MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	ACCAG	2	10	460	469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013193	TGGTA	2	10	1412	1421	20 %	40 %	40 %	0 %	257091507
3	NC_013193	CGGGA	2	10	1545	1554	20 %	0 %	60 %	20 %	257091508
4	NC_013193	GCCCG	2	10	2666	2675	0 %	0 %	40 %	60 %	257091509
5	NC_013193	CCCTG	2	10	3025	3034	0 %	20 %	20 %	60 %	257091510
6	NC_013193	GCTCG	2	10	3697	3706	0 %	20 %	40 %	40 %	257091511
7	NC_013193	CGCGG	2	10	4249	4258	0 %	0 %	60 %	40 %	257091511
8	NC_013193	GCGAG	2	10	7865	7874	20 %	0 %	60 %	20 %	257091512
9	NC_013193	CGATG	2	10	8753	8762	20 %	20 %	40 %	20 %	257091513
10	NC_013193	CGGGC	2	10	9205	9214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013193	TCCCC	2	10	9468	9477	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_013193	CAGGC	2	10	9578	9587	20 %	0 %	40 %	40 %	257091515
13	NC_013193	GAACG	2	10	11718	11727	40 %	0 %	40 %	20 %	257091517
14	NC_013193	AGTCC	2	10	14587	14596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013193	CGTGT	2	10	14836	14845	0 %	40 %	40 %	20 %	257091524
16	NC_013193	GCGAC	2	10	16553	16562	20 %	0 %	40 %	40 %	257091524
17	NC_013193	TGATC	2	10	16609	16618	20 %	40 %	20 %	20 %	257091524
18	NC_013193	TTCCA	2	10	18216	18225	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013193	ACCAG	2	10	20477	20486	40 %	0 %	20 %	40 %	257091528
20	NC_013193	TGCGC	2	10	21219	21228	0 %	20 %	40 %	40 %	257091528
21	NC_013193	CTCTT	2	10	21668	21677	0 %	60 %	0 %	40 %	257091528
22	NC_013193	GTCTT	2	10	21797	21806	0 %	60 %	20 %	20 %	257091528
23	NC_013193	TTTGC	2	10	22222	22231	0 %	60 %	20 %	20 %	257091528
24	NC_013193	GCAGT	2	10	24017	24026	20 %	20 %	40 %	20 %	257091529
25	NC_013193	GGCCT	2	10	24940	24949	0 %	20 %	40 %	40 %	257091529
26	NC_013193	AGCGC	2	10	27081	27090	20 %	0 %	40 %	40 %	257091531
27	NC_013193	GTCGA	2	10	28538	28547	20 %	20 %	40 %	20 %	257091532
28	NC_013193	ACGCA	2	10	30527	30536	40 %	0 %	20 %	40 %	257091532
29	NC_013193	ACCTC	2	10	31084	31093	20 %	20 %	0 %	60 %	257091533
30	NC_013193	GGTGT	2	10	31536	31545	0 %	40 %	60 %	0 %	257091533
31	NC_013193	CGCAC	2	10	32557	32566	20 %	0 %	20 %	60 %	257091534
32	NC_013193	GACGT	2	10	33188	33197	20 %	20 %	40 %	20 %	257091534
33	NC_013193	ACCTC	2	10	33216	33225	20 %	20 %	0 %	60 %	257091534
34	NC_013193	CGCGA	2	10	35218	35227	20 %	0 %	40 %	40 %	257091535
35	NC_013193	TCGGC	2	10	36243	36252	0 %	20 %	40 %	40 %	257091535
36	NC_013193	GCCCG	2	10	37609	37618	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013193	TGAAG	2	10	38399	38408	40 %	20 %	40 %	0 %	257091537
38	NC_013193	CTGCC	2	10	42763	42772	0 %	20 %	20 %	60 %	257091543
39	NC_013193	AGACG	2	10	43680	43689	40 %	0 %	40 %	20 %	257091544
40	NC_013193	GCCCT	2	10	44398	44407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013193	CATTC	2	10	45208	45217	20 %	40 %	0 %	40 %	257091546
42	NC_013193	GATCA	2	10	47411	47420	40 %	20 %	20 %	20 %	257091547
43	NC_013193	GTCTT	2	10	49512	49521	0 %	60 %	20 %	20 %	257091549
