MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 3553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013193	GGTC	2	8	164557	164564	0 %	25 %	50 %	25 %	257091659
3502	NC_013193	GCG	2	6	164584	164589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091659
3503	NC_013193	AAGG	2	8	164625	164632	50 %	0 %	50 %	0 %	257091659
3504	NC_013193	GTTC	2	8	164695	164702	0 %	50 %	25 %	25 %	257091659
3505	NC_013193	TCG	2	6	164718	164723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091659
3506	NC_013193	GAC	2	6	164883	164888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013193	ATCG	2	8	164897	164904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_013193	CGT	2	6	164952	164957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013193	GGC	2	6	165154	165159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013193	TCG	2	6	165209	165214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091660
3511	NC_013193	CGC	2	6	165219	165224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091660
3512	NC_013193	TTC	2	6	165241	165246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091660
3513	NC_013193	CGCC	2	8	165273	165280	0 %	0 %	25 %	75 %	257091660
3514	NC_013193	CAGG	2	8	165288	165295	25 %	0 %	50 %	25 %	257091660
3515	NC_013193	GCGGT	2	10	165296	165305	0 %	20 %	60 %	20 %	257091660
3516	NC_013193	TCTTGC	2	12	165366	165377	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257091660
3517	NC_013193	CGG	2	6	165435	165440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091660
3518	NC_013193	CAC	2	6	165502	165507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091660
3519	NC_013193	GAA	2	6	165547	165552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091660
3520	NC_013193	TCG	2	6	165554	165559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091660
3521	NC_013193	GCA	2	6	165636	165641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091660
3522	NC_013193	GCG	2	6	165776	165781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091660
3523	NC_013193	ACCG	2	8	165824	165831	25 %	0 %	25 %	50 %	257091660
3524	NC_013193	GAT	2	6	165898	165903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091660
3525	NC_013193	GCC	2	6	165915	165920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091660
3526	NC_013193	CCA	2	6	165932	165937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091660
3527	NC_013193	TGG	2	6	165941	165946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091660
3528	NC_013193	C	6	6	166071	166076	0 %	0 %	0 %	100 %	257091660
3529	NC_013193	TGG	2	6	166182	166187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091660
3530	NC_013193	GCCA	2	8	166199	166206	25 %	0 %	25 %	50 %	257091660
3531	NC_013193	GCG	2	6	166208	166213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091660
3532	NC_013193	GGGA	2	8	166219	166226	25 %	0 %	75 %	0 %	257091660
3533	NC_013193	ATGC	2	8	166330	166337	25 %	25 %	25 %	25 %	257091661
3534	NC_013193	AGA	2	6	166389	166394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091661
3535	NC_013193	GCC	2	6	166430	166435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091661
3536	NC_013193	CG	3	6	166459	166464	0 %	0 %	50 %	50 %	257091661
3537	NC_013193	C	7	7	166466	166472	0 %	0 %	0 %	100 %	257091661
3538	NC_013193	TGCA	2	8	166595	166602	25 %	25 %	25 %	25 %	257091661
3539	NC_013193	AAC	2	6	166628	166633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091661
3540	NC_013193	TGC	2	6	166736	166741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091661
3541	NC_013193	CCT	2	6	166827	166832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091661
3542	NC_013193	TCA	2	6	166851	166856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091661
3543	NC_013193	CGTC	2	8	166926	166933	0 %	25 %	25 %	50 %	257091661
3544	NC_013193	CAC	2	6	166984	166989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091661
3545	NC_013193	AGC	2	6	167084	167089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091661
3546	NC_013193	GTC	2	6	167155	167160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091661
3547	NC_013193	CAA	2	6	167274	167279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013193	CTC	2	6	167385	167390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_013193	ACA	2	6	167392	167397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013193	GAT	2	6	167472	167477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013193	GA	3	6	167551	167556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013193	A	6	6	167556	167561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013193	CT	3	6	167563	167568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.