MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013161	TAA	2	6	169693	169698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058082
3502	NC_013161	ATC	2	6	169706	169711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058082
3503	NC_013161	AG	3	6	169844	169849	50 %	0 %	50 %	0 %	257058082
3504	NC_013161	TTGC	2	8	169857	169864	0 %	50 %	25 %	25 %	257058082
3505	NC_013161	AGA	2	6	169867	169872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058082
3506	NC_013161	TGG	2	6	169896	169901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058082
3507	NC_013161	TGA	2	6	169931	169936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013161	TTAA	2	8	169960	169967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013161	TTAG	2	8	169971	169978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013161	A	6	6	170009	170014	100 %	0 %	0 %	0 %	257058083
3511	NC_013161	ATA	2	6	170038	170043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058083
3512	NC_013161	ATT	2	6	170047	170052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058083
3513	NC_013161	ATTT	2	8	170066	170073	25 %	75 %	0 %	0 %	257058083
3514	NC_013161	AAT	2	6	170079	170084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058083
3515	NC_013161	AGA	2	6	170097	170102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058083
3516	NC_013161	AAG	2	6	170126	170131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058083
3517	NC_013161	GAA	2	6	170155	170160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058083
3518	NC_013161	ATGA	2	8	170189	170196	50 %	25 %	25 %	0 %	257058083
3519	NC_013161	AAATT	2	10	170197	170206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013161	ATTG	2	8	170313	170320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013161	A	7	7	170324	170330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013161	GAATAG	2	12	170377	170388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013161	ATA	2	6	170398	170403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013161	TAT	2	6	170405	170410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013161	T	6	6	170448	170453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_013161	ATT	2	6	170459	170464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013161	TCG	2	6	170521	170526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058084
3528	NC_013161	TCT	2	6	170569	170574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058084
3529	NC_013161	TTGG	2	8	170621	170628	0 %	50 %	50 %	0 %	257058084
3530	NC_013161	TTGAA	2	10	170644	170653	40 %	40 %	20 %	0 %	257058084
3531	NC_013161	TCT	2	6	170899	170904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058085
3532	NC_013161	TCA	2	6	170916	170921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058085
3533	NC_013161	AGG	2	6	170922	170927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058085
3534	NC_013161	AGC	2	6	170930	170935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058085
3535	NC_013161	ATT	2	6	171038	171043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013161	ACG	2	6	171063	171068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013161	GA	3	6	171142	171147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013161	GAG	2	6	171160	171165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013161	AAC	3	9	171263	171271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058086
3540	NC_013161	ATA	2	6	171300	171305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058086
3541	NC_013161	GCT	2	6	171308	171313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058086
3542	NC_013161	T	6	6	171340	171345	0 %	100 %	0 %	0 %	257058086
3543	NC_013161	TAG	2	6	171376	171381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058086
3544	NC_013161	CA	3	6	171392	171397	50 %	0 %	0 %	50 %	257058086
3545	NC_013161	ACC	2	6	171398	171403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058087
3546	NC_013161	TCT	2	6	171422	171427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058087
3547	NC_013161	GACA	2	8	171430	171437	50 %	0 %	25 %	25 %	257058087
3548	NC_013161	CTT	2	6	171477	171482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058087
3549	NC_013161	CTT	2	6	171501	171506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058087
3550	NC_013161	TTC	2	6	171510	171515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058087
3551	NC_013161	TA	3	6	171576	171581	50 %	50 %	0 %	0 %	257058087
3552	NC_013161	ACG	2	6	171727	171732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013161	ACGC	2	8	171877	171884	25 %	0 %	25 %	50 %	257058088
3554	NC_013161	CCA	2	6	171889	171894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058088
3555	NC_013161	CTC	3	9	171896	171904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058088
3556	NC_013161	ATG	2	6	172029	172034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058088
3557	NC_013161	ATG	2	6	172229	172234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058088
3558	NC_013161	AGTTCA	2	12	172323	172334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257058088
3559	NC_013161	GGC	2	6	172352	172357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058088
3560	NC_013161	GTG	2	6	172392	172397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058088
3561	NC_013161	CAA	2	6	172423	172428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058088
3562	NC_013161	T	6	6	172519	172524	0 %	100 %	0 %	0 %	257058088
3563	NC_013161	CCTG	2	8	172525	172532	0 %	25 %	25 %	50 %	257058088
3564	NC_013161	ACC	2	6	172782	172787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058088
3565	NC_013161	GGAG	2	8	172963	172970	25 %	0 %	75 %	0 %	257058088
3566	NC_013161	GTA	2	6	173022	173027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058088
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3568	NC_013161	CAG	2	6	173044	173049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_013161	ACA	2	6	173088	173093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013161	TGA	2	6	173096	173101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013161	AAT	2	6	173191	173196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013161	T	6	6	173351	173356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013161	ACA	2	6	173503	173508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058089
