MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 34054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013162	GAA	2	6	90	95	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013162	AAT	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013162	TAG	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013162	ATT	2	6	685	690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013162	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013162	TAC	3	9	759	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
8	NC_013162	TAC	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
9	NC_013162	ATG	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818849
10	NC_013162	AGG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818849
11	NC_013162	TAC	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
12	NC_013162	AAG	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
13	NC_013162	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
14	NC_013162	GAA	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
15	NC_013162	AAG	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
16	NC_013162	TAC	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
17	NC_013162	GCT	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818850
18	NC_013162	GGA	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818850
19	NC_013162	TAG	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
20	NC_013162	CAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818850
21	NC_013162	TCA	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
22	NC_013162	GAG	2	6	2024	2029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818850
23	NC_013162	ACT	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
24	NC_013162	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
25	NC_013162	TAG	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
26	NC_013162	GAA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818850
27	NC_013162	ATC	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
28	NC_013162	CAA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818850
29	NC_013162	ATT	2	6	2637	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013162	CAG	2	6	2672	2677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818851
31	NC_013162	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
32	NC_013162	TAT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
33	NC_013162	ACA	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
34	NC_013162	AAT	2	6	2860	2865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818851
35	NC_013162	GAC	2	6	2935	2940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818851
36	NC_013162	TTC	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818851
37	NC_013162	AAC	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
38	NC_013162	ATT	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
39	NC_013162	GAA	2	6	3184	3189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
40	NC_013162	AAG	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
41	NC_013162	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
42	NC_013162	GTA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
43	NC_013162	TTA	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
44	NC_013162	TAG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
45	NC_013162	AGT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
46	NC_013162	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
47	NC_013162	TGC	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
48	NC_013162	AGT	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
49	NC_013162	AGG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818851
50	NC_013162	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
51	NC_013162	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818851
52	NC_013162	GGT	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818851
53	NC_013162	ACA	3	9	4506	4514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
54	NC_013162	TGA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
55	NC_013162	CGT	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
56	NC_013162	GAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013162	TAT	2	6	4911	4916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013162	ACC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013162	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013162	AAC	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818852
61	NC_013162	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818852
62	NC_013162	ATT	2	6	5120	5125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
63	NC_013162	GTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818852
64	NC_013162	TCA	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
65	NC_013162	TTA	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
66	NC_013162	AGT	2	6	5475	5480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818852
67	NC_013162	AGG	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818852
68	NC_013162	ACT	3	9	5616	5624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
69	NC_013162	CTT	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818852
70	NC_013162	CAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
71	NC_013162	TAT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
72	NC_013162	CAG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818853
73	NC_013162	AGA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013162	AAT	2	6	6277	6282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013162	ATA	2	6	6353	6358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013162	ATT	2	6	6388	6393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013162	TCA	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818854
78	NC_013162	CTT	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818854
79	NC_013162	ATA	2	6	6706	6711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818854
80	NC_013162	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818854
81	NC_013162	GAG	2	6	6896	6901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818854
82	NC_013162	CTT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818854
83	NC_013162	ATT	2	6	7153	7158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818855
84	NC_013162	TGA	2	6	7266	7271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818855
85	NC_013162	TCA	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818855
86	NC_013162	TTC	3	9	7498	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
87	NC_013162	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818855
88	NC_013162	CGG	2	6	7782	7787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818855
89	NC_013162	TCT	2	6	7802	7807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
90	NC_013162	TAC	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818855
91	NC_013162	TGG	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818855
92	NC_013162	TAG	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818855
93	NC_013162	TGA	2	6	7893	7898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818855
94	NC_013162	TCT	2	6	8099	8104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
95	NC_013162	CTT	3	9	8175	8183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
96	NC_013162	TTC	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
97	NC_013162	GAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818855
98	NC_013162	CTT	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
99	NC_013162	AAT	2	6	8544	8549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818855
100	NC_013162	AAG	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818855
101	NC_013162	TGT	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818855
102	NC_013162	TCT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
103	NC_013162	TCC	2	6	8627	8632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818855
