MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 119367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_013716	GAT	2	6	196045	196050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783945
4503	NC_013716	AGC	2	6	196109	196114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4504	NC_013716	ATC	2	6	196118	196123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783945
4505	NC_013716	CG	3	6	196199	196204	0 %	0 %	50 %	50 %	283783945
4506	NC_013716	AGA	2	6	196227	196232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783945
4507	NC_013716	TAAA	2	8	196265	196272	75 %	25 %	0 %	0 %	283783945
4508	NC_013716	GCC	2	6	196285	196290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783945
4509	NC_013716	GCT	2	6	196344	196349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4510	NC_013716	GCA	2	6	196358	196363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4511	NC_013716	AGC	2	6	196433	196438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4512	NC_013716	TTA	2	6	196471	196476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783945
4513	NC_013716	TTA	2	6	196492	196497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783945
4514	NC_013716	TGG	2	6	196526	196531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783945
4515	NC_013716	GTAA	2	8	196618	196625	50 %	25 %	25 %	0 %	283783945
4516	NC_013716	ATT	2	6	196664	196669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783945
4517	NC_013716	GATT	2	8	196679	196686	25 %	50 %	25 %	0 %	283783945
4518	NC_013716	TCG	2	6	196734	196739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783945
4519	NC_013716	AAGT	2	8	196761	196768	50 %	25 %	25 %	0 %	283783945
4520	NC_013716	A	7	7	196894	196900	100 %	0 %	0 %	0 %	283783946
4521	NC_013716	CCG	2	6	196964	196969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783946
4522	NC_013716	CGA	2	6	196985	196990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783946
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4524	NC_013716	GGT	2	6	197043	197048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783946
4525	NC_013716	CAG	2	6	197107	197112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783946
4526	NC_013716	TGA	2	6	197121	197126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783946
4527	NC_013716	AGG	2	6	197141	197146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783946
4528	NC_013716	GGC	2	6	197179	197184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4529	NC_013716	GCG	2	6	197189	197194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4530	NC_013716	ACA	2	6	197196	197201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783946
4531	NC_013716	CGC	2	6	197241	197246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783946
4532	NC_013716	CGT	2	6	197256	197261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783946
4533	NC_013716	GTG	2	6	197275	197280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783946
4534	NC_013716	TTCA	2	8	197551	197558	25 %	50 %	0 %	25 %	283783946
4535	NC_013716	CGC	2	6	197565	197570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783946
4536	NC_013716	CGG	2	6	197589	197594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4537	NC_013716	CGG	2	6	197655	197660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4538	NC_013716	CATCGG	2	12	197664	197675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283783946
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4540	NC_013716	GAACT	2	10	197770	197779	40 %	20 %	20 %	20 %	283783946
4541	NC_013716	GCGCG	2	10	197814	197823	0 %	0 %	60 %	40 %	283783946
4542	NC_013716	CGG	2	6	197852	197857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4543	NC_013716	CAG	2	6	197913	197918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783946
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4545	NC_013716	GCA	2	6	197960	197965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783946
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4547	NC_013716	CGGTGA	2	12	197999	198010	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283783946
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4551	NC_013716	GTG	3	9	198112	198120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783946
4552	NC_013716	CGG	2	6	198143	198148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783946
4553	NC_013716	GAA	2	6	198162	198167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783946
4554	NC_013716	CAG	2	6	198193	198198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783946
4555	NC_013716	CCGT	2	8	198244	198251	0 %	25 %	25 %	50 %	283783946
4556	NC_013716	CTG	2	6	198292	198297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783946
4557	NC_013716	CTT	2	6	198310	198315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_013716	CATA	2	8	198369	198376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_013716	TC	3	6	198378	198383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_013716	TGT	2	6	198404	198409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013716	AGG	2	6	198446	198451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013716	TGGC	3	12	198457	198468	0 %	25 %	50 %	25 %	283783947
4563	NC_013716	GC	3	6	198501	198506	0 %	0 %	50 %	50 %	283783947
4564	NC_013716	TAT	2	6	198557	198562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783947
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4609	NC_013716	A	7	7	200382	200388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013716	AAT	2	6	200436	200441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783950
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4619	NC_013716	CCA	2	6	200824	200829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783950
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4622	NC_013716	GGC	2	6	200922	200927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783950
4623	NC_013716	CTT	2	6	200941	200946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783950
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4635	NC_013716	CTG	2	6	201326	201331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783951
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4721	NC_013716	T	6	6	204986	204991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4722	NC_013716	A	6	6	205031	205036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4723	NC_013716	GTTCA	2	10	205068	205077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4724	NC_013716	CAA	2	6	205089	205094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4725	NC_013716	GC	3	6	205128	205133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4726	NC_013716	AC	4	8	205200	205207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4727	NC_013716	TA	3	6	205280	205285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4728	NC_013716	GC	3	6	205395	205400	0 %	0 %	50 %	50 %	283783953
4729	NC_013716	ATC	2	6	205415	205420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783953
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4731	NC_013716	GC	3	6	205516	205521	0 %	0 %	50 %	50 %	283783953
4732	NC_013716	AAGCG	2	10	205525	205534	40 %	0 %	40 %	20 %	283783953
4733	NC_013716	GCT	2	6	205544	205549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783953
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4735	NC_013716	GCTG	2	8	205581	205588	0 %	25 %	50 %	25 %	283783953
4736	NC_013716	AAGA	2	8	205688	205695	75 %	0 %	25 %	0 %	283783953
4737	NC_013716	AAG	2	6	205818	205823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783953
4738	NC_013716	AAC	2	6	205826	205831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783953
4739	NC_013716	ACG	3	9	205905	205913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783953
4740	NC_013716	GAA	2	6	205997	206002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783953
4741	NC_013716	GTA	2	6	206056	206061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_013716	ATG	2	6	206216	206221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783954
4743	NC_013716	A	6	6	206228	206233	100 %	0 %	0 %	0 %	283783954
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4745	NC_013716	GCG	2	6	206303	206308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783954
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4869	NC_013716	TGT	2	6	211839	211844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783959
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4989	NC_013716	TGG	2	6	218400	218405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783965
4990	NC_013716	CCG	2	6	218435	218440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783965
4991	NC_013716	CCACG	2	10	218461	218470	20 %	0 %	20 %	60 %	283783965
4992	NC_013716	GAA	2	6	218579	218584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783965
4993	NC_013716	AGC	2	6	218613	218618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783965
4994	NC_013716	GC	3	6	218770	218775	0 %	0 %	50 %	50 %	283783966
4995	NC_013716	TTG	2	6	218873	218878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783966
4996	NC_013716	CGT	2	6	218896	218901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4997	NC_013716	CTG	2	6	218902	218907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4998	NC_013716	CGC	2	6	218929	218934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783966
4999	NC_013716	CATT	2	8	219030	219037	25 %	50 %	0 %	25 %	283783966
5000	NC_013716	GTCC	2	8	219044	219051	0 %	25 %	25 %	50 %	283783966

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