MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013161	GAT	2	6	145686	145691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058055
3002	NC_013161	TGG	2	6	145712	145717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058055
3003	NC_013161	GCA	2	6	145746	145751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058055
3004	NC_013161	G	6	6	145762	145767	0 %	0 %	100 %	0 %	257058055
3005	NC_013161	ATT	2	6	145768	145773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058055
3006	NC_013161	GGT	2	6	146004	146009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058055
3007	NC_013161	CAAT	2	8	146037	146044	50 %	25 %	0 %	25 %	257058055
3008	NC_013161	ATTG	2	8	146076	146083	25 %	50 %	25 %	0 %	257058055
3009	NC_013161	AGTT	2	8	146170	146177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013161	TGAT	2	8	146258	146265	25 %	50 %	25 %	0 %	257058056
3011	NC_013161	ATA	2	6	146317	146322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058056
3012	NC_013161	GCCAT	2	10	146353	146362	20 %	20 %	20 %	40 %	257058056
3013	NC_013161	TAG	2	6	146503	146508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058056
3014	NC_013161	GAG	2	6	146560	146565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058056
3015	NC_013161	TCA	2	6	146639	146644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058056
3016	NC_013161	TAA	2	6	146662	146667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058056
3017	NC_013161	ATT	2	6	146756	146761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058057
3018	NC_013161	A	8	8	146808	146815	100 %	0 %	0 %	0 %	257058057
3019	NC_013161	TAA	2	6	146825	146830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058057
3020	NC_013161	A	6	6	146878	146883	100 %	0 %	0 %	0 %	257058057
3021	NC_013161	CAAA	2	8	146897	146904	75 %	0 %	0 %	25 %	257058057
3022	NC_013161	CGAT	2	8	146908	146915	25 %	25 %	25 %	25 %	257058057
3023	NC_013161	AAAT	2	8	146939	146946	75 %	25 %	0 %	0 %	257058057
3024	NC_013161	ACC	2	6	146979	146984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058057
3025	NC_013161	CCA	2	6	146985	146990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058057
3026	NC_013161	A	7	7	147057	147063	100 %	0 %	0 %	0 %	257058057
3027	NC_013161	ACT	2	6	147138	147143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058057
3028	NC_013161	AAT	2	6	147180	147185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058057
3029	NC_013161	A	8	8	147209	147216	100 %	0 %	0 %	0 %	257058057
3030	NC_013161	T	8	8	147220	147227	0 %	100 %	0 %	0 %	257058057
3031	NC_013161	TAA	2	6	147277	147282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013161	TTAAT	2	10	147292	147301	40 %	60 %	0 %	0 %	257058058
3033	NC_013161	CA	3	6	147342	147347	50 %	0 %	0 %	50 %	257058058
3034	NC_013161	AAT	2	6	147348	147353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058058
3035	NC_013161	AAT	2	6	147383	147388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058058
3036	NC_013161	GTT	2	6	147424	147429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058058
3037	NC_013161	CA	3	6	147467	147472	50 %	0 %	0 %	50 %	257058058
3038	NC_013161	AAT	2	6	147608	147613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058058
3039	NC_013161	ACC	2	6	147618	147623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058058
3040	NC_013161	A	7	7	147658	147664	100 %	0 %	0 %	0 %	257058058
3041	NC_013161	T	6	6	147694	147699	0 %	100 %	0 %	0 %	257058058
3042	NC_013161	CAA	2	6	147717	147722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058058
3043	NC_013161	TGT	2	6	147772	147777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058058
3044	NC_013161	TAA	2	6	147834	147839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058058
3045	NC_013161	ATT	2	6	147847	147852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058058
3046	NC_013161	TGG	2	6	148009	148014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058059
3047	NC_013161	GTT	2	6	148025	148030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058059
3048	NC_013161	AGCAT	2	10	148046	148055	40 %	20 %	20 %	20 %	257058059
3049	NC_013161	TTG	2	6	148129	148134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058059
3050	NC_013161	GAG	2	6	148228	148233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058059
3051	NC_013161	CCCATG	2	12	148307	148318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257058059
3052	NC_013161	CCG	2	6	148322	148327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058059
3053	NC_013161	GCT	2	6	148346	148351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058059
3054	NC_013161	GCA	2	6	148507	148512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058059
3055	NC_013161	CGG	2	6	148530	148535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058059
3056	NC_013161	CTGA	2	8	148609	148616	25 %	25 %	25 %	25 %	257058059
3057	NC_013161	ACTG	2	8	148724	148731	25 %	25 %	25 %	25 %	257058059
3058	NC_013161	CAA	2	6	148808	148813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058059
3059	NC_013161	GCT	2	6	148832	148837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058059
3060	NC_013161	ATA	2	6	148842	148847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058059
3061	NC_013161	GGTCAG	2	12	148876	148887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257058059
3062	NC_013161	GAT	2	6	148918	148923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058059
3063	NC_013161	T	6	6	148923	148928	0 %	100 %	0 %	0 %	257058059
3064	NC_013161	GAA	2	6	148998	149003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058059
3065	NC_013161	AAT	2	6	149092	149097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013161	TCTT	3	12	149131	149142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_013161	GATT	2	8	149223	149230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013161	AGG	2	6	149257	149262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013161	ACT	2	6	149335	149340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058060
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3071	NC_013161	TCC	2	6	149415	149420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058060
3072	NC_013161	TAC	2	6	149460	149465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058060
3073	NC_013161	ACA	2	6	149501	149506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058060
3074	NC_013161	GAA	2	6	149519	149524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058060
3075	NC_013161	TCA	2	6	149559	149564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058060
3076	NC_013161	ATGAAC	2	12	149653	149664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257058060
3077	NC_013161	TCTAA	2	10	149796	149805	40 %	40 %	0 %	20 %	257058060
3078	NC_013161	TAG	2	6	149806	149811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013161	A	7	7	149843	149849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013161	ATGA	2	8	149874	149881	50 %	25 %	25 %	0 %	257058061