104	NC_013162	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
105	NC_013162	TGA	2	6	8832	8837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818855
106	NC_013162	TCG	2	6	8852	8857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818855
107	NC_013162	GAG	3	9	8866	8874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818855
108	NC_013162	TCT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
109	NC_013162	CAA	2	6	9072	9077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818855
110	NC_013162	TCA	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818855
111	NC_013162	TCT	3	9	9254	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818855
112	NC_013162	TAG	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818856
113	NC_013162	TTC	2	6	9415	9420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818856
114	NC_013162	TCT	2	6	9431	9436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818856
115	NC_013162	TTC	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818856
116	NC_013162	TGT	2	6	9555	9560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818856
117	NC_013162	GCT	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818856
118	NC_013162	TTC	2	6	9772	9777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818856
119	NC_013162	TAG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818856
120	NC_013162	CAA	2	6	10008	10013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818856
121	NC_013162	AAT	2	6	10121	10126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013162	CTT	2	6	10146	10151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818857
123	NC_013162	AAG	2	6	10177	10182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818857
124	NC_013162	AAT	2	6	10252	10257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818857
125	NC_013162	TGA	2	6	10286	10291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818857
126	NC_013162	CAT	3	9	10335	10343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818857
127	NC_013162	TCT	2	6	10406	10411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818857
128	NC_013162	ATT	2	6	10417	10422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818857
129	NC_013162	ATG	2	6	10443	10448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013162	CTT	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013162	GAA	2	6	10726	10731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818858
132	NC_013162	GCA	2	6	10732	10737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818858
133	NC_013162	TCG	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818858
134	NC_013162	CTG	2	6	10943	10948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818858
135	NC_013162	TAA	2	6	11072	11077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013162	TAA	2	6	11189	11194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013162	ATT	2	6	11202	11207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013162	TAT	2	6	11227	11232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818859
139	NC_013162	TAT	2	6	11390	11395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818859
140	NC_013162	TAA	2	6	11440	11445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818859
141	NC_013162	TCA	2	6	11601	11606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818859
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145	NC_013162	TTG	2	6	11812	11817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818859
146	NC_013162	TCA	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818859
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153	NC_013162	CAT	2	6	12313	12318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013162	CAA	2	6	12512	12517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_013162	TAA	2	6	13049	13054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818860
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162	NC_013162	CAT	2	6	13572	13577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818861
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183	NC_013162	ATA	2	6	15292	15297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818862
184	NC_013162	GAA	2	6	15316	15321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818862
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186	NC_013162	TAA	2	6	15525	15530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013162	TTA	2	6	15654	15659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818863
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203	NC_013162	CTA	2	6	16562	16567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818863
204	NC_013162	ATT	2	6	16680	16685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818863
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207	NC_013162	CCT	2	6	16921	16926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818863
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213	NC_013162	CTT	2	6	17161	17166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
214	NC_013162	TAT	2	6	17342	17347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818864
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220	NC_013162	GTC	2	6	17667	17672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818864
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233	NC_013162	TAG	2	6	18500	18505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818864
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238	NC_013162	TGT	2	6	18927	18932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818865
239	NC_013162	ACA	2	6	18990	18995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818865
240	NC_013162	TAC	2	6	19049	19054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818865
241	NC_013162	TTC	2	6	19151	19156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818865
242	NC_013162	CAT	2	6	19169	19174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818865
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244	NC_013162	ATC	2	6	19352	19357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818865
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247	NC_013162	TGA	2	6	19566	19571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_013162	TAT	2	6	19576	19581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818866
249	NC_013162	AAT	2	6	19598	19603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818866
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251	NC_013162	CTT	2	6	20210	20215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818866
252	NC_013162	TTA	2	6	20222	20227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818866
253	NC_013162	TTC	2	6	20262	20267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818866
254	NC_013162	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_013162	CTA	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_013162	TTA	2	6	20492	20497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818867
257	NC_013162	GGA	2	6	20635	20640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818867
258	NC_013162	ACC	2	6	20714	20719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818867
259	NC_013162	TCC	2	6	20720	20725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818867
260	NC_013162	ATC	2	6	20786	20791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818867
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262	NC_013162	CTT	2	6	20824	20829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818867
263	NC_013162	TTC	2	6	20900	20905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818867
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283	NC_013162	ATG	2	6	22617	22622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013162	GAA	2	6	22677	22682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_013162	CAT	2	6	25904	25909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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