093	233098	0 %	0 %	50 %	50 %	283783975
5291	NC_013716	AGG	2	6	233120	233125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783975
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5294	NC_013716	TGG	2	6	233203	233208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783975
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5299	NC_013716	TGC	2	6	233375	233380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783975
5300	NC_013716	TTG	2	6	233384	233389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783975
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5302	NC_013716	CGG	2	6	233397	233402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783975
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5304	NC_013716	TCC	2	6	233439	233444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783975
5305	NC_013716	GCGAC	2	10	233448	233457	20 %	0 %	40 %	40 %	283783975
5306	NC_013716	CGC	2	6	233462	233467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783975
5307	NC_013716	TGT	2	6	233468	233473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783975
5308	NC_013716	CTA	2	6	233554	233559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783975
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5310	NC_013716	AGC	2	6	233614	233619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5311	NC_013716	ACC	2	6	233675	233680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783976
5312	NC_013716	CG	3	6	233733	233738	0 %	0 %	50 %	50 %	283783976
5313	NC_013716	ATG	2	6	233848	233853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783976
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5315	NC_013716	GCA	2	6	233943	233948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783977
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5319	NC_013716	T	6	6	234291	234296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5320	NC_013716	GTT	2	6	234328	234333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783978
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5334	NC_013716	CAA	2	6	234929	234934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783979
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5343	NC_013716	AG	3	6	235184	235189	50 %	0 %	50 %	0 %	283783979
5344	NC_013716	ATT	2	6	235340	235345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783980
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5347	NC_013716	GCA	2	6	235412	235417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783980
5348	NC_013716	TGA	2	6	235498	235503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783980
5349	NC_013716	GC	3	6	235519	235524	0 %	0 %	50 %	50 %	283783980
5350	NC_013716	CTT	2	6	235537	235542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783980
5351	NC_013716	CCG	2	6	235570	235575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783980
5352	NC_013716	GCC	2	6	235842	235847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783980
5353	NC_013716	CATAA	2	10	236011	236020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5354	NC_013716	ATTA	2	8	236061	236068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_013716	A	6	6	236090	236095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_013716	T	7	7	236145	236151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_013716	CCT	2	6	236173	236178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5358	NC_013716	AT	3	6	236225	236230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_013716	CT	3	6	236236	236241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5360	NC_013716	T	8	8	236295	236302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_013716	TGAA	2	8	236326	236333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_013716	TAA	2	6	236366	236371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_013716	TGA	2	6	236388	236393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_013716	CTGT	2	8	236399	236406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5365	NC_013716	AAT	2	6	236427	236432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_013716	T	6	6	236502	236507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_013716	TTCTTA	2	12	236543	236554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5368	NC_013716	GAT	2	6	236660	236665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783981
5369	NC_013716	GCG	2	6	236717	236722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783981
5370	NC_013716	CGGG	2	8	236752	236759	0 %	0 %	75 %	25 %	283783981
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5487	NC_013716	T	6	6	242761	242766	0 %	100 %	0 %	0 %	283783983
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5494	NC_013716	TTC	2	6	243123	243128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783984
5495	NC_013716	TCG	2	6	243232	243237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783984
5496	NC_013716	CAGC	2	8	243257	243264	25 %	0 %	25 %	50 %	283783984
5497	NC_013716	TGC	2	6	243271	243276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783984
5498	NC_013716	GCTGGC	2	12	243282	243293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283783984
5499	NC_013716	ACCG	2	8	243432	243439	25 %	0 %	25 %	50 %	283783984
5500	NC_013716	GC	3	6	243480	243485	0 %	0 %	50 %	50 %	283783984

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