MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 54609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013162	GAA	2	6	90	95	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013162	AAT	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013162	AG	3	6	113	118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013162	ATAA	2	8	212	219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013162	GAAC	2	8	232	239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013162	GAAC	2	8	243	250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013162	GAAC	2	8	254	261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013162	GAAC	2	8	265	272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013162	GAAC	2	8	353	360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013162	ACGA	2	8	366	373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013162	ACGA	2	8	388	395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013162	TAG	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013162	AAAG	2	8	581	588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013162	AT	4	8	614	621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013162	TA	3	6	642	647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013162	A	6	6	653	658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013162	ATT	2	6	685	690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013162	T	6	6	689	694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013162	AAAC	2	8	712	719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013162	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013162	CA	3	6	738	743	50 %	0 %	0 %	50 %	256818849
23	NC_013162	TAC	3	9	759	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
24	NC_013162	TG	3	6	853	858	0 %	50 %	50 %	0 %	256818849
25	NC_013162	AT	3	6	923	928	50 %	50 %	0 %	0 %	256818849
26	NC_013162	CA	3	6	933	938	50 %	0 %	0 %	50 %	256818849
27	NC_013162	TAC	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
28	NC_013162	ATG	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818849
29	NC_013162	GACC	2	8	1079	1086	25 %	0 %	25 %	50 %	256818849
30	NC_013162	CTAC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	256818849
31	NC_013162	A	6	6	1218	1223	100 %	0 %	0 %	0 %	256818849
32	NC_013162	AGG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818849
33	NC_013162	TAC	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818849
34	NC_013162	AAG	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
35	NC_013162	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
36	NC_013162	TATT	2	8	1508	1515	25 %	75 %	0 %	0 %	256818849
37	NC_013162	AAGTG	2	10	1591	1600	40 %	20 %	40 %	0 %	256818849
38	NC_013162	GAA	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
39	NC_013162	AAG	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818849
40	NC_013162	TAC	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
41	NC_013162	GCT	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818850
42	NC_013162	GGA	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818850
43	NC_013162	TAG	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
44	NC_013162	CAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818850
45	NC_013162	TA	3	6	1913	1918	50 %	50 %	0 %	0 %	256818850
46	NC_013162	CTACT	2	10	1959	1968	20 %	40 %	0 %	40 %	256818850
47	NC_013162	TCA	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
48	NC_013162	GAG	2	6	2024	2029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818850
49	NC_013162	ACT	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
50	NC_013162	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
51	NC_013162	TAG	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818850
52	NC_013162	CTAT	2	8	2190	2197	25 %	50 %	0 %	25 %	256818850
53	NC_013162	AT	3	6	2220	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	256818850
54	NC_013162	GAA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818850
55	NC_013162	ATC	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818850
56	NC_013162	CAA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818850
57	NC_013162	ATT	2	6	2637	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013162	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013162	CAG	2	6	2672	2677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818851
60	NC_013162	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
61	NC_013162	TAT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
62	NC_013162	ACA	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
63	NC_013162	AAT	2	6	2860	2865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818851
64	NC_013162	A	6	6	2913	2918	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
65	NC_013162	GAC	2	6	2935	2940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818851
66	NC_013162	TTC	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818851
67	NC_013162	AAC	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
68	NC_013162	AGAAGC	2	12	3006	3017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	256818851
69	NC_013162	ATT	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
70	NC_013162	GAA	2	6	3184	3189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
71	NC_013162	AAGA	2	8	3196	3203	75 %	0 %	25 %	0 %	256818851
72	NC_013162	A	6	6	3244	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
73	NC_013162	AAG	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
74	NC_013162	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
75	NC_013162	GTA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
76	NC_013162	TTA	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818851
77	NC_013162	TAG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
78	NC_013162	AGT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
79	NC_013162	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818851
