MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013161	TTCGG	2	10	194186	194195	0 %	40 %	40 %	20 %	257058113
4002	NC_013161	ATA	2	6	194201	194206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058113
4003	NC_013161	CTC	2	6	194235	194240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058113
4004	NC_013161	TTCC	2	8	194340	194347	0 %	50 %	0 %	50 %	257058113
4005	NC_013161	AAT	2	6	194374	194379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058113
4006	NC_013161	TCAA	2	8	194411	194418	50 %	25 %	0 %	25 %	257058113
4007	NC_013161	C	7	7	194455	194461	0 %	0 %	0 %	100 %	257058113
4008	NC_013161	GTCG	2	8	194612	194619	0 %	25 %	50 %	25 %	257058113
4009	NC_013161	TC	3	6	194646	194651	0 %	50 %	0 %	50 %	257058113
4010	NC_013161	TCA	2	6	194675	194680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058113
4011	NC_013161	TGG	2	6	194696	194701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058113
4012	NC_013161	TTGA	2	8	194722	194729	25 %	50 %	25 %	0 %	257058113
4013	NC_013161	TTG	2	6	194809	194814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058113
4014	NC_013161	T	6	6	194832	194837	0 %	100 %	0 %	0 %	257058113
4015	NC_013161	GTC	2	6	194896	194901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_013161	T	10	10	194914	194923	0 %	100 %	0 %	0 %	257058114
4017	NC_013161	TCT	2	6	194926	194931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058114
4018	NC_013161	AGA	2	6	194967	194972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058114
4019	NC_013161	GCT	2	6	194986	194991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058114
4020	NC_013161	AAG	2	6	195053	195058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058114
4021	NC_013161	TGC	2	6	195067	195072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058114
4022	NC_013161	TTG	2	6	195098	195103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058114
4023	NC_013161	TTTTA	2	10	195130	195139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013161	GAA	2	6	195194	195199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058115
4025	NC_013161	TAAG	2	8	195206	195213	50 %	25 %	25 %	0 %	257058115
4026	NC_013161	C	6	6	195229	195234	0 %	0 %	0 %	100 %	257058115
4027	NC_013161	GCT	2	6	195252	195257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
4028	NC_013161	A	6	6	195264	195269	100 %	0 %	0 %	0 %	257058115
4029	NC_013161	GAC	2	6	195289	195294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058115
4030	NC_013161	CTC	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058115
4031	NC_013161	GTG	2	6	195363	195368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058115
4032	NC_013161	TAA	2	6	195371	195376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058115
4033	NC_013161	ATC	2	6	195402	195407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
4034	NC_013161	CTG	2	6	195440	195445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
4035	NC_013161	AAC	2	6	195483	195488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058115
4036	NC_013161	CCA	2	6	195507	195512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058115
4037	NC_013161	ACT	2	6	195659	195664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
4038	NC_013161	GCT	2	6	195738	195743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058115
4039	NC_013161	CTA	2	6	195745	195750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058115
4040	NC_013161	C	6	6	195794	195799	0 %	0 %	0 %	100 %	257058115
4041	NC_013161	ATA	2	6	195880	195885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058115
4042	NC_013161	CGG	2	6	195895	195900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058115
4043	NC_013161	ATT	2	6	196073	196078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
4044	NC_013161	ACG	2	6	196120	196125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
4045	NC_013161	CAA	2	6	196163	196168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058116
4046	NC_013161	CTA	2	6	196248	196253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058116
4047	NC_013161	AGA	3	9	196267	196275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058116
4048	NC_013161	CG	3	6	196316	196321	0 %	0 %	50 %	50 %	257058116
4049	NC_013161	ATGTTA	2	12	196487	196498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257058116
4050	NC_013161	A	6	6	196527	196532	100 %	0 %	0 %	0 %	257058116
4051	NC_013161	TCG	2	6	196533	196538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058116
4052	NC_013161	CCT	2	6	196547	196552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058116
4053	NC_013161	AGGG	2	8	196561	196568	25 %	0 %	75 %	0 %	257058116
4054	NC_013161	TC	3	6	196580	196585	0 %	50 %	0 %	50 %	257058116
4055	NC_013161	GCG	2	6	196646	196651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058116
