MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 115348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013315	AAG	2	6	156691	156696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681892
4002	NC_013315	TAA	2	6	156718	156723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681892
4003	NC_013315	GAA	2	6	156753	156758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681892
4004	NC_013315	AT	3	6	156767	156772	50 %	50 %	0 %	0 %	260681892
4005	NC_013315	TCT	2	6	156789	156794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681892
4006	NC_013315	TAAT	2	8	156814	156821	50 %	50 %	0 %	0 %	260681892
4007	NC_013315	TTA	2	6	156832	156837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681892
4008	NC_013315	TAC	2	6	156842	156847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681892
4009	NC_013315	TGA	2	6	156851	156856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681892
4010	NC_013315	AAG	2	6	156883	156888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681892
4011	NC_013315	TTG	2	6	156940	156945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681892
4012	NC_013315	TA	3	6	156991	156996	50 %	50 %	0 %	0 %	260681892
4013	NC_013315	GA	3	6	156998	157003	50 %	0 %	50 %	0 %	260681892
4014	NC_013315	AT	3	6	157028	157033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013315	AGG	2	6	157044	157049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013315	TG	3	6	157111	157116	0 %	50 %	50 %	0 %	260681893
4017	NC_013315	TAA	2	6	157159	157164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681893
4018	NC_013315	A	6	6	157167	157172	100 %	0 %	0 %	0 %	260681893
4019	NC_013315	TTAAT	2	10	157271	157280	40 %	60 %	0 %	0 %	260681893
4020	NC_013315	AGC	2	6	157344	157349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681894
4021	NC_013315	TTC	2	6	157372	157377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681894
4022	NC_013315	AG	3	6	157423	157428	50 %	0 %	50 %	0 %	260681894
4023	NC_013315	CGTT	2	8	157448	157455	0 %	50 %	25 %	25 %	260681894
4024	NC_013315	TGG	2	6	157494	157499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681894
4025	NC_013315	CTT	2	6	157526	157531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681894
4026	NC_013315	AAG	2	6	157559	157564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4027	NC_013315	TGT	2	6	157599	157604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681894
4028	NC_013315	TAATG	2	10	157608	157617	40 %	40 %	20 %	0 %	260681894
4029	NC_013315	GGT	2	6	157621	157626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681894
4030	NC_013315	ACT	2	6	157661	157666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681894
4031	NC_013315	GGA	2	6	157684	157689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681894
4032	NC_013315	AAG	2	6	157733	157738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4033	NC_013315	TGATA	2	10	157743	157752	40 %	40 %	20 %	0 %	260681894
4034	NC_013315	ATT	2	6	157775	157780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681894
4035	NC_013315	ATG	2	6	157825	157830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681894
4036	NC_013315	GAA	2	6	157857	157862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4037	NC_013315	CCT	2	6	157873	157878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260681894
4038	NC_013315	TAA	2	6	157925	157930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681894
4039	NC_013315	CT	3	6	157932	157937	0 %	50 %	0 %	50 %	260681894
4040	NC_013315	AGA	2	6	157959	157964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4041	NC_013315	TTG	2	6	157968	157973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681894
4042	NC_013315	AGA	2	6	158037	158042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4043	NC_013315	ACT	2	6	158071	158076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681894
4044	NC_013315	AGT	2	6	158082	158087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681894
4045	NC_013315	AT	3	6	158102	158107	50 %	50 %	0 %	0 %	260681894
4046	NC_013315	AGA	2	6	158112	158117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681894
4047	NC_013315	TAT	2	6	158150	158155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681894
4048	NC_013315	CCATTC	2	12	158158	158169	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260681894
4049	NC_013315	TGG	2	6	158234	158239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681894
4050	NC_013315	AGG	2	6	158295	158300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681894
4051	NC_013315	CAG	2	6	158315	158320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681894
4052	NC_013315	A	7	7	158338	158344	100 %	0 %	0 %	0 %	260681894
4053	NC_013315	AGG	2	6	158367	158372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681894
4054	NC_013315	TGT	2	6	158387	158392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681895
4055	NC_013315	ACT	2	6	158431	158436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681895
4056	NC_013315	AGA	2	6	158486	158491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681895
4057	NC_013315	GTT	2	6	158520	158525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681895
4058	NC_013315	AAG	2	6	158575	158580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681895
4059	NC_013315	GCT	3	9	158601	158609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681895
4060	NC_013315	CTG	2	6	158686	158691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681895
4061	NC_013315	GCT	2	6	158706	158711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681895
