MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	TTCC	2	8	13	20	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013193	GAAA	2	8	50	57	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013193	GCAA	2	8	2094	2101	50 %	0 %	25 %	25 %	257091508
4	NC_013193	CGGC	2	8	2494	2501	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
5	NC_013193	GGGT	2	8	3050	3057	0 %	25 %	75 %	0 %	257091510
6	NC_013193	CCGG	2	8	3963	3970	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
7	NC_013193	TCCT	2	8	4449	4456	0 %	50 %	0 %	50 %	257091511
8	NC_013193	GTCG	2	8	4844	4851	0 %	25 %	50 %	25 %	257091511
9	NC_013193	ACGT	2	8	5408	5415	25 %	25 %	25 %	25 %	257091511
10	NC_013193	TTCG	2	8	6039	6046	0 %	50 %	25 %	25 %	257091511
11	NC_013193	TCGC	2	8	6620	6627	0 %	25 %	25 %	50 %	257091511
12	NC_013193	ATGA	2	8	7099	7106	50 %	25 %	25 %	0 %	257091511
13	NC_013193	GATC	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	257091512
14	NC_013193	CGCT	2	8	8123	8130	0 %	25 %	25 %	50 %	257091512
15	NC_013193	GCGG	2	8	8842	8849	0 %	0 %	75 %	25 %	257091514
16	NC_013193	CGAC	2	8	9014	9021	25 %	0 %	25 %	50 %	257091514
17	NC_013193	TTGC	2	8	9102	9109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013193	AACA	2	8	9158	9165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013193	GGGA	2	8	9837	9844	25 %	0 %	75 %	0 %	257091515
20	NC_013193	ATGC	2	8	9948	9955	25 %	25 %	25 %	25 %	257091516
21	NC_013193	TGCA	2	8	10213	10220	25 %	25 %	25 %	25 %	257091516
22	NC_013193	CGTC	2	8	10544	10551	0 %	25 %	25 %	50 %	257091516
23	NC_013193	TTCC	2	8	11226	11233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013193	GAAA	2	8	11263	11270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013193	GTTG	2	8	11790	11797	0 %	50 %	50 %	0 %	257091517
26	NC_013193	CTTG	2	8	12360	12367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013193	ACCG	2	8	12930	12937	25 %	0 %	25 %	50 %	257091519
28	NC_013193	GCTC	2	8	13231	13238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013193	GAGC	2	8	13399	13406	25 %	0 %	50 %	25 %	257091520
30	NC_013193	AATG	2	8	13456	13463	50 %	25 %	25 %	0 %	257091520
31	NC_013193	GCGG	2	8	14085	14092	0 %	0 %	75 %	25 %	257091522
32	NC_013193	CTCG	2	8	14878	14885	0 %	25 %	25 %	50 %	257091524
33	NC_013193	AGCG	2	8	15125	15132	25 %	0 %	50 %	25 %	257091524
34	NC_013193	CGGC	2	8	15682	15689	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
35	NC_013193	CGGT	2	8	16742	16749	0 %	25 %	50 %	25 %	257091524
36	NC_013193	GATT	2	8	17475	17482	25 %	50 %	25 %	0 %	257091525
37	NC_013193	GGCG	2	8	17684	17691	0 %	0 %	75 %	25 %	257091525
38	NC_013193	CAAG	2	8	17804	17811	50 %	0 %	25 %	25 %	257091525
39	NC_013193	GACA	2	8	18307	18314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013193	CGAG	2	8	18403	18410	25 %	0 %	50 %	25 %	257091526
41	NC_013193	CTGG	2	8	19378	19385	0 %	25 %	50 %	25 %	257091528
42	NC_013193	GGCA	2	8	19468	19475	25 %	0 %	50 %	25 %	257091528
43	NC_013193	GGCC	2	8	20184	20191	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
44	NC_013193	CGGC	2	8	20367	20374	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
45	NC_013193	AGCG	2	8	20576	20583	25 %	0 %	50 %	25 %	257091528
46	NC_013193	TCGA	2	8	20639	20646	25 %	25 %	25 %	25 %	257091528
47	NC_013193	GGGC	2	8	20899	20906	0 %	0 %	75 %	25 %	257091528
48	NC_013193	GTTC	2	8	20994	21001	0 %	50 %	25 %	25 %	257091528
49	NC_013193	CAGC	2	8	21742	21749	25 %	0 %	25 %	50 %	257091528
50	NC_013193	AGCC	2	8	21781	21788	25 %	0 %	25 %	50 %	257091528