3574	NC_013161	CATAC	2	10	173637	173646	40 %	20 %	0 %	40 %	257058089
3575	NC_013161	CGC	2	6	173754	173759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058089
3576	NC_013161	CGAC	2	8	173824	173831	25 %	0 %	25 %	50 %	257058089
3577	NC_013161	GACGGG	2	12	173837	173848	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	257058089
3578	NC_013161	GGGAT	2	10	173857	173866	20 %	20 %	60 %	0 %	257058089
3579	NC_013161	TGA	2	6	173879	173884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058089
3580	NC_013161	CCTG	2	8	173926	173933	0 %	25 %	25 %	50 %	257058089
3581	NC_013161	GTA	2	6	174066	174071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058089
3582	NC_013161	TGG	2	6	174272	174277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058089
3583	NC_013161	CGA	2	6	174364	174369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058089
3584	NC_013161	AT	3	6	174379	174384	50 %	50 %	0 %	0 %	257058089
3585	NC_013161	TCATTT	2	12	174434	174445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257058089
3586	NC_013161	CGAT	2	8	174457	174464	25 %	25 %	25 %	25 %	257058089
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3588	NC_013161	AAAT	2	8	174549	174556	75 %	25 %	0 %	0 %	257058089
3589	NC_013161	CAA	2	6	174617	174622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058089
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3591	NC_013161	T	6	6	174720	174725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013161	AAC	2	6	174748	174753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_013161	TAA	2	6	174769	174774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013161	AATTT	2	10	174815	174824	40 %	60 %	0 %	0 %	257058090
3595	NC_013161	TCG	2	6	174839	174844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058090
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3598	NC_013161	CAG	2	6	174971	174976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058090
3599	NC_013161	A	6	6	175001	175006	100 %	0 %	0 %	0 %	257058090
3600	NC_013161	ATCTT	2	10	175052	175061	20 %	60 %	0 %	20 %	257058090
3601	NC_013161	TAT	2	6	175080	175085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058090
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3603	NC_013161	GCT	2	6	175153	175158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058090
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3605	NC_013161	CTTTTT	2	12	175209	175220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257058090
3606	NC_013161	CTT	2	6	175236	175241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058090
3607	NC_013161	TAA	2	6	175261	175266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058090
3608	NC_013161	AAT	2	6	175270	175275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058090
3609	NC_013161	ATA	2	6	175291	175296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058090
3610	NC_013161	GTT	2	6	175311	175316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058090
3611	NC_013161	AGAT	2	8	175405	175412	50 %	25 %	25 %	0 %	257058090
3612	NC_013161	AAT	2	6	175452	175457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058091
3613	NC_013161	T	7	7	175592	175598	0 %	100 %	0 %	0 %	257058091
3614	NC_013161	CTT	2	6	175611	175616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058091
3615	NC_013161	A	7	7	175627	175633	100 %	0 %	0 %	0 %	257058091
3616	NC_013161	T	7	7	175639	175645	0 %	100 %	0 %	0 %	257058091
3617	NC_013161	GATT	2	8	175646	175653	25 %	50 %	25 %	0 %	257058091
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3620	NC_013161	AG	3	6	175726	175731	50 %	0 %	50 %	0 %	257058091
3621	NC_013161	AAAT	2	8	175739	175746	75 %	25 %	0 %	0 %	257058091
3622	NC_013161	TTAG	2	8	175780	175787	25 %	50 %	25 %	0 %	257058091
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3624	NC_013161	TTGTT	2	10	175839	175848	0 %	80 %	20 %	0 %	257058091
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3626	NC_013161	TTTAC	2	10	175897	175906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3751	NC_013161	GCT	2	6	181908	181913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058099
3752	NC_013161	AGC	2	6	181931	181936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058099
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3765	NC_013161	AGT	2	6	182453	182458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058099
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3767	NC_013161	GAT	2	6	182553	182558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058099
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3773	NC_013161	T	7	7	182832	182838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3774	NC_013161	AT	3	6	182848	182853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3775	NC_013161	T	6	6	182871	182876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3776	NC_013161	A	7	7	182925	182931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3778	NC_013161	A	6	6	182974	182979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3794	NC_013161	A	7	7	183669	183675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3838	NC_013161	ATC	2	6	186241	186246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3845	NC_013161	CT	3	6	186566	186571	0 %	50 %	0 %	50 %	257058103
3846	NC_013161	TATTT	2	10	186580	186589	20 %	80 %	0 %	0 %	257058103
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3853	NC_013161	TGGTG	2	10	186957	186966	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3854	NC_013161	TGA	2	6	186976	186981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058104
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3867	NC_013161	AATTA	2	10	187697	187706	60 %	40 %	0 %	0 %	257058105
3868	NC_013161	GATAG	2	10	187787	187796	40 %	20 %	40 %	0 %	257058105
3869	NC_013161	AAC	2	6	187847	187852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058105
3870	NC_013161	A	6	6	187860	187865	100 %	0 %	0 %	0 %	257058105
3871	NC_013161	GTTT	2	8	187899	187906	0 %	75 %	25 %	0 %	257058105
3872	NC_013161	AAATA	2	10	187938	187947	80 %	20 %	0 %	0 %	257058105
3873	NC_013161	GTCC	2	8	187989	187996	0 %	25 %	25 %	50 %	257058105
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