MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 115348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_013315	AGA	2	6	226020	226025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681950
6003	NC_013315	A	6	6	226032	226037	100 %	0 %	0 %	0 %	260681950
6004	NC_013315	AAT	2	6	226039	226044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681950
6005	NC_013315	TAT	2	6	226058	226063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681950
6006	NC_013315	AAG	2	6	226085	226090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681950
6007	NC_013315	TTA	2	6	226091	226096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681950
6008	NC_013315	TTTAGA	2	12	226143	226154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260681950
6009	NC_013315	TTTA	2	8	226200	226207	25 %	75 %	0 %	0 %	260681950
6010	NC_013315	AAG	2	6	226226	226231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681950
6011	NC_013315	TAA	2	6	226255	226260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013315	AGA	2	6	226291	226296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_013315	AAT	2	6	226345	226350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_013315	GGA	2	6	226389	226394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681951
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6016	NC_013315	GCA	2	6	226468	226473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681951
6017	NC_013315	TGTA	2	8	226515	226522	25 %	50 %	25 %	0 %	260681951
6018	NC_013315	ATG	2	6	226532	226537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681951
6019	NC_013315	TAC	2	6	226595	226600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681951
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6021	NC_013315	TTA	2	6	226717	226722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681951
6022	NC_013315	GAA	2	6	226735	226740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681951
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6024	NC_013315	AT	3	6	226839	226844	50 %	50 %	0 %	0 %	260681951
6025	NC_013315	GAA	2	6	226852	226857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681951
6026	NC_013315	GAAA	2	8	226859	226866	75 %	0 %	25 %	0 %	260681951
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6029	NC_013315	ATA	2	6	226991	226996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_013315	AT	3	6	226999	227004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_013315	ATA	2	6	227007	227012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_013315	CATA	2	8	227023	227030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_013315	AAAAT	2	10	227058	227067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_013315	ATT	3	9	227089	227097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681952
6035	NC_013315	CGT	2	6	227176	227181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681952
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6038	NC_013315	ATT	2	6	227316	227321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013315	AATTA	2	10	227331	227340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013315	ACA	2	6	227346	227351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_013315	TAT	2	6	227359	227364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_013315	TATT	2	8	227415	227422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013315	AAG	2	6	227426	227431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_013315	AAAAT	2	10	227441	227450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6046	NC_013315	TATTT	2	10	227508	227517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_013315	TTA	2	6	227524	227529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6049	NC_013315	TAT	2	6	227574	227579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681953
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6055	NC_013315	A	6	6	227695	227700	100 %	0 %	0 %	0 %	260681953
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6059	NC_013315	TAC	2	6	227880	227885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681953
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6098	NC_013315	TGA	2	6	229168	229173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681954
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6111	NC_013315	GAT	2	6	229847	229852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681954
6112	NC_013315	A	6	6	229859	229864	100 %	0 %	0 %	0 %	260681954
6113	NC_013315	GA	3	6	229952	229957	50 %	0 %	50 %	0 %	260681954
6114	NC_013315	GATA	2	8	229972	229979	50 %	25 %	25 %	0 %	260681954
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6500	NC_013315	A	6	6	243971	243976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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