51	NC_013193	GCGG	2	8	22531	22538	0 %	0 %	75 %	25 %	257091529
52	NC_013193	GTGC	2	8	22847	22854	0 %	25 %	50 %	25 %	257091529
53	NC_013193	CGGG	2	8	24621	24628	0 %	0 %	75 %	25 %	257091529
54	NC_013193	GGGC	2	8	25590	25597	0 %	0 %	75 %	25 %	257091530
55	NC_013193	CGGC	2	8	25619	25626	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
56	NC_013193	GGGC	2	8	25826	25833	0 %	0 %	75 %	25 %	257091530
57	NC_013193	GCCC	2	8	26398	26405	0 %	0 %	25 %	75 %	257091530
58	NC_013193	GGTC	2	8	26472	26479	0 %	25 %	50 %	25 %	257091530
59	NC_013193	GCCC	2	8	26843	26850	0 %	0 %	25 %	75 %	257091530
60	NC_013193	CAGC	2	8	26922	26929	25 %	0 %	25 %	50 %	257091530
61	NC_013193	GCCT	2	8	26936	26943	0 %	25 %	25 %	50 %	257091530
62	NC_013193	CGGC	2	8	26949	26956	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
63	NC_013193	CACG	2	8	28384	28391	25 %	0 %	25 %	50 %	257091532
64	NC_013193	GTCG	2	8	28412	28419	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
65	NC_013193	CGGT	2	8	29013	29020	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
66	NC_013193	GTCG	2	8	29111	29118	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
67	NC_013193	TGCG	2	8	29128	29135	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
68	NC_013193	AATG	2	8	29141	29148	50 %	25 %	25 %	0 %	257091532
69	NC_013193	GCGG	2	8	29774	29781	0 %	0 %	75 %	25 %	257091532
70	NC_013193	TCGC	2	8	30078	30085	0 %	25 %	25 %	50 %	257091532
71	NC_013193	GGAG	2	8	30971	30978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013193	CGCA	2	8	31379	31386	25 %	0 %	25 %	50 %	257091533
73	NC_013193	GAAG	2	8	31625	31632	50 %	0 %	50 %	0 %	257091533
74	NC_013193	GTCG	2	8	32175	32182	0 %	25 %	50 %	25 %	257091533
75	NC_013193	CCGG	2	8	32612	32619	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
76	NC_013193	GACG	2	8	32692	32699	25 %	0 %	50 %	25 %	257091534
77	NC_013193	CGCT	2	8	32756	32763	0 %	25 %	25 %	50 %	257091534
78	NC_013193	GAAC	2	8	32834	32841	50 %	0 %	25 %	25 %	257091534
79	NC_013193	CCGG	2	8	32855	32862	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
80	NC_013193	TCGA	2	8	34109	34116	25 %	25 %	25 %	25 %	257091535
81	NC_013193	ATCG	2	8	34614	34621	25 %	25 %	25 %	25 %	257091535
82	NC_013193	TCGC	2	8	35904	35911	0 %	25 %	25 %	50 %	257091535
83	NC_013193	CCAA	2	8	35934	35941	50 %	0 %	0 %	50 %	257091535
84	NC_013193	CTGG	2	8	36196	36203	0 %	25 %	50 %	25 %	257091535
85	NC_013193	TCGG	2	8	36706	36713	0 %	25 %	50 %	25 %	257091535
86	NC_013193	GGTG	2	8	37397	37404	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013193	GGTC	2	8	38071	38078	0 %	25 %	50 %	25 %	257091536
88	NC_013193	AGAC	2	8	38107	38114	50 %	0 %	25 %	25 %	257091536
89	NC_013193	GGCA	2	8	38122	38129	25 %	0 %	50 %	25 %	257091536
90	NC_013193	GACT	2	8	38258	38265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013193	AGAA	2	8	38370	38377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013193	CGGC	2	8	39108	39115	0 %	0 %	50 %	50 %	257091538
93	NC_013193	CGGC	2	8	39723	39730	0 %	0 %	50 %	50 %	257091538
94	NC_013193	GTGC	2	8	39900	39907	0 %	25 %	50 %	25 %	257091538
95	NC_013193	AGAT	2	8	41290	41297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013193	GTTT	2	8	41338	41345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013193	GAGC	2	8	41502	41509	25 %	0 %	50 %	25 %	257091542
98	NC_013193	AGGG	2	8	41906	41913	25 %	0 %	75 %	0 %	257091542
99	NC_013193	CTGG	2	8	42029	42036	0 %	25 %	50 %	25 %	257091543
100	NC_013193	GCGG	2	8	42422	42429	0 %	0 %	75 %	25 %	257091543