4056	NC_013161	CGGAA	2	10	196660	196669	40 %	0 %	40 %	20 %	257058116
4057	NC_013161	CCG	2	6	196764	196769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058116
4058	NC_013161	AGC	2	6	196819	196824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
4059	NC_013161	ATTG	2	8	196834	196841	25 %	50 %	25 %	0 %	257058116
4060	NC_013161	CAG	2	6	196863	196868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058116
4061	NC_013161	TTA	2	6	196871	196876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
4062	NC_013161	CAGT	2	8	196909	196916	25 %	25 %	25 %	25 %	257058116
4063	NC_013161	GCAA	2	8	196953	196960	50 %	0 %	25 %	25 %	257058116
4064	NC_013161	ATT	2	6	196994	196999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
4065	NC_013161	AAC	2	6	197102	197107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058116
4066	NC_013161	TTA	2	6	197120	197125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058116
4067	NC_013161	AAAC	2	8	197285	197292	75 %	0 %	0 %	25 %	257058116
4068	NC_013161	GAA	2	6	197315	197320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058116
4069	NC_013161	CTTG	2	8	197394	197401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_013161	AGA	2	6	197457	197462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
4071	NC_013161	TGC	2	6	197465	197470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4072	NC_013161	GAAC	2	8	197523	197530	50 %	0 %	25 %	25 %	257058117
4073	NC_013161	AAT	2	6	197610	197615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058117
4074	NC_013161	TA	4	8	197624	197631	50 %	50 %	0 %	0 %	257058117
4075	NC_013161	TCA	2	6	197732	197737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
4076	NC_013161	TA	3	6	197806	197811	50 %	50 %	0 %	0 %	257058117
4077	NC_013161	TCC	2	6	197967	197972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058117
4078	NC_013161	CCT	2	6	198040	198045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058117
4079	NC_013161	CAT	2	6	198067	198072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
4080	NC_013161	TATT	2	8	198140	198147	25 %	75 %	0 %	0 %	257058117
4081	NC_013161	TGA	2	6	198180	198185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
4082	NC_013161	AGC	2	6	198201	198206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4083	NC_013161	GAA	2	6	198211	198216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
4084	NC_013161	T	6	6	198276	198281	0 %	100 %	0 %	0 %	257058117
4085	NC_013161	ACG	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4086	NC_013161	GTC	2	6	198334	198339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4087	NC_013161	ATCA	2	8	198371	198378	50 %	25 %	0 %	25 %	257058117
4088	NC_013161	TGA	2	6	198465	198470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
4089	NC_013161	CTG	2	6	198524	198529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4090	NC_013161	TCG	2	6	198540	198545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4091	NC_013161	ACC	2	6	198554	198559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058117
4092	NC_013161	AGC	2	6	198576	198581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058117
4093	NC_013161	TTA	2	6	198638	198643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058117
4094	NC_013161	ATC	2	6	198651	198656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058117
4095	NC_013161	TTC	2	6	198662	198667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058117
4096	NC_013161	T	6	6	198668	198673	0 %	100 %	0 %	0 %	257058117
4097	NC_013161	TTGT	2	8	198710	198717	0 %	75 %	25 %	0 %	257058117
4098	NC_013161	GAT	2	6	198739	198744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058117
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4100	NC_013161	GAA	2	6	198820	198825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058117
4101	NC_013161	TTAA	2	8	198963	198970	50 %	50 %	0 %	0 %	257058118
4102	NC_013161	TGA	2	6	199010	199015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058118
4103	NC_013161	TAA	2	6	199024	199029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4104	NC_013161	TCC	2	6	199123	199128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058118
4105	NC_013161	TAA	2	6	199135	199140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4106	NC_013161	AATC	2	8	199161	199168	50 %	25 %	0 %	25 %	257058118
4107	NC_013161	AATATT	2	12	199213	199224	50 %	50 %	0 %	0 %	257058118
4108	NC_013161	TCT	2	6	199235	199240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058118
4109	NC_013161	TTC	2	6	199276	199281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058118
4110	NC_013161	CTT	3	9	199299	199307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058118
4111	NC_013161	AAT	2	6	199318	199323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4112	NC_013161	A	6	6	199352	199357	100 %	0 %	0 %	0 %	257058118