44	NC_013193	GCAAC	2	10	49739	49748	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013193	AGGGC	2	10	50539	50548	20 %	0 %	60 %	20 %	257091551
46	NC_013193	GCAAC	2	10	51393	51402	40 %	0 %	20 %	40 %	257091552
47	NC_013193	CCGAT	2	10	51536	51545	20 %	20 %	20 %	40 %	257091552
48	NC_013193	CGTGA	2	10	51574	51583	20 %	20 %	40 %	20 %	257091552
49	NC_013193	GCAGG	2	10	52991	53000	20 %	0 %	60 %	20 %	257091553
50	NC_013193	CAAGC	2	10	55205	55214	40 %	0 %	20 %	40 %	257091556
51	NC_013193	AGTCA	2	10	56297	56306	40 %	20 %	20 %	20 %	257091557
52	NC_013193	AGGCG	2	10	56714	56723	20 %	0 %	60 %	20 %	257091557
53	NC_013193	AGGAG	2	10	56800	56809	40 %	0 %	60 %	0 %	257091557
54	NC_013193	ATGAC	2	10	56826	56835	40 %	20 %	20 %	20 %	257091557
55	NC_013193	TTCCA	2	10	60256	60265	20 %	40 %	0 %	40 %	257091560
56	NC_013193	CTTCG	2	10	60383	60392	0 %	40 %	20 %	40 %	257091560
57	NC_013193	CACTG	2	10	62690	62699	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_013193	TGGGC	2	10	63982	63991	0 %	20 %	60 %	20 %	257091563
59	NC_013193	CACAG	2	10	64642	64651	40 %	0 %	20 %	40 %	257091564
60	NC_013193	GAACG	2	10	65513	65522	40 %	0 %	40 %	20 %	257091565
61	NC_013193	TGCGA	2	10	65563	65572	20 %	20 %	40 %	20 %	257091565
62	NC_013193	AGCGA	2	10	68180	68189	40 %	0 %	40 %	20 %	257091566
63	NC_013193	CTGTA	2	10	68732	68741	20 %	40 %	20 %	20 %	257091567
64	NC_013193	CCAGG	2	10	71098	71107	20 %	0 %	40 %	40 %	257091569
65	NC_013193	CAGCG	2	10	72353	72362	20 %	0 %	40 %	40 %	257091570
66	NC_013193	CCTTG	2	10	73229	73238	0 %	40 %	20 %	40 %	257091571
67	NC_013193	CTTTC	2	10	73327	73336	0 %	60 %	0 %	40 %	257091572
68	NC_013193	ACCCG	2	10	74784	74793	20 %	0 %	20 %	60 %	257091574
69	NC_013193	TGGTC	2	10	75067	75076	0 %	40 %	40 %	20 %	257091574
70	NC_013193	AGGGC	2	10	75661	75670	20 %	0 %	60 %	20 %	257091574
71	NC_013193	GAAGT	2	10	76209	76218	40 %	20 %	40 %	0 %	257091574
72	NC_013193	GCACG	2	10	79667	79676	20 %	0 %	40 %	40 %	257091578
73	NC_013193	ACTGG	2	10	80041	80050	20 %	20 %	40 %	20 %	257091578
74	NC_013193	GCTAC	2	10	82553	82562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013193	CGCCA	2	10	82597	82606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013193	GGTGA	2	10	83039	83048	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013193	TTTCA	2	10	86040	86049	20 %	60 %	0 %	20 %	257091581
78	NC_013193	GAACA	2	10	87175	87184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013193	CCGCG	2	10	88005	88014	0 %	0 %	40 %	60 %	257091584
80	NC_013193	CAGTT	2	10	89786	89795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013193	CCGAG	2	10	91878	91887	20 %	0 %	40 %	40 %	257091585
82	NC_013193	GCATC	2	10	92238	92247	20 %	20 %	20 %	40 %	257091585
83	NC_013193	GTCTT	2	10	93083	93092	0 %	60 %	20 %	20 %	257091585
84	NC_013193	AGGCA	2	10	93412	93421	40 %	0 %	40 %	20 %	257091585
85	NC_013193	CGGCT	2	10	95050	95059	0 %	20 %	40 %	40 %	257091586
86	NC_013193	AGGTC	2	10	95633	95642	20 %	20 %	40 %	20 %	257091587
87	NC_013193	TCGGG	2	10	96242	96251	0 %	20 %	60 %	20 %	257091587