3081	NC_013161	ACAA	2	8	149962	149969	75 %	0 %	0 %	25 %	257058061
3082	NC_013161	AGA	2	6	149972	149977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058061
3083	NC_013161	ATT	2	6	150084	150089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058061
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3085	NC_013161	ATA	2	6	150168	150173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013161	TTA	2	6	150310	150315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058062
3087	NC_013161	TAA	2	6	150357	150362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058062
3088	NC_013161	ATT	2	6	150376	150381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058062
3089	NC_013161	ATT	2	6	150401	150406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058062
3090	NC_013161	TGA	2	6	150591	150596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058062
3091	NC_013161	TAAGC	2	10	150681	150690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3092	NC_013161	TCA	2	6	150694	150699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_013161	ATA	2	6	150762	150767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058063
3094	NC_013161	TCT	2	6	150781	150786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058063
3095	NC_013161	CAT	2	6	150836	150841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058063
3096	NC_013161	CATT	2	8	150920	150927	25 %	50 %	0 %	25 %	257058063
3097	NC_013161	TCTT	2	8	150942	150949	0 %	75 %	0 %	25 %	257058063
3098	NC_013161	T	6	6	150959	150964	0 %	100 %	0 %	0 %	257058063
3099	NC_013161	ATT	2	6	151012	151017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058063
3100	NC_013161	T	7	7	151016	151022	0 %	100 %	0 %	0 %	257058063
3101	NC_013161	TTGA	2	8	151070	151077	25 %	50 %	25 %	0 %	257058064
3102	NC_013161	CAT	2	6	151078	151083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058064
3103	NC_013161	TG	3	6	151122	151127	0 %	50 %	50 %	0 %	257058064
3104	NC_013161	AAAG	2	8	151139	151146	75 %	0 %	25 %	0 %	257058064
3105	NC_013161	AAGAC	2	10	151206	151215	60 %	0 %	20 %	20 %	257058064
3106	NC_013161	AAG	2	6	151261	151266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058064
3107	NC_013161	T	6	6	151297	151302	0 %	100 %	0 %	0 %	257058064
3108	NC_013161	T	7	7	151308	151314	0 %	100 %	0 %	0 %	257058064
3109	NC_013161	CAG	2	6	151315	151320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058064
3110	NC_013161	AAT	2	6	151322	151327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058064
3111	NC_013161	T	6	6	151327	151332	0 %	100 %	0 %	0 %	257058064
3112	NC_013161	ACAT	2	8	151347	151354	50 %	25 %	0 %	25 %	257058064
3113	NC_013161	ATC	2	6	151385	151390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058064
3114	NC_013161	T	6	6	151421	151426	0 %	100 %	0 %	0 %	257058064
3115	NC_013161	TTA	2	6	151473	151478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_013161	TTTA	2	8	151529	151536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_013161	A	8	8	151600	151607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013161	CCT	2	6	151611	151616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_013161	GTA	2	6	151643	151648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013161	CA	3	6	151742	151747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_013161	T	6	6	151768	151773	0 %	100 %	0 %	0 %	257058065
3122	NC_013161	T	6	6	151777	151782	0 %	100 %	0 %	0 %	257058065
3123	NC_013161	CAC	2	6	151803	151808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058065
3124	NC_013161	GCA	2	6	151820	151825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058065
3125	NC_013161	CAG	2	6	151857	151862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058065
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3127	NC_013161	ATT	2	6	152008	152013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058065
3128	NC_013161	ATG	2	6	152024	152029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058065
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3134	NC_013161	GTA	2	6	152183	152188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058065
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3142	NC_013161	CCAT	2	8	152443	152450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3143	NC_013161	ACCC	2	8	152607	152614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3144	NC_013161	TAAT	2	8	152629	152636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_013161	GTT	2	6	152687	152692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058066
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3152	NC_013161	ATT	2	6	152998	153003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3244	NC_013161	CAAC	3	12	158199	158210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3245	NC_013161	TTGT	2	8	158211	158218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_013161	TAT	2	6	158223	158228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_013161	TAA	2	6	158229	158234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_013161	CTT	2	6	158285	158290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_013161	AATT	2	8	158333	158340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_013161	TAT	2	6	158410	158415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_013161	TGT	2	6	168084	168089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3480	NC_013161	TTC	2	6	168439	168444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058079
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3486	NC_013161	ATCTTT	2	12	168831	168842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	257058081
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3489	NC_013161	TAT	2	6	168939	168944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058081
3490	NC_013161	AGGT	2	8	168952	168959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_013161	AG	3	6	168988	168993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_013161	ACG	2	6	169041	169046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_013161	CAT	2	6	169163	169168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_013161	TCA	2	6	169177	169182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_013161	CGC	2	6	169287	169292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3496	NC_013161	TG	4	8	169438	169445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_013161	ACTTA	2	10	169451	169460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3498	NC_013161	TACAA	2	10	169476	169485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3499	NC_013161	TCA	2	6	169551	169556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3500	NC_013161	TCT	2	6	169629	169634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058082

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