80	NC_013162	TGC	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
81	NC_013162	A	6	6	3868	3873	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
82	NC_013162	AGT	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
83	NC_013162	AGG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818851
84	NC_013162	TTTA	2	8	3951	3958	25 %	75 %	0 %	0 %	256818851
85	NC_013162	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
86	NC_013162	CG	3	6	3992	3997	0 %	0 %	50 %	50 %	256818851
87	NC_013162	CT	3	6	4012	4017	0 %	50 %	0 %	50 %	256818851
88	NC_013162	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818851
89	NC_013162	GGT	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818851
90	NC_013162	AAAC	2	8	4144	4151	75 %	0 %	0 %	25 %	256818851
91	NC_013162	AT	3	6	4326	4331	50 %	50 %	0 %	0 %	256818851
92	NC_013162	A	6	6	4444	4449	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
93	NC_013162	ACA	3	9	4506	4514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818851
94	NC_013162	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
95	NC_013162	TGA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818851
96	NC_013162	TAAAA	2	10	4653	4662	80 %	20 %	0 %	0 %	256818851
97	NC_013162	A	6	6	4659	4664	100 %	0 %	0 %	0 %	256818851
98	NC_013162	CGT	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818851
99	NC_013162	TA	3	6	4723	4728	50 %	50 %	0 %	0 %	256818851
100	NC_013162	GAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013162	TAT	2	6	4911	4916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013162	AT	3	6	4915	4920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013162	ACC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013162	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013162	AAC	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818852
106	NC_013162	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818852
107	NC_013162	ATT	2	6	5120	5125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
108	NC_013162	GTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818852
109	NC_013162	AAAG	2	8	5235	5242	75 %	0 %	25 %	0 %	256818852
110	NC_013162	TCA	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
111	NC_013162	TTA	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
112	NC_013162	TCCT	2	8	5387	5394	0 %	50 %	0 %	50 %	256818852
113	NC_013162	TTACT	2	10	5411	5420	20 %	60 %	0 %	20 %	256818852
114	NC_013162	AGT	2	6	5475	5480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818852
115	NC_013162	CTTT	2	8	5510	5517	0 %	75 %	0 %	25 %	256818852
116	NC_013162	AGG	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818852
117	NC_013162	TA	3	6	5600	5605	50 %	50 %	0 %	0 %	256818852
118	NC_013162	TA	3	6	5609	5614	50 %	50 %	0 %	0 %	256818852
119	NC_013162	ACT	3	9	5616	5624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
120	NC_013162	CA	3	6	5659	5664	50 %	0 %	0 %	50 %	256818852
121	NC_013162	CTT	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818852
122	NC_013162	CTTT	2	8	5724	5731	0 %	75 %	0 %	25 %	256818852
123	NC_013162	T	7	7	5729	5735	0 %	100 %	0 %	0 %	256818852
124	NC_013162	TACT	2	8	5789	5796	25 %	50 %	0 %	25 %	256818852
125	NC_013162	T	6	6	5802	5807	0 %	100 %	0 %	0 %	256818852
126	NC_013162	CAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818852
127	NC_013162	TAT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818852
128	NC_013162	AT	3	6	5997	6002	50 %	50 %	0 %	0 %	256818852
129	NC_013162	CAG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818853
130	NC_013162	A	6	6	6075	6080	100 %	0 %	0 %	0 %	256818853
131	NC_013162	TAAA	2	8	6172	6179	75 %	25 %	0 %	0 %	256818853
132	NC_013162	TCTTTA	2	12	6243	6254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013162	AGA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013162	AAT	2	6	6277	6282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013162	T	6	6	6304	6309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013162	A	6	6	6328	6333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013162	A	7	7	6338	6344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013162	ATA	2	6	6353	6358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013162	ATT	2	6	6388	6393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013162	A	7	7	6486	6492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013162	TCA	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818854
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268	NC_013162	T	8	8	12292	12299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_013162	CAA	2	6	12512	12517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_013162	T	6	6	12629	12634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_013162	A	6	6	12640	12645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_013162	GTC	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818860
276	NC_013162	TA	3	6	12825	12830	50 %	50 %	0 %	0 %	256818860
277	NC_013162	AAT	2	6	12860	12865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818860
278	NC_013162	TAC	2	6	12948	12953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818860
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280	NC_013162	ATG	2	6	13012	13017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818860
281	NC_013162	T	6	6	13018	13023	0 %	100 %	0 %	0 %	256818860
282	NC_013162	TAA	2	6	13049	13054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818860
283	NC_013162	GAT	2	6	13167	13172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818860
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285	NC_013162	A	6	6	13291	13296	100 %	0 %	0 %	0 %	256818860
286	NC_013162	TTC	2	6	13297	13302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818860
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289	NC_013162	TTA	2	6	13603	13608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818861
