MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 120005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013446	GCC	2	6	39818	39823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676166
1002	NC_013446	GC	3	6	39842	39847	0 %	0 %	50 %	50 %	264676166
1003	NC_013446	TGCTTG	2	12	39908	39919	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1004	NC_013446	ATGA	2	8	39934	39941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013446	TGC	2	6	39981	39986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013446	TTG	2	6	40003	40008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013446	GCG	2	6	40025	40030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013446	AGC	2	6	40053	40058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013446	GTC	2	6	40147	40152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676167
1010	NC_013446	GCA	2	6	40186	40191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676167
1011	NC_013446	GGC	2	6	40231	40236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676167
1012	NC_013446	GCT	2	6	40288	40293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676167
1013	NC_013446	CGG	2	6	40367	40372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676167
1014	NC_013446	AGCGC	2	10	40377	40386	20 %	0 %	40 %	40 %	264676167
1015	NC_013446	CGGTG	2	10	40425	40434	0 %	20 %	60 %	20 %	264676167
1016	NC_013446	GCA	2	6	40443	40448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676167
1017	NC_013446	GC	3	6	40477	40482	0 %	0 %	50 %	50 %	264676167
1018	NC_013446	CGGCG	2	10	40491	40500	0 %	0 %	60 %	40 %	264676167
1019	NC_013446	GAC	2	6	40516	40521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676167
1020	NC_013446	T	6	6	40539	40544	0 %	100 %	0 %	0 %	264676167
1021	NC_013446	GGT	2	6	40554	40559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676167
1022	NC_013446	A	6	6	40578	40583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013446	GGC	2	6	40673	40678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676168
1024	NC_013446	GGC	2	6	40724	40729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676168
1025	NC_013446	TTG	2	6	40829	40834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676168
1026	NC_013446	ATGG	2	8	40836	40843	25 %	25 %	50 %	0 %	264676168
1027	NC_013446	CAT	2	6	40905	40910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013446	ATG	2	6	41125	41130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676169
1029	NC_013446	TGGTG	2	10	41169	41178	0 %	40 %	60 %	0 %	264676169
1030	NC_013446	CTG	2	6	41194	41199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1031	NC_013446	G	6	6	41199	41204	0 %	0 %	100 %	0 %	264676169
1032	NC_013446	GACC	2	8	41433	41440	25 %	0 %	25 %	50 %	264676169
1033	NC_013446	CAT	2	6	41472	41477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676169
1034	NC_013446	GC	3	6	41518	41523	0 %	0 %	50 %	50 %	264676169
1035	NC_013446	CCA	2	6	41552	41557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676169
1036	NC_013446	GCT	2	6	41610	41615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1037	NC_013446	TGC	2	6	41633	41638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1038	NC_013446	GGC	2	6	41706	41711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676169
1039	NC_013446	TGG	3	9	41726	41734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676169
1040	NC_013446	CGG	2	6	41814	41819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676169
1041	NC_013446	GCA	2	6	41892	41897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1042	NC_013446	CAC	2	6	41907	41912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676169
1043	NC_013446	GCCA	2	8	41953	41960	25 %	0 %	25 %	50 %	264676169
1044	NC_013446	CGTCG	2	10	42030	42039	0 %	20 %	40 %	40 %	264676169
1045	NC_013446	GCA	2	6	42063	42068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1046	NC_013446	GA	3	6	42137	42142	50 %	0 %	50 %	0 %	264676169
1047	NC_013446	CAT	2	6	42204	42209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676169
1048	NC_013446	TGAT	2	8	42215	42222	25 %	50 %	25 %	0 %	264676169
1049	NC_013446	GTG	2	6	42307	42312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676169
1050	NC_013446	GCC	2	6	42352	42357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676169
1051	NC_013446	GC	4	8	42407	42414	0 %	0 %	50 %	50 %	264676169
1052	NC_013446	CAT	2	6	42477	42482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676169
1053	NC_013446	CGG	2	6	42494	42499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676169
1054	NC_013446	CAG	2	6	42568	42573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1055	NC_013446	TGG	2	6	42584	42589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676169
1056	NC_013446	GCC	3	9	42598	42606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676169
1057	NC_013446	GGC	2	6	42627	42632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676169
1058	NC_013446	GGCG	2	8	42666	42673	0 %	0 %	75 %	25 %	264676169
1059	NC_013446	ATGC	2	8	42679	42686	25 %	25 %	25 %	25 %	264676169
1060	NC_013446	CGG	2	6	42731	42736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676169
1061	NC_013446	GCT	2	6	42754	42759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676169
