MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013167	TTA	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013167	TTA	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013167	GTT	4	12	166	177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013167	TAA	3	9	214	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823862
6	NC_013167	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
7	NC_013167	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823862
8	NC_013167	GAC	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823862
9	NC_013167	TCT	2	6	395	400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823862
10	NC_013167	ATT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
11	NC_013167	TAA	2	6	553	558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013167	TTC	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823863
13	NC_013167	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823863
14	NC_013167	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
15	NC_013167	TCC	2	6	865	870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
16	NC_013167	AAT	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013167	TCA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013167	AAC	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013167	TAA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013167	TAA	2	6	1128	1133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013167	TAA	2	6	1135	1140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013167	TAA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013167	TAA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013167	TAA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013167	TAA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013167	ATA	2	6	1169	1174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013167	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013167	TTA	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013167	TTA	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013167	TTA	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013167	ACC	3	9	1559	1567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
32	NC_013167	GTA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
33	NC_013167	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
34	NC_013167	AGC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
35	NC_013167	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
36	NC_013167	CTG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
37	NC_013167	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823864
38	NC_013167	TAG	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
39	NC_013167	TGT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
40	NC_013167	TTG	3	9	2168	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
41	NC_013167	TTG	3	9	2213	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
42	NC_013167	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
43	NC_013167	TTA	2	6	2286	2291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
44	NC_013167	TAT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
45	NC_013167	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
46	NC_013167	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
47	NC_013167	CTC	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
48	NC_013167	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
49	NC_013167	TTG	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
50	NC_013167	TAA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
51	NC_013167	TCT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
52	NC_013167	CTC	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
53	NC_013167	GTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
54	NC_013167	AAT	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
55	NC_013167	TTA	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
56	NC_013167	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
57	NC_013167	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
58	NC_013167	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
59	NC_013167	GCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
60	NC_013167	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
61	NC_013167	AGA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
62	NC_013167	TGC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823865
63	NC_013167	AGG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823866
64	NC_013167	AGC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
65	NC_013167	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
66	NC_013167	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
67	NC_013167	TGG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823866
68	NC_013167	GAT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
69	NC_013167	GAT	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
70	NC_013167	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
71	NC_013167	GAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
72	NC_013167	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
73	NC_013167	TGA	3	9	4200	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
74	NC_013167	GTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
75	NC_013167	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
76	NC_013167	TTG	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
77	NC_013167	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823866
78	NC_013167	CGA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
79	NC_013167	TTC	2	6	4511	4516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
80	NC_013167	CCG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256823866
81	NC_013167	TTC	2	6	4580	4585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
82	NC_013167	TCT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
83	NC_013167	GTT	2	6	4803	4808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
84	NC_013167	GCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
85	NC_013167	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823866
86	NC_013167	ATC	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
87	NC_013167	CGT	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
88	NC_013167	ATT	2	6	4925	4930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823866
89	NC_013167	TCT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
90	NC_013167	CCA	3	9	5166	5174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823867
91	NC_013167	GGT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823867
92	NC_013167	AGC	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823867
93	NC_013167	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
94	NC_013167	GGA	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823867
95	NC_013167	TCA	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
96	NC_013167	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
97	NC_013167	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823867
98	NC_013167	TTC	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
99	NC_013167	TTG	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823867
100	NC_013167	CTT	2	6	5889	5894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
101	NC_013167	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
102	NC_013167	GCT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
103	NC_013167	GAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
104	NC_013167	TGC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
105	NC_013167	CTT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
106	NC_013167	TCA	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
107	NC_013167	GTG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013167	GGC	2	6	6490	6495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013167	AAG	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823868
110	NC_013167	TCC	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823868
111	NC_013167	GAT	2	6	6908	6913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823868
112	NC_013167	TAA	2	6	6963	6968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823868
113	NC_013167	TAT	2	6	7105	7110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823868
114	NC_013167	TGT	2	6	7150	7155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823869
115	NC_013167	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823869
116	NC_013167	ACT	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013167	CGG	2	6	7659	7664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256823870
118	NC_013167	GGA	2	6	7679	7684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823870
119	NC_013167	TTC	2	6	7703	7708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823870
120	NC_013167	TAG	2	6	7757	7762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823870
121	NC_013167	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823871
122	NC_013167	GTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823871
123	NC_013167	GGT	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823871
124	NC_013167	ACA	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823871
125	NC_013167	AAG	2	6	7953	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823871
126	NC_013167	AGA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823871
127	NC_013167	CTA	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823871
128	NC_013167	GCT	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823872
129	NC_013167	GCT	2	6	8332	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823872
130	NC_013167	GAT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
131	NC_013167	AGG	2	6	8369	8374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823872
132	NC_013167	TGA	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
133	NC_013167	GAT	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823872
134	NC_013167	CAC	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823872
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263	NC_013167	ATA	2	6	15589	15594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013167	GAA	2	6	15641	15646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_013167	TTA	2	6	15701	15706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_013167	TTA	2	6	15708	15713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_013167	TTA	2	6	15722	15727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_013167	ATT	2	6	15735	15740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_013167	TTA	2	6	15743	15748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_013167	TTA	2	6	15757	15762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_013167	GTT	2	6	15787	15792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823882
272	NC_013167	CCT	2	6	15967	15972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823882
273	NC_013167	ATT	2	6	16025	16030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823882
274	NC_013167	TCA	2	6	16182	16187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823882
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278	NC_013167	TCT	2	6	16489	16494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823882
279	NC_013167	CTG	2	6	16645	16650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823882
280	NC_013167	CTT	2	6	16693	16698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823882
281	NC_013167	TCA	2	6	16731	16736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823882
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285	NC_013167	AGT	2	6	16836	16841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823882
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287	NC_013167	TTG	2	6	17218	17223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823883
288	NC_013167	TCC	2	6	17277	17282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_013167	TAT	2	6	17327	17332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013167	ATT	2	6	17342	17347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013167	AAT	2	6	17348	17353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013167	CAA	2	6	17364	17369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_013167	CGG	2	6	17554	17559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_013167	TTG	2	6	17909	17914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823884
295	NC_013167	ATT	3	9	17999	18007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823884
296	NC_013167	AAT	2	6	18024	18029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823884
297	NC_013167	TTA	2	6	18071	18076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823884
298	NC_013167	TTG	2	6	18131	18136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823884
299	NC_013167	CAA	2	6	18255	18260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823884
300	NC_013167	CCT	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823884
301	NC_013167	TTG	2	6	18406	18411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823884
302	NC_013167	AAT	2	6	18457	18462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823884
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312	NC_013167	TTA	3	9	19452	19460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_013167	GTT	2	6	19645	19650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_013167	ATT	2	6	19658	19663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_013167	TCT	2	6	20111	20116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
322	NC_013167	AAT	2	6	20216	20221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823886
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.