MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 115348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5503	NC_013315	GAT	2	6	209617	209622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681937
5504	NC_013315	A	6	6	209643	209648	100 %	0 %	0 %	0 %	260681937
5505	NC_013315	AT	3	6	209677	209682	50 %	50 %	0 %	0 %	260681937
5506	NC_013315	GAAA	2	8	209700	209707	75 %	0 %	25 %	0 %	260681937
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5510	NC_013315	AAT	2	6	209826	209831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681937
5511	NC_013315	ATT	2	6	209853	209858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681937
5512	NC_013315	GA	3	6	209859	209864	50 %	0 %	50 %	0 %	260681937
5513	NC_013315	GTT	2	6	209876	209881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681937
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5515	NC_013315	TATTC	2	10	209920	209929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5519	NC_013315	TCA	2	6	210002	210007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5521	NC_013315	ATTTT	2	10	210030	210039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013315	ATTTT	2	10	210055	210064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_013315	ATTTA	2	10	210069	210078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013315	TAT	2	6	210092	210097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013315	ATA	2	6	210100	210105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_013315	TTATA	2	10	210114	210123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013315	TTAA	2	8	210124	210131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5530	NC_013315	ATTT	2	8	210250	210257	25 %	75 %	0 %	0 %	260681938
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5560	NC_013315	A	6	6	211322	211327	100 %	0 %	0 %	0 %	260681938
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5613	NC_013315	CAT	2	6	213036	213041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681939
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5621	NC_013315	GAAAG	2	10	213400	213409	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_013315	TA	3	6	213432	213437	50 %	50 %	0 %	0 %	260681940
5623	NC_013315	T	7	7	213453	213459	0 %	100 %	0 %	0 %	260681940
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