MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 115348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_013315	TAT	2	6	2284495	2284500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683715
64003	NC_013315	GTTTT	2	10	2284520	2284529	0 %	80 %	20 %	0 %	260683715
64004	NC_013315	T	6	6	2284533	2284538	0 %	100 %	0 %	0 %	260683715
64005	NC_013315	CAT	2	6	2284678	2284683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683715
64006	NC_013315	CAA	2	6	2284705	2284710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260683715
64007	NC_013315	CTT	2	6	2284738	2284743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64008	NC_013315	TCT	2	6	2284752	2284757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64009	NC_013315	T	6	6	2284880	2284885	0 %	100 %	0 %	0 %	260683715
64010	NC_013315	ACT	2	6	2284886	2284891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683715
64011	NC_013315	TAT	2	6	2284916	2284921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683715
64012	NC_013315	TA	3	6	2284946	2284951	50 %	50 %	0 %	0 %	260683715
64013	NC_013315	TCT	2	6	2284992	2284997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64014	NC_013315	TAT	2	6	2285014	2285019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683715
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64016	NC_013315	TCA	2	6	2285058	2285063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683715
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64018	NC_013315	TCT	2	6	2285136	2285141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64019	NC_013315	TTC	2	6	2285216	2285221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64020	NC_013315	ATT	3	9	2285228	2285236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683715
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64035	NC_013315	TTTTGA	2	12	2285933	2285944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	260683715
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64039	NC_013315	TA	3	6	2286055	2286060	50 %	50 %	0 %	0 %	260683715
64040	NC_013315	TA	3	6	2286064	2286069	50 %	50 %	0 %	0 %	260683715
64041	NC_013315	A	6	6	2286124	2286129	100 %	0 %	0 %	0 %	260683715
64042	NC_013315	TA	3	6	2286146	2286151	50 %	50 %	0 %	0 %	260683715
64043	NC_013315	TAT	2	6	2286269	2286274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683715
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64045	NC_013315	TCTT	2	8	2286356	2286363	0 %	75 %	0 %	25 %	260683715
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64050	NC_013315	T	7	7	2286604	2286610	0 %	100 %	0 %	0 %	260683715
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64053	NC_013315	TCCA	2	8	2286743	2286750	25 %	25 %	0 %	50 %	260683715
64054	NC_013315	TCT	2	6	2286751	2286756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683715
64055	NC_013315	ATA	2	6	2286840	2286845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260683715
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64057	NC_013315	AT	3	6	2286864	2286869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64058	NC_013315	TAT	2	6	2286942	2286947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64060	NC_013315	AATA	2	8	2286982	2286989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64061	NC_013315	TATT	2	8	2287003	2287010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64062	NC_013315	TA	4	8	2287046	2287053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64063	NC_013315	TATT	2	8	2287101	2287108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64064	NC_013315	TATTT	2	10	2287117	2287126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64073	NC_013315	TAAT	2	8	2287349	2287356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64074	NC_013315	T	7	7	2287389	2287395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64090	NC_013315	TTA	2	6	2287732	2287737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64095	NC_013315	AT	3	6	2287850	2287855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64098	NC_013315	TAAT	2	8	2287887	2287894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64099	NC_013315	CAA	2	6	2287917	2287922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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64109	NC_013315	AG	3	6	2288334	2288339	50 %	0 %	50 %	0 %	260683716
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64121	NC_013315	AT	3	6	2288772	2288777	50 %	50 %	0 %	0 %	260683716
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64123	NC_013315	CTT	2	6	2288860	2288865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260683716
64124	NC_013315	TAC	2	6	2288983	2288988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683716
64125	NC_013315	TAC	2	6	2289033	2289038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683716
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64141	NC_013315	TAT	2	6	2289836	2289841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683717
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64203	NC_013315	T	7	7	2291450	2291456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64490	NC_013315	TAT	2	6	2300672	2300677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64492	NC_013315	GTA	2	6	2300720	2300725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64493	NC_013315	T	6	6	2300737	2300742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64494	NC_013315	AAT	2	6	2300757	2300762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64495	NC_013315	TAT	2	6	2300772	2300777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64497	NC_013315	ATATGG	2	12	2300794	2300805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64499	NC_013315	TA	3	6	2300923	2300928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64500	NC_013315	T	6	6	2300958	2300963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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