4113	NC_013161	TCA	2	6	199376	199381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058118
4114	NC_013161	AGA	2	6	199393	199398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058118
4115	NC_013161	AAAT	2	8	199441	199448	75 %	25 %	0 %	0 %	257058118
4116	NC_013161	GGA	2	6	199499	199504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058118
4117	NC_013161	CCT	2	6	199517	199522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058118
4118	NC_013161	TAA	3	9	199536	199544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4119	NC_013161	GCT	2	6	199568	199573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058118
4120	NC_013161	TGGC	2	8	199578	199585	0 %	25 %	50 %	25 %	257058118
4121	NC_013161	TAATA	2	10	199599	199608	60 %	40 %	0 %	0 %	257058118
4122	NC_013161	TAA	3	9	199653	199661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4123	NC_013161	T	7	7	199720	199726	0 %	100 %	0 %	0 %	257058118
4124	NC_013161	TAA	2	6	199798	199803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058118
4125	NC_013161	AG	3	6	199828	199833	50 %	0 %	50 %	0 %	257058118
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4129	NC_013161	TC	3	6	199907	199912	0 %	50 %	0 %	50 %	257058118
4130	NC_013161	AACG	2	8	199997	200004	50 %	0 %	25 %	25 %	257058118
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4134	NC_013161	ATG	2	6	200150	200155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_013161	T	6	6	200165	200170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_013161	ATA	2	6	200239	200244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_013161	TTTA	2	8	200254	200261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_013161	TTG	2	6	200284	200289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_013161	T	7	7	200329	200335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_013161	ATC	2	6	200340	200345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_013161	T	6	6	200363	200368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_013161	CCT	2	6	200387	200392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058119
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4163	NC_013161	T	6	6	201607	201612	0 %	100 %	0 %	0 %	257058119
4164	NC_013161	TTGAC	2	10	201635	201644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4165	NC_013161	CTAT	2	8	201800	201807	25 %	50 %	0 %	25 %	257058120
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4240	NC_013161	CAAT	2	8	204940	204947	50 %	25 %	0 %	25 %	257058124
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4244	NC_013161	T	8	8	205038	205045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_013161	TAT	3	9	205060	205068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_013161	ATT	2	6	205117	205122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_013161	A	6	6	205153	205158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_013161	T	6	6	205198	205203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_013161	CTTGA	2	10	205225	205234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4250	NC_013161	ATG	2	6	205435	205440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_013161	TTG	2	6	205548	205553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_013161	TAA	2	6	205577	205582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_013161	C	6	6	205657	205662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4254	NC_013161	C	6	6	205666	205671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4255	NC_013161	GTA	2	6	205756	205761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4375	NC_013161	ATA	2	6	210114	210119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_013161	ACG	2	6	210150	210155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4377	NC_013161	AC	3	6	210197	210202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4378	NC_013161	ACT	2	6	210209	210214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4379	NC_013161	AGAA	2	8	210248	210255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_013161	TA	3	6	210256	210261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_013161	AAGT	2	8	210277	210284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4382	NC_013161	CA	3	6	210332	210337	50 %	0 %	0 %	50 %	257058130
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4386	NC_013161	AGCTA	2	10	210775	210784	40 %	20 %	20 %	20 %	257058130
4387	NC_013161	ACC	2	6	210911	210916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058130
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4407	NC_013161	CTATTA	2	12	212019	212030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	257058131
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4500	NC_013161	ATCA	2	8	216442	216449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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