1062	NC_013446	A	6	6	42836	42841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013446	GCTTTT	2	12	42865	42876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_013446	CTGG	2	8	42936	42943	0 %	25 %	50 %	25 %	264676170
1065	NC_013446	TCG	2	6	43021	43026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676170
1066	NC_013446	GC	4	8	43105	43112	0 %	0 %	50 %	50 %	264676170
1067	NC_013446	GTT	2	6	43134	43139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676170
1068	NC_013446	GCC	2	6	43158	43163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676170
1069	NC_013446	CG	3	6	43220	43225	0 %	0 %	50 %	50 %	264676170
1070	NC_013446	TGGC	2	8	43334	43341	0 %	25 %	50 %	25 %	264676170
1071	NC_013446	GA	3	6	43349	43354	50 %	0 %	50 %	0 %	264676170
1072	NC_013446	TGC	2	6	43436	43441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676170
1073	NC_013446	GTC	2	6	43449	43454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676170
1074	NC_013446	TGGT	2	8	43462	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	264676170
1075	NC_013446	TGCA	2	8	43509	43516	25 %	25 %	25 %	25 %	264676170
1076	NC_013446	AGCC	2	8	43532	43539	25 %	0 %	25 %	50 %	264676170
1077	NC_013446	CG	4	8	43553	43560	0 %	0 %	50 %	50 %	264676170
1078	NC_013446	CTG	2	6	43596	43601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676170
1079	NC_013446	GC	3	6	43609	43614	0 %	0 %	50 %	50 %	264676170
1080	NC_013446	T	6	6	43806	43811	0 %	100 %	0 %	0 %	264676170
1081	NC_013446	TGG	2	6	43870	43875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676170
1082	NC_013446	CAG	2	6	43899	43904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676170
1083	NC_013446	GC	3	6	43915	43920	0 %	0 %	50 %	50 %	264676170
1084	NC_013446	GTA	2	6	43926	43931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676170
1085	NC_013446	GCG	2	6	43943	43948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676170
1086	NC_013446	CTGC	2	8	44017	44024	0 %	25 %	25 %	50 %	264676170
1087	NC_013446	A	6	6	44067	44072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013446	ACTT	2	8	44117	44124	25 %	50 %	0 %	25 %	264676171
1089	NC_013446	GC	3	6	44164	44169	0 %	0 %	50 %	50 %	264676171
1090	NC_013446	TTG	2	6	44300	44305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676171
1091	NC_013446	GCT	2	6	44310	44315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676171
1092	NC_013446	AGC	2	6	44351	44356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676171
1093	NC_013446	TGA	2	6	44424	44429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676171
1094	NC_013446	GGT	2	6	44448	44453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676171
1095	NC_013446	GTA	2	6	44596	44601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676171
1096	NC_013446	TCCGT	2	10	44603	44612	0 %	40 %	20 %	40 %	264676171
1097	NC_013446	GCA	2	6	44673	44678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676171
1098	NC_013446	GTA	2	6	44713	44718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676171
1099	NC_013446	CT	3	6	44737	44742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_013446	ATGC	2	8	44789	44796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_013446	GGAGA	2	10	44819	44828	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013446	CTG	2	6	44863	44868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1103	NC_013446	GCA	2	6	44904	44909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1104	NC_013446	AGC	2	6	44990	44995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1105	NC_013446	GCC	2	6	45022	45027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676172
1106	NC_013446	CGA	2	6	45057	45062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1107	NC_013446	TTG	2	6	45065	45070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676172
1108	NC_013446	GCAGG	2	10	45147	45156	20 %	0 %	60 %	20 %	264676172
1109	NC_013446	CAG	2	6	45298	45303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1110	NC_013446	TTG	2	6	45319	45324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676172
1111	NC_013446	TGC	2	6	45381	45386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1112	NC_013446	TGCA	2	8	45404	45411	25 %	25 %	25 %	25 %	264676172
1113	NC_013446	GCA	2	6	45418	45423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1114	NC_013446	GCC	2	6	45489	45494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_013446	C	6	6	45510	45515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1116	NC_013446	TGC	2	6	45527	45532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_013446	TGG	2	6	45538	45543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013446	TGT	2	6	45663	45668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676173
1119	NC_013446	GGC	2	6	45701	45706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1120	NC_013446	GC	3	6	45737	45742	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1121	NC_013446	GCA	2	6	45747	45752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1122	NC_013446	TGC	2	6	45759	45764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1123	NC_013446	CGG	2	6	45814	45819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1124	NC_013446	AGG	2	6	45843	45848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676173