88	NC_013193	CATGG	2	10	96783	96792	20 %	20 %	40 %	20 %	257091588
89	NC_013193	AGCCC	2	10	97848	97857	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_013193	CTCGA	2	10	98150	98159	20 %	20 %	20 %	40 %	257091591
91	NC_013193	CTTCG	2	10	101394	101403	0 %	40 %	20 %	40 %	257091595
92	NC_013193	CACGT	2	10	102971	102980	20 %	20 %	20 %	40 %	257091598
93	NC_013193	CCGCG	2	10	103658	103667	0 %	0 %	40 %	60 %	257091599
94	NC_013193	CCTCG	2	10	104954	104963	0 %	20 %	20 %	60 %	257091600
95	NC_013193	GTGCC	2	10	105177	105186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013193	CTGGC	2	10	105572	105581	0 %	20 %	40 %	40 %	257091601
97	NC_013193	GGCGC	2	10	106633	106642	0 %	0 %	60 %	40 %	257091602
98	NC_013193	ATGCA	2	10	107660	107669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013193	GGCCG	2	10	110020	110029	0 %	0 %	60 %	40 %	257091604
100	NC_013193	GGCCC	2	10	112031	112040	0 %	0 %	40 %	60 %	257091606
101	NC_013193	AAGGC	2	10	112738	112747	40 %	0 %	40 %	20 %	257091607
102	NC_013193	GCCAG	2	10	114387	114396	20 %	0 %	40 %	40 %	257091608
103	NC_013193	CTTGC	2	10	114919	114928	0 %	40 %	20 %	40 %	257091608
104	NC_013193	CTGGC	2	10	114956	114965	0 %	20 %	40 %	40 %	257091608
105	NC_013193	CAAGG	2	10	120771	120780	40 %	0 %	40 %	20 %	257091616
106	NC_013193	ACTGC	2	10	123300	123309	20 %	20 %	20 %	40 %	257091619
107	NC_013193	TTAGC	2	10	125077	125086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013193	GTCAT	2	10	125216	125225	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013193	GCCAA	2	10	125514	125523	40 %	0 %	20 %	40 %	257091622
110	NC_013193	CGCTG	2	10	125789	125798	0 %	20 %	40 %	40 %	257091622
111	NC_013193	GCCCG	2	10	130639	130648	0 %	0 %	40 %	60 %	257091625
112	NC_013193	CCTTG	2	10	132125	132134	0 %	40 %	20 %	40 %	257091629
113	NC_013193	CGTTC	2	10	133710	133719	0 %	40 %	20 %	40 %	257091632
114	NC_013193	CAGCG	2	10	134580	134589	20 %	0 %	40 %	40 %	257091633
115	NC_013193	TGCGC	2	10	139246	139255	0 %	20 %	40 %	40 %	257091636
116	NC_013193	ACGCG	2	10	139794	139803	20 %	0 %	40 %	40 %	257091636
117	NC_013193	TCGGT	2	10	142510	142519	0 %	40 %	40 %	20 %	257091638
118	NC_013193	TGCGC	2	10	145205	145214	0 %	20 %	40 %	40 %	257091642
119	NC_013193	GCGCG	2	10	145684	145693	0 %	0 %	60 %	40 %	257091642
120	NC_013193	CGATG	2	10	146862	146871	20 %	20 %	40 %	20 %	257091642
121	NC_013193	GCCAG	2	10	147378	147387	20 %	0 %	40 %	40 %	257091642
122	NC_013193	TTTGC	2	10	151231	151240	0 %	60 %	20 %	20 %	257091645
123	NC_013193	GCCGG	2	10	156093	156102	0 %	0 %	60 %	40 %	257091651
124	NC_013193	TGCGA	2	10	158550	158559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013193	TCGCG	2	10	160479	160488	0 %	20 %	40 %	40 %	257091655
126	NC_013193	TGCGC	2	10	160578	160587	0 %	20 %	40 %	40 %	257091655
127	NC_013193	TGCGC	2	10	161865	161874	0 %	20 %	40 %	40 %	257091655
128	NC_013193	GCGGT	2	10	165296	165305	0 %	20 %	60 %	20 %	257091660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.