101	NC_013193	GCAC	2	8	42624	42631	25 %	0 %	25 %	50 %	257091543
102	NC_013193	GGCA	2	8	43445	43452	25 %	0 %	50 %	25 %	257091544
103	NC_013193	ACCG	2	8	44159	44166	25 %	0 %	25 %	50 %	257091545
104	NC_013193	GATT	2	8	44559	44566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013193	CCAG	2	8	45163	45170	25 %	0 %	25 %	50 %	257091546
106	NC_013193	CGGC	2	8	45657	45664	0 %	0 %	50 %	50 %	257091546
107	NC_013193	ACGA	2	8	46526	46533	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013193	CAAC	2	8	46545	46552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013193	TCCG	2	8	46769	46776	0 %	25 %	25 %	50 %	257091547
110	NC_013193	TCCT	2	8	46806	46813	0 %	50 %	0 %	50 %	257091547
111	NC_013193	GACA	2	8	46950	46957	50 %	0 %	25 %	25 %	257091547
112	NC_013193	CATC	2	8	47221	47228	25 %	25 %	0 %	50 %	257091547
113	NC_013193	CTTC	2	8	47928	47935	0 %	50 %	0 %	50 %	257091548
114	NC_013193	GAAC	2	8	47958	47965	50 %	0 %	25 %	25 %	257091548
115	NC_013193	GACG	2	8	48524	48531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013193	AGAA	2	8	49232	49239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013193	GCTT	2	8	49775	49782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013193	CCAG	2	8	51078	51085	25 %	0 %	25 %	50 %	257091552
119	NC_013193	GGGC	2	8	51782	51789	0 %	0 %	75 %	25 %	257091552
120	NC_013193	GAAG	2	8	51819	51826	50 %	0 %	50 %	0 %	257091552
121	NC_013193	GGCC	2	8	52011	52018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013193	GCAG	2	8	52224	52231	25 %	0 %	50 %	25 %	257091553
123	NC_013193	AGCC	2	8	53278	53285	25 %	0 %	25 %	50 %	257091554
124	NC_013193	GTCG	2	8	53559	53566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013193	CAGT	2	8	53699	53706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013193	GTCG	2	8	53721	53728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013193	CCCG	2	8	54534	54541	0 %	0 %	25 %	75 %	257091555
128	NC_013193	GCCT	2	8	55079	55086	0 %	25 %	25 %	50 %	257091555
129	NC_013193	GGAT	2	8	55377	55384	25 %	25 %	50 %	0 %	257091556
130	NC_013193	CTTG	2	8	55884	55891	0 %	50 %	25 %	25 %	257091556
131	NC_013193	AGCT	2	8	55942	55949	25 %	25 %	25 %	25 %	257091556
132	NC_013193	AGCC	2	8	56572	56579	25 %	0 %	25 %	50 %	257091557
133	NC_013193	AGCG	2	8	56702	56709	25 %	0 %	50 %	25 %	257091557
134	NC_013193	GGGA	2	8	58044	58051	25 %	0 %	75 %	0 %	257091559
135	NC_013193	GCTG	2	8	58496	58503	0 %	25 %	50 %	25 %	257091559
136	NC_013193	GCCG	2	8	58538	58545	0 %	0 %	50 %	50 %	257091559
137	NC_013193	GAAA	2	8	58586	58593	75 %	0 %	25 %	0 %	257091559
138	NC_013193	CAGG	2	8	58771	58778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013193	CGCC	2	8	59246	59253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_013193	GGCT	2	8	59976	59983	0 %	25 %	50 %	25 %	257091560
141	NC_013193	TTCT	2	8	60402	60409	0 %	75 %	0 %	25 %	257091560
142	NC_013193	CCGG	2	8	61078	61085	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
143	NC_013193	CGCC	2	8	61362	61369	0 %	0 %	25 %	75 %	257091560
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418	NC_013193	ACCG	2	8	165824	165831	25 %	0 %	25 %	50 %	257091660
419	NC_013193	GCCA	2	8	166199	166206	25 %	0 %	25 %	50 %	257091660
420	NC_013193	GGGA	2	8	166219	166226	25 %	0 %	75 %	0 %	257091660
421	NC_013193	ATGC	2	8	166330	166337	25 %	25 %	25 %	25 %	257091661
422	NC_013193	TGCA	2	8	166595	166602	25 %	25 %	25 %	25 %	257091661
423	NC_013193	CGTC	2	8	166926	166933	0 %	25 %	25 %	50 %	257091661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.