290	NC_013162	TAG	3	9	13697	13705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818861
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292	NC_013162	TGG	2	6	13772	13777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818861
293	NC_013162	CTG	2	6	13814	13819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818861
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297	NC_013162	A	6	6	13911	13916	100 %	0 %	0 %	0 %	256818861
298	NC_013162	ATT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818861
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302	NC_013162	ACC	2	6	14040	14045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818861
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310	NC_013162	TATC	2	8	14456	14463	25 %	50 %	0 %	25 %	256818861
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320	NC_013162	TAA	2	6	14827	14832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818862
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399	NC_013162	T	6	6	18372	18377	0 %	100 %	0 %	0 %	256818864
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403	NC_013162	TAG	2	6	18500	18505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818864
404	NC_013162	AG	3	6	18603	18608	50 %	0 %	50 %	0 %	256818864
405	NC_013162	AAAG	2	8	18643	18650	75 %	0 %	25 %	0 %	256818864
406	NC_013162	GTA	2	6	18680	18685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818864
407	NC_013162	TAA	2	6	18695	18700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818864
408	NC_013162	AAT	2	6	18789	18794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818864
409	NC_013162	GTT	2	6	18803	18808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818864
410	NC_013162	GATT	2	8	18834	18841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
411	NC_013162	CTTT	2	8	18895	18902	0 %	75 %	0 %	25 %	256818865
412	NC_013162	TGT	2	6	18927	18932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818865
413	NC_013162	TA	3	6	18950	18955	50 %	50 %	0 %	0 %	256818865
414	NC_013162	ACA	2	6	18990	18995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818865
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417	NC_013162	TTC	2	6	19151	19156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818865
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420	NC_013162	ACGCC	2	10	19223	19232	20 %	0 %	20 %	60 %	256818865
421	NC_013162	ATC	2	6	19352	19357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818865
422	NC_013162	AGG	2	6	19376	19381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818865
423	NC_013162	TA	3	6	19387	19392	50 %	50 %	0 %	0 %	256818865
424	NC_013162	CAA	2	6	19425	19430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818865
425	NC_013162	TTAAT	2	10	19464	19473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_013162	AG	3	6	19507	19512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
427	NC_013162	A	7	7	19528	19534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_013162	TGA	2	6	19566	19571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_013162	TAT	2	6	19576	19581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818866
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431	NC_013162	AAAG	2	8	19653	19660	75 %	0 %	25 %	0 %	256818866
432	NC_013162	TTTC	2	8	19753	19760	0 %	75 %	0 %	25 %	256818866
433	NC_013162	A	7	7	19773	19779	100 %	0 %	0 %	0 %	256818866
434	NC_013162	AGGG	2	8	20127	20134	25 %	0 %	75 %	0 %	256818866
435	NC_013162	TCA	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818866
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438	NC_013162	TTC	2	6	20262	20267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818866
439	NC_013162	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_013162	A	7	7	20353	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_013162	AT	3	6	20392	20397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_013162	CTA	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_013162	TTA	2	6	20492	20497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818867
444	NC_013162	GCTT	2	8	20592	20599	0 %	50 %	25 %	25 %	256818867
445	NC_013162	CTTT	2	8	20607	20614	0 %	75 %	0 %	25 %	256818867
446	NC_013162	GGA	2	6	20635	20640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818867
447	NC_013162	ACC	2	6	20714	20719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818867
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449	NC_013162	TTGA	2	8	20765	20772	25 %	50 %	25 %	0 %	256818867
450	NC_013162	ATC	2	6	20786	20791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818867
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456	NC_013162	CGATA	2	10	20993	21002	40 %	20 %	20 %	20 %	256818867
457	NC_013162	CAA	3	9	21011	21019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818867
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465	NC_013162	GGCT	2	8	21662	21669	0 %	25 %	50 %	25 %	256818867
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475	NC_013162	ACG	2	6	22524	22529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_013162	ATAA	2	8	22554	22561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_013162	ATG	2	6	22617	22622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_013162	GAAC	2	8	22728	22735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_013162	GAA	2	6	22765	22770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_013162	GTT	2	6	22875	22880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_013162	ATT	2	6	22992	22997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_013162	A	6	6	23222	23227	100 %	0 %	0 %	0 %	256818868
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497	NC_013162	TAT	2	6	23317	23322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818868
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