MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 115348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_013315	GTT	2	6	59679	59684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681806
1503	NC_013315	GGT	2	6	59694	59699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681806
1504	NC_013315	CAG	2	6	59713	59718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681806
1505	NC_013315	AGT	2	6	59771	59776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681806
1506	NC_013315	CAG	2	6	59791	59796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681806
1507	NC_013315	TTG	2	6	59808	59813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681806
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1509	NC_013315	ATA	2	6	59830	59835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681806
1510	NC_013315	TTG	2	6	59848	59853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681806
1511	NC_013315	A	7	7	59873	59879	100 %	0 %	0 %	0 %	260681806
1512	NC_013315	AGA	2	6	59891	59896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681806
1513	NC_013315	AG	3	6	59934	59939	50 %	0 %	50 %	0 %	260681806
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1515	NC_013315	GAA	2	6	59988	59993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681806
1516	NC_013315	GCA	2	6	59994	59999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681806
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1518	NC_013315	AGC	2	6	60122	60127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681806
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1521	NC_013315	TGA	2	6	60278	60283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681806
1522	NC_013315	AGA	2	6	60287	60292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681806
1523	NC_013315	AGG	2	6	60320	60325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681806
1524	NC_013315	GATA	2	8	60326	60333	50 %	25 %	25 %	0 %	260681807
1525	NC_013315	TGG	2	6	60334	60339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681807
1526	NC_013315	AAATA	2	10	60341	60350	80 %	20 %	0 %	0 %	260681807
1527	NC_013315	CAG	2	6	60361	60366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681807
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1530	NC_013315	ATA	2	6	60469	60474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681807
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1533	NC_013315	AGA	2	6	60509	60514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681807
1534	NC_013315	ATA	2	6	60616	60621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681807
1535	NC_013315	A	6	6	60639	60644	100 %	0 %	0 %	0 %	260681807
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1539	NC_013315	A	6	6	61019	61024	100 %	0 %	0 %	0 %	260681807
1540	NC_013315	CAAA	2	8	61027	61034	75 %	0 %	0 %	25 %	260681807
1541	NC_013315	AAAG	2	8	61056	61063	75 %	0 %	25 %	0 %	260681807
1542	NC_013315	CAG	2	6	61105	61110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681807
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1545	NC_013315	TAAAA	2	10	61253	61262	80 %	20 %	0 %	0 %	260681807
1546	NC_013315	ATTAT	2	10	61419	61428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013315	TA	3	6	61458	61463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013315	ATT	2	6	61470	61475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013315	TTAA	2	8	61508	61515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013315	AT	3	6	61517	61522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013315	AGG	2	6	61533	61538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013315	TAA	2	6	61559	61564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681808
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1558	NC_013315	CATA	2	8	61722	61729	50 %	25 %	0 %	25 %	260681808
1559	NC_013315	AGA	2	6	61839	61844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681808
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1561	NC_013315	A	6	6	61883	61888	100 %	0 %	0 %	0 %	260681808
1562	NC_013315	A	6	6	61894	61899	100 %	0 %	0 %	0 %	260681808
1563	NC_013315	ATG	2	6	61916	61921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681808
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1569	NC_013315	CAG	2	6	62069	62074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681808
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1572	NC_013315	AAG	2	6	62146	62151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681808
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1595	NC_013315	GCA	2	6	63139	63144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681808
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1597	NC_013315	A	6	6	63268	63273	100 %	0 %	0 %	0 %	260681808
1598	NC_013315	ATT	2	6	63289	63294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013315	TAT	2	6	63305	63310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_013315	TTA	2	6	63362	63367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013315	ATTT	2	8	63376	63383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013315	TAA	2	6	63387	63392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013315	T	6	6	63399	63404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013315	TGT	2	6	63441	63446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013315	A	6	6	63449	63454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013315	T	7	7	63517	63523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013315	A	7	7	63530	63536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013315	TAT	2	6	63538	63543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013315	A	9	9	63555	63563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013315	TTA	2	6	63604	63609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013315	A	7	7	63616	63622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013315	TAA	2	6	63623	63628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013315	A	8	8	63633	63640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013315	AT	3	6	63643	63648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013315	TA	3	6	63663	63668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013315	AAT	2	6	63669	63674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_013315	TAAA	2	8	63896	63903	75 %	25 %	0 %	0 %	260681809
1628	NC_013315	AAG	2	6	63915	63920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681809
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