4062	NC_013315	A	6	6	158719	158724	100 %	0 %	0 %	0 %	260681895
4063	NC_013315	ACT	2	6	158727	158732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681895
4064	NC_013315	TGG	2	6	158765	158770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681895
4065	NC_013315	CTA	2	6	158806	158811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681895
4066	NC_013315	GAA	2	6	158824	158829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681895
4067	NC_013315	A	6	6	158943	158948	100 %	0 %	0 %	0 %	260681895
4068	NC_013315	AAAG	2	8	158954	158961	75 %	0 %	25 %	0 %	260681895
4069	NC_013315	CAA	2	6	158973	158978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681895
4070	NC_013315	AGGATT	2	12	158981	158992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681895
4071	NC_013315	TAG	2	6	158998	159003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681895
4072	NC_013315	TAT	2	6	159007	159012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681895
4073	NC_013315	ACA	2	6	159070	159075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681895
4074	NC_013315	GAG	2	6	159120	159125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681895
4075	NC_013315	TTAC	2	8	159198	159205	25 %	50 %	0 %	25 %	260681896
4076	NC_013315	AAG	2	6	159229	159234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681896
4077	NC_013315	GAT	2	6	159333	159338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681896
4078	NC_013315	TAT	2	6	159352	159357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681896
4079	NC_013315	GAT	2	6	159387	159392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681896
4080	NC_013315	TGG	2	6	159401	159406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681896
4081	NC_013315	ATA	2	6	159411	159416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681896
4082	NC_013315	TAA	2	6	159430	159435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681896
4083	NC_013315	AGATGT	2	12	159455	159466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681896
4084	NC_013315	TTA	2	6	159467	159472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681896
4085	NC_013315	TA	3	6	159471	159476	50 %	50 %	0 %	0 %	260681896
4086	NC_013315	AGC	2	6	159491	159496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681896
4087	NC_013315	CTTA	2	8	159541	159548	25 %	50 %	0 %	25 %	260681896
4088	NC_013315	A	6	6	159594	159599	100 %	0 %	0 %	0 %	260681896
4089	NC_013315	AGAAA	2	10	159612	159621	80 %	0 %	20 %	0 %	260681896
4090	NC_013315	AACT	2	8	159683	159690	50 %	25 %	0 %	25 %	260681896
4091	NC_013315	A	8	8	159709	159716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013315	ATT	2	6	159726	159731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013315	T	6	6	159741	159746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013315	ATA	2	6	159817	159822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4095	NC_013315	TGG	2	6	159948	159953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681897
4096	NC_013315	AGT	3	9	159987	159995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681897
4097	NC_013315	GATGT	2	10	160064	160073	20 %	40 %	40 %	0 %	260681897
4098	NC_013315	AAT	2	6	160086	160091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4099	NC_013315	TGTGG	2	10	160138	160147	0 %	40 %	60 %	0 %	260681897
4100	NC_013315	TAA	2	6	160197	160202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4101	NC_013315	GAT	2	6	160219	160224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681897
4102	NC_013315	ATTGA	2	10	160228	160237	40 %	40 %	20 %	0 %	260681897
4103	NC_013315	AGA	2	6	160242	160247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681897
4104	NC_013315	AT	3	6	160248	160253	50 %	50 %	0 %	0 %	260681897
4105	NC_013315	ATTG	2	8	160270	160277	25 %	50 %	25 %	0 %	260681897
4106	NC_013315	GAA	2	6	160301	160306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681897
4107	NC_013315	AAT	2	6	160356	160361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4108	NC_013315	AGT	2	6	160386	160391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681897
4109	NC_013315	TGA	2	6	160440	160445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681897
4110	NC_013315	AATA	2	8	160467	160474	75 %	25 %	0 %	0 %	260681897
4111	NC_013315	ATA	2	6	160490	160495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4112	NC_013315	AAC	2	6	160526	160531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681897
4113	NC_013315	ATG	2	6	160577	160582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681897
4114	NC_013315	TTG	2	6	160625	160630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681897
4115	NC_013315	ATA	2	6	160676	160681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
4116	NC_013315	GCT	2	6	160738	160743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681897
4117	NC_013315	CTA	2	6	160766	160771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681897
4118	NC_013315	CAG	2	6	160772	160777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681897
4119	NC_013315	AGA	2	6	160797	160802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681897
4120	NC_013315	TGG	2	6	160827	160832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681897
4121	NC_013315	ACA	2	6	160865	160870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681897
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4123	NC_013315	AAT	2	6	160953	160958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681897
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