1125	NC_013446	GCG	2	6	45861	45866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1126	NC_013446	GACA	2	8	45880	45887	50 %	0 %	25 %	25 %	264676173
1127	NC_013446	GGC	2	6	45890	45895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1128	NC_013446	CGTG	2	8	45934	45941	0 %	25 %	50 %	25 %	264676173
1129	NC_013446	CG	3	6	45945	45950	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1130	NC_013446	CAG	2	6	46025	46030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
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1132	NC_013446	TGG	2	6	46047	46052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676173
1133	NC_013446	GTG	2	6	46112	46117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676173
1134	NC_013446	CGG	2	6	46122	46127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
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1136	NC_013446	C	7	7	46265	46271	0 %	0 %	0 %	100 %	264676173
1137	NC_013446	GCA	2	6	46284	46289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
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1143	NC_013446	CCA	2	6	46623	46628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676173
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1145	NC_013446	GGC	2	6	46822	46827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
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1151	NC_013446	CG	3	6	47145	47150	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1152	NC_013446	CTG	2	6	47219	47224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
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1159	NC_013446	GGC	2	6	47579	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
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1161	NC_013446	GATC	2	8	47694	47701	25 %	25 %	25 %	25 %	264676174
1162	NC_013446	CTG	2	6	47722	47727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
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1166	NC_013446	CGG	2	6	47892	47897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676174
1167	NC_013446	GGTGT	2	10	47908	47917	0 %	40 %	60 %	0 %	264676174
1168	NC_013446	CTG	2	6	47925	47930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
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1181	NC_013446	GCC	2	6	48627	48632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676175
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1184	NC_013446	GGC	2	6	48668	48673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676175
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1215	NC_013446	TGG	2	6	50105	50110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
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1219	NC_013446	TGG	2	6	50165	50170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
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1222	NC_013446	GC	5	10	50296	50305	0 %	0 %	50 %	50 %	264676177
1223	NC_013446	GGACTG	2	12	50377	50388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	264676177
1224	NC_013446	GCT	3	9	50406	50414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676177
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1227	NC_013446	AGCAG	2	10	50508	50517	40 %	0 %	40 %	20 %	264676178
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1229	NC_013446	AGC	2	6	50551	50556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
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1231	NC_013446	CAT	2	6	50655	50660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676178
1232	NC_013446	GCG	2	6	50730	50735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676178
1233	NC_013446	CGA	2	6	50796	50801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
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1236	NC_013446	CTG	2	6	50968	50973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1237	NC_013446	GCT	2	6	51039	51044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1238	NC_013446	CGGC	2	8	51071	51078	0 %	0 %	50 %	50 %	264676178
1239	NC_013446	AAG	2	6	51094	51099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676178
1240	NC_013446	AAG	2	6	51172	51177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676178
1241	NC_013446	CG	3	6	51188	51193	0 %	0 %	50 %	50 %	264676178
1242	NC_013446	AAG	2	6	51256	51261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676178
1243	NC_013446	AGC	2	6	51281	51286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1244	NC_013446	GGA	2	6	51324	51329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676178
1245	NC_013446	CAT	2	6	51339	51344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676178
1246	NC_013446	T	7	7	51413	51419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_013446	GC	4	8	51422	51429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1248	NC_013446	GCA	2	6	51473	51478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676179
1249	NC_013446	GCC	2	6	51498	51503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676179
1250	NC_013446	GCC	2	6	51507	51512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676179
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1252	NC_013446	GCC	2	6	51579